开源王炸来了!谷歌开源蛋白质预测模型AlphaFold-3,曾获诺贝尔奖

AlphaFold是用于预测蛋白质的复杂结构的系列模型,而AlphaFold-3是今年5月DeepMind推出的最新版本,其进步在于,除了能根据氨基酸序列预测蛋白结构,还可以预测蛋白质与其它生物分子(包括DNA、RNA等)相互作用产生的复合体的结构。在药物研发领域,AlphaFold-3可以帮助研究人员快速筛选潜在的药物靶点,通过预测靶点蛋白的结构,揭示...

DeepMind开源生物分子预测模型 诺奖成果将掀起AI制药浪潮?

《科创板日报》11月12日讯近日,谷歌旗下人工智能公司DeepMind开源了其曾获诺贝尔奖的药物研发AI模型AlphaFold3。此举意味着,从今以后来自生物医药各个领域的研究者可以免费下载模型代码,自行运行该模型以开展药物研发工作。公开资料显示,谷歌AlphaFold模型可用于预测蛋白质结构和相互作用。而该模型的最新版本AlphaFold3...

王炸开源!谷歌开源诺奖化学模型 Alphafold3

11月12日,谷歌开源了蛋白质预测模型——AlphaFold-3的模型代码和权重供学术用途,以帮助推动科学研究。这一举动有望对全球科研领域产生重大影响。这意味着生物、化学、医药的科学家们可以在本地部署AlphaFold-3,可以极限缩短新药、疫苗等研发进程。公开资料显示,谷歌AlphaFold模型可用于预测蛋白质结构和相互作用。其最新...

AI赢麻了?2024年诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测|科技观察

这一模型能够准确预测蛋白质、DNA、RNA以及配体等生命分子的结构及其相互作用方式，在2??的实验误差内预测了约80%的蛋白质-配体复合物，实现了前所未有的准确度。戴密斯·哈萨比斯和约翰·M·詹伯也因在蛋白质结构预测方面的工作，而获得了2023年生命科学突破奖。没有蛋白质，生命就不可能存在。以往通过实...

开源多结构蛋白质预测大模型——Genie 2

Genie2是在Genie基础之上研发而成,不仅扩展了可设计蛋白质结构空间的广度和多样性,还引入了多模态能力,在蛋白质的预测准确率方面比现有同类模型Chroma、FrameFlow和RFDiffusion等更好。开源地址:httpsgithub/aqlaboratory/genie2论文地址:httpsarxiv/abs/2405.15489...

AI成功改写人类DNA,全球首个基因编辑器震撼开源!近5倍蛋白质宇宙...

Cas9蛋白,是CRISPR-Cas9基因编辑系统的核心组成部分,它是一种RNA引导的核酸酶,可以搜索人类基因组中的所有30亿个核苷酸,并在一个特定位点进行切割(www.e993.com)2024年11月20日。这种核酸酶与单导RNA(sgRNA)复合在一起,sgRNA由一个在结构上与蛋白质相互作用的支架和一个间隔序列组成,后者可通过编程靶向基因组中的任何位点。

单模型斩获「蛋白质突变预测」榜一!西湖大学提出基于结构词表方法...

SaProt的可视化结果非常清晰地将alpha蛋白质和beta蛋白质区分开来,而ESM-2的可视化结果却将两种蛋白质混杂在一起,这说明了SaProt对结构的变化有很强的感知能力。不同结构预测方法的比较除了AF2,目前还存在许多其他的单序列结构预测方法(如ESMFold),因此本文额外测试了其他方法预测出来的结构对SaProt性能的作用。

David Baker:可预测所有生物分子,生成具有高级结构的蛋白质

公开资料显示,AlphaFold是DeepMind推出的蛋白结构预测工具;RoseTTAFold是DavidBaker实验室推出用于预测蛋白质结构的深度神经网络,RFdiffusion则是该实验室推出用于从头构建全新蛋白质的生成式AI工具。这些工具专注于蛋白质的氨基酸构建模块,而非捕获蛋白质如何与其他生物分子相互作用。

AI革新:蛋白质设计新突破,助力癌症与痴呆症研究

除了在蛋白质结构预测领域的显著进展,人工智能(AI)也在蛋白质研究的其他多个方向持续发力,如预测蛋白质与其他生物分子的相互作用、蛋白质设计、蛋白质组学等。展望未来,AI将继续拓展其影响力,填补蛋白质研究领域的诸多空白。

3位牛津本科生学霸,4个月复现AlphaFold 3直接开源

作为生物分子的结构预测模型,AF3主要可以用于三类任务:预测蛋白质结构预测药物-蛋白质相互作用结构预测核酸-蛋白质复合物结构这是结构建模技术的根本进步,整个生物科技行业理应从中受益。其应用范围广泛,包括:CRISPR基因编辑技术:科学家可以准确看到DNA如何与「剪刀」Cas蛋白相互作用...