【单细胞测序系列】只做转录组不做蛋白组,意义少一半?
●第二组表面标志(CD4、CD8A、CD5、HAVCR2、CD40LG、CD27、CD7、GITR和CD40)在健康组中表现出与WTA对应物相反的表达模式,但在其他组中具有相似的表达模式●第三组表面标志(TRDC、CCR7、PTPRC、LAG3、IL2RA、CCR5、PDCD1、PTGDR2、CXCR3、CCR4和IL7R)在恢复组中表现出与WTA对应物相反的表达模式,但在...
震惊!花费几万的测序,结果竟然 90% 数据是「废的」
分别以1??g猪、非洲绿猴、小鼠、人、山羊以及狼的totalRNA做为投入量,测序显示rRNA去除效率均高于98%(图8)。同时,未处理小鼠totalRNA用哺乳动物通用型rRNA去除试剂盒进行rRNA去除流程,数据表现极好的一致性,无脱靶效应。01五、实验结果具有超好的重现性点此展开查看图9|嗜盐...
...Cell|车璇/高绍荣团队合作通过单细胞 RNA 测序结合空间转录组...
通过单细胞RNA测序和空间转录组分析,鉴定了15种细胞类型,揭示了子宫腺肌病子宫不同区域的细胞异质性,特别是子宫内膜肌层交界区的细胞亚群。研究发现,LGR5+细胞在子宫腺肌病病灶中的上皮细胞中显著富集,LGR5是已知的成体干细胞标记物,其在LGR5/WNT信号通路中的作用对于维持组织的正常生理功能至关重要。这一发现...
【陈巍学基因】视频:单个细胞的全基因组 + 转录组 + 细胞表面蛋白...
对19个单个细胞的全基因测序中,可以清楚地看到PIK3CA基因上的SNV(单个碱基的突变),而用Bulk测序方法在这个样本中看不到单个碱基的突变。这充分显示了单个细胞的全基因组测序,在发现存在于单个细胞中的突变上,要更优于Bulk的全基因组测序。2、单个细胞的全mRNA转录组的测序结果这是对活的单个的...
重大发现!从胰腺癌类器官中看转移扩散机制:局部侵袭只是开始
结果发现,这3例患者的类器官转录组均具有间充质表型,但是具有较低的逆圆度分数和较低的侵袭性突起。治疗组的侵袭性类器官和未治疗组的tG1类器官聚类,且治疗组侵袭性和非侵袭性类器官之间的差异基因(DE)和未治疗组中的DE重叠(图4)。图45.在原代PDAC单细胞RNA测序数据中应用类器官的侵袭性转录组特征,发现...
Cell丨“神药”地塞米松,如何挽救重症新冠患者生存率?
1、单细胞转录组测序(scRNA-seq):用于识别地塞米松治疗引起的单核细胞状态的特定变化,并分析其与临床结果的关联(www.e993.com)2024年7月27日。2、质谱流式检测(CyTOF):区分和量化血液中的各类免疫细胞,包括它们的数量和比例,以及它们在地塞米松治疗前后的变化。3、基因富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA):...
成本下跌8个“0”!我的基因我来测,真的行吗?
“人类基因组计划之前,我们期待很多问题会随着测序完成而解决,但现实表明问题不是单纯基因组这一门技术就能解决。”詹启敏坦言,基因组计划已经不断拓展,发展成为涵盖转录组学、蛋白质组学、微生物组学等多个组学的生命组学研究。“如果把人体比作计算机,可以认为底层系统相同,但程序选择和进程不同。打开哪个App,...
人类基因组计划已完成二十年 DNA何时实现“随手测”
“人类基因组计划之前,我们期待很多问题会随着测序完成而解决,但现实表明问题不是单纯基因组这一门技术就能解决。”詹启敏坦言,基因组计划已经不断拓展,发展成为涵盖转录组学、蛋白质组学、微生物组学等多个组学的生命组学研究。“如果把人体比作计算机,可以认为底层系统相同,但程序选择和进程不同。打开哪个App,...
10 社会经纬
有了干事创业的舞台和良好条件,孟开开很快就进入了角色,与科研团队全身心投入到菠萝蜜遗传背景调查,转录组测序,单细胞测序,目前已经取得了新发现.科研单位与人才"双向奔赴"的背后,更加积极有效的人才政策是重要"推手".广西壮族自治区党委把人才发展作为经济社会高质量发展的重要支撑,制定出台一系列"含金...
脑细胞普查:科学家是如何给脑细胞发“身份证”的
1.更侧重于绘制人脑的图谱,整合多种数据模态,并特别关注脑疾病。目前第一阶段的脑细胞普查主要针对小鼠动物模型和健康人脑的部分脑区(比如脑皮层)进行了单细胞转录组测序分析,这相当于建立了基准线,知道正常生理情况下是怎么样的,可用以分析对比生病了的大脑有怎么样的改变。