【单细胞测序系列】只做转录组不做蛋白组,意义少一半?
带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时检测蛋白质和mRNA表达,有助于加深对蛋白质生物学的理解,并加速单细胞研究。40个指标选择意义向上滑动3、RNA捕获、文库、测序三实验结果说明1、mRNAcellmap细胞图谱结果从三类样本健康、COVID-19感染者和康复者收集到的124,726细胞,通过T-SNE做可视化...
突破性技术:基因测序进入私人定制时代
此时,个人基因组测序的结果与疾病发病之间的相关程度不够紧密,因此考克斯等人也希望采集海量的个人数据,分析处理得到单核苷酸多态性(SNP)以与疾病之间建立更加紧密的关系。类似“望闻问切”一样,通过基因的“症状”对个人进行诊断。这也是迈向精准医学的第一步。为了完成人类基因组计划,全球投入了30亿美元。“私人...
存放几十年老样本重见天日:科学家研发单细胞DNA测序法,可用于研究...
近日,他和合作者研发一款高通量单细胞DNA测序方法——“Arc-well”。这是第一个能对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE,Formalin-FixedParaffin-Embedded)组织进行测序的方法,能同时对数千个细胞进行基因拷贝数进行分析,填补了利用单细胞DNA测序对FFPE样本进行大规模基因组分析的空白,使得存放几十年的FFPE样本得以...
Nat Methods | 克服PCR扩增误差:利用同源三聚体核苷酸提高测序...
在高通量测序技术中,PCR扩增是不可避免的步骤,其目的是增加样本的数量以满足测序需求。然而,PCR扩增过程中容易引入错误,包括错配、插入和缺失等,这些错误会直接影响到UMI的准确性和测序结果的可靠性。特别是在需要高度精确的单细胞测序和低丰度样本分析中,PCR错误的影响尤为显著。同源三聚体UMI的错误检测方法为了有...
准确性媲美人类专家,华人学者用ChatGPT对单细胞RNA测序细胞类型...
细胞类型注释是单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析中的基础步骤,这个过程通常是费力且耗时的,需要人类专家将每个细胞簇中高表达的基因与标准的细胞类型标记基因进行比较,这一过程往往需要花费数月之久。虽然已经开发出了自动化的细胞类型注释方法,但使用标记基因的手动注释仍然被广泛使用。
...开发出基于单分子测序平台的scNanoHi-C技术,可精准检测单细胞...
4.scNanoHi-C能够高效辅助单细胞基因组从头组装(www.e993.com)2024年7月28日。在可用细胞数量有限的情况下,该研究表明使用scNanoHi-C辅助单细胞基因组(single-cellwholegenomesequencing,scWGS)从头组装7可以大幅度提高组装质量。例如,使用20个单细胞的基因组长读长测序数据和12个单细胞的scNanoHi-C数据组装的人类基因组支架(scaffold)的NG...
...系列杂志发表十几篇论文,神经与精神疾病单细胞水平研究结果重...
《科学》杂志发表的研究介绍了美国耶鲁大学研究人员领导的项目。团队通过广泛的大脑表型,描述了健康人与神经退行性疾病患者的前额叶皮层单细胞测序。研究结果基于388个个体大脑,可帮助人们评估遗传调控组件与脑部疾病的联系。加州大学洛杉矶分校分析了发育阶段人脑中剪接机制及其所引发的亚型多样性,这一过程与神经精神疾病密...
科学家提出混样拆分新方法,至少能将单细胞测序实验费用降低10倍
后续,他们会继续在单细胞测序的方法学开展研究,以期提高单细胞测序的维度,通过增加可测量参数的种类,深入挖掘生物学过程的信息,更好地为生物医学研究服务。参考资料:1.Lin,X.,Chen,Y.,Lin,L.,Yin,K.,Cheng,R.,Lin,X.,...&Song,J.(2023).mitoSplitter:Amitochondrialvaria...
...清华大学免疫所仪器平台主管分享“流式分选与单细胞测序技术”
在本期小优大学堂·大咖课堂,优宁维特别邀请吴龙妍老师,为大家分享“流式分选与单细胞测序技术”。/吴龙妍/清华大学免疫学研究所仪器平台主管大咖课堂精彩要点回顾1流式分选技术分享2流式分选在单细胞测序技术中的应用3单细胞测序技术简介
IF 82.9!国内团队肿瘤免疫微环境再发力,这波单细胞赢麻了
直播亮点抢先看:1.全面解析单细胞测序技术通过这门课程,您将获得对单细胞技术在肿瘤免疫微环境的全面了解,明确单细胞技术使用的优劣势,且能熟练的完成构建分析思路以及对结果的解读,将为指导相关疾病精准治疗和建立疾病治疗新策略提供重要依据。2.单细胞多组学集成-打破了基于转录组学的细胞类型界定的传统模式...