STM丨汪秀星/张弩合作揭示非经典开放阅读框编码肽段MPEP促GBM恶性...

结果显示MPEP独立于MYC的功能和机制。随后作者将MPEP-GFP转染至细胞内进行活细胞成像,结果显示MPEP可以分泌至细胞外,因此,推测MPEP可能和细胞表面受体结合进而激活其下游通路。蛋白质谱等结果显示MPEP能够与TRKB相互结合。作者随后建立TRKBK.O.细胞并回补TRKB。结果显示MPEP可以独立激活TRKB。基于此,作者随后建立裸鼠原位成...

西南民族大学唐俊妮教授、朱成林博士:金黄色葡萄球菌噬菌体的分离

通过提取噬菌体SP-CmSa-11的核酸进行全基因测序,根据结果绘制基因圈图。如图6所示,噬菌体SP-CmSa-11的基因结构为双链线性DNA分子,基因组全长为45816bp,鸟嘌呤和胞嘧啶含量为27.23%。噬菌体SP-CmSa-11基因组共编码了59个开放阅读框(openreadingframes,ORFs),在预测的59个ORFs中,41个编码的是未知功能的假想蛋...

如何快速批量找到转录本序列的开放阅读框(ORF)

点击第一个或者第二个条目,即进入ORFFinder的页面,如下。在搜索框中输入一段转录本序列,也可以写NCBI的GI号码。在搜索参数部分,还可以设置最小ORF序列长度,遗传密码子一般就选择standard,当然对于原核生物,也可以点开下拉框找到对应的物种类别。起始密码子startcodon一般选择ATGonly,如果想得到尽可能多的ORF也可以...

PLoS Pathog. | 冠状病毒 nsp5 通过切割 POLDIP3 广谱地拮抗宿主...

结果三、敲除POLDIP3的IPEC-J2细胞系构建为了更直接地研究POLDIP3在PDCoV感染中的作用,作者利用CRISPR-Cas9技术构建了POLDIP3基因敲除(KO)IPEC-J2细胞株(POLDIP3-/-)。通过测序和Westernblotting分析确定POLDIP3的敲除效果。通过测序分析,证实了三个POLDIP3KO克隆,POLDIP3编码基因的开放阅读框发生了移位(图3B),通...

关明教授分享甲状腺癌的分子诊断研究进展

2.IncRNA标记物,长度大于200nt的RNA,缺乏明显开放阅读框国外的甲状腺肿瘤的分子诊断——采用多分子联合检测1.ThyGenX/ThyraMIR2.ThyroSeqv2甲状腺肿瘤的分子诊断——多分子联合检测Afirma基因表达分类器(AfirmaGEC)·使用微阵列芯片分析167个甲状腺癌相关基因的表达,(其中142个为甲状腺特异性基因、25个...

Science一周论文导读 | 2020年3月6日

人类非经典开放阅读框的普遍功能性翻译(导读刘奇)经典编码序列(CDSs)外的翻译普遍存在但功能未知(www.e993.com)2024年12月20日。本研究利用基于CRISPR的系统性筛选策略找到数百个对细胞生长至关重要的非经典CDSs。其编码的微蛋白具有不同的细胞定位和特定结合蛋白,在人类淋巴细胞抗原系统中有数百个微蛋白存在。其中多个位于上游开放读码框编码的微...