大模型重构生命科学!最大基础模型面世,解锁DNA超长序列,参数规模...
但它却拥有着海量未标注数据,像基因组数据,蛋白质序列等,这些数据非常适合用来做预训练基础大模型。大模型基于这些数据预训练之后,再结合少数标注过生物实验室数据,学习到对生命系统深层次表征,进而完成像蛋白质结构预测、基因序列分类等下游任务。而百图生科xTrimo系列模型,正是其中最具代表性的范式实践。此次大会...
中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
以下是大多数已发明的16SrRNA基因扩增子测序方法的标准流程:通过一对靶向16SrRNA基因保守区域的通用引物扩增菌群中细菌的16SrRNA基因,并利用高通量测序平台测序获得所有扩增的16SrRNA基因的序列。高通量的16SrRNA基因扩增子测序方法有以下优点:该方法基于16SrRNA基因的扩增,因此可以适用于未培养的细菌或低生物...
...SeekRNA 要掀起 DNA 工程革命:精确切割靶点插入序列
SeekRNA基因编辑工具主要使用一种可编程的核糖核酸(RNA)链,识别基因序列中的特定位点后将自己插入其中。该项目由该大学生命与环境科学学院的SandroAtaide博士领导,相关研究成果已发表在《自然??通讯》(NatureCommunications)上。Ataide博士表示CRISPR是基因工程的行业标准,为医学、农业和生物技术等多个行业...
重大突破!人类基因簇新序列被发现
研究人员表示,一般来说,单个人类蛋白质由单一基因编码,密切相关的蛋白质可能由位于不同染色体位置的不同基因编码。然而,就ELOA3而言,位于同一基因位点的多个基因编码相同的蛋白质这一特征,使其成为一个有趣的研究对象。进一步研究发现,ELOA3基因簇是人类和非人灵长类动物独有的,ELOA3基因重复数因个体和灵长类...
真有“犯罪基因”?它能左右人的善恶吗?
新闻中胎儿的染色体被怀疑为嵌合体,即XY与XYY嵌合,表明是正常的XY性染色体与异常的XYY性染色体嵌合。正常情况下,男性有一条X染色体和一条Y染色体,其中Y是决定男性性别特征的一条关键染色体。当胎儿基因序列中出现两条Y染色体时(性染色体呈现为XYY形态),称为“超雄综合征”。
这种生物的基因组堪称“DNA垃圾山”,而且竟然还在不断增多
显然,如果转座子大规模活跃,甚至插入重要的基因中,将会给“宿主”带来严重的后果(www.e993.com)2024年11月21日。所以在大部分情况下,我们可以看到生物也演化出了一整套防御机制。例如,KRAB型锌指蛋白可以通过识别特定的DNA序列,结合到转座子上,从而在表观遗传学层面沉默转座子。在生殖细胞中,piRNA则通过靶向转座子,形成双链RNA,抵御转...
我收集了全世界老虎的基因,为华南虎理清了家谱
左边是根据线粒体DNA构建的演化树,右边是根据微卫星(microsatellite,一种重复的基因序列,因为在不同的个体间差异很大,常被用于基因检测)构建的演化树。在这两个演化树上,红色的是东北虎,绿色的是苏门答腊虎,蓝色的是孟加拉虎,橙色的是马来虎,黄色的是印支虎,粉红色的是华南虎,这些亚种同一种颜色的“树枝”都出...
【佳学基因检测】家族有狐臭家族史,孩子会隔代遗传到吗?
O***4基因O***4基因编码的是一种嗅觉受体,可以检测到二甲苯硫酚(androstadienone)。这种化合物是汗液中的一个组分,当与皮肤细菌作用时会产生具有“狐臭”气味的化合物。O***4基因的突变会导致对二甲苯硫酚的检测能力下降,无法有效检测到体味,从而感觉不到狐臭。其他还有一些其他基因也被报道与体味相关,如CY...
全球首个核苷酸序列!江苏泰州发现罕见小p血型,我国仅记录10余人
可是你知道吗,有一种血型出现的频率低于百万分之一,这就是小p血型。目前,我国记录在案的小p血型仅有10余人。现代快报记者获悉,泰兴市人民医院输血科主任技师曹国平去年在日常工作血液检测中发现了这一罕见血型,经基因测序,在血型中发现了全球迄今为止尚未发现的一种核苷酸序列,人类基因库分配序列号:OR900206。
突破性技术:基因测序进入私人定制时代
简单来说,传统测序就像如今核酸检测中的“混检”,数万个细胞会展示出某种性质,如基因突变,至于是哪个或哪种细胞贡献的,无从得知。而单细胞测序就类似于核酸检测中的“单检”,一目了然。同时显而易见,单细胞测序面临着如何降低测序时间、节约测序成本、提高测序准确性的考验。