...垂青AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质...
美国科学家DavidBaker获奖,以表彰其在蛋白质计算设计方面的贡献;另一半则共同授予英国科学家DemisHassabis和JohnM.Jumper,以表彰其在蛋白质结构预测方面的贡献。诺奖委员会联系到了DavidBaker,他表示自己非常兴奋,也感到十分荣幸。他认为自己是站在巨人肩膀上取得了这些成果,也感谢了共同奋斗的同事。他相信,A...
因微小RNA获诺奖的科学家和广东有什么缘分
遗传信息从??DNA传递给??RNA,再从RNA传递给蛋白质,完成遗传信息的转录和翻译过程。“但实际上,以哺乳动物为例,其基因中只有1%至2%的区域是编码蛋白质的,其余的部分转录后产生了大量的非编码RNA。”中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员鲍习琛介绍,非编码RNA也被称为基因组中的“暗物质”,它们并不指导蛋白...
天才降落人间:人工智能的“头号玩家”
制药企业、疫苗研发企业以及很多合成生物学企业都在利用AlphaFold2预测或改造新的蛋白质以及和蛋白质结合的分子。2024年5月,DeepMind又推出了AlphaFold3,不但进一步提高了预测精度,还能够预测蛋白质与其他生物分子(如DNA、RNA、小分子配体等)的复合物结构,这标志着AI在生物学领域的应用达到了一个新的高度,为未来的药物...
Nat Methods丨汤富酬组开发出scNanoSeq-CUT&Tag技术,可精准检测单...
H3K4me3主要标记活跃转录基因的启动子区域,标志着基因的激活状态;H3K27ac主要富集在活跃的增强子和启动子区域,与基因的活跃转录相关;H3K36me3主要分布在基因体区域,与基因的转录延伸过程相关,有助于维持基因表达的稳定性;H3K27me3和H3K9me3是抑制性染色质标记,其中H3K27me3主要富集在基因的启动子区域,参与基因沉默...
Nature Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查...
ORFtag是一种多功能、成本效益高且效率高的方法,能够在蛋白质组范围内进行大规模平行标记和功能研究。ORFtag使用含有启动子、选择基因、功能标签和剪接供体序列的逆转录病毒载体。通过大规模转染培养的细胞,ORFtag盒随机整合到基因组中,并通过将功能标签与整合位点下游的剪接受体位点剪接,驱动邻近内源基因座的转录,形成...
...垂青AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质...
不久之后DeepMind推出AlphaFold2,让相关数据库得以覆盖2亿多个结构,几乎涵盖目前已知的所有蛋白质(www.e993.com)2024年10月17日。2023年,Hassabis被《时代》周刊评为“2023年度AI领域最有影响力100人”之一。JohnM.Jumper:用AlphaFold极大减少人工确定蛋白质结构的时间图|JohnM.Jumper(来源:诺奖官网)...
Nature评选今年值得关注的七大科技:蛋白质设计、脑机接口、细胞...
例如,贝克的团队正在用RFdiffusion设计全新的蛋白质,这种蛋白能和目标靶点紧密结合,贝克说,那将是“能与靶点表面完美吻合”的设计。而新一代的“全原子”版本RFdiffusion[5],让用户可以用计算机设计出能够结合DNA、小分子甚至是金属离子等非蛋白靶点的蛋白质。而这些随之而来的多功能性,为酶、转录调节因子、功能性...
...基因组吗?首次由AI从头设计的基因编辑器成功编辑人类细胞中DNA
现在,新的AI技术正在为可编辑DNA的微观生物机制绘制蓝图,这预示着未来科学家将以更高的精度和速度对抗疾病。近日,美国AI蛋白质设计初创公司Profluence推出了OpenCRISPRTM计划,发布了世界上第一个开源的AI生成的基因编辑器。Profluence展示了通过AI从头开始设计的可定制基因编辑器,对人类基因组...
王连荣:在细菌世界寻找她的“珍珠项链”
“噬菌体会把自己的DNA注入细菌,借助细菌生产自己的蛋白质和DNA,最后再把细菌破坏掉,实现自我繁殖。”王连荣解释这一机制具体发生的过程,“硫的加入相当于细菌给自己贴上一个标签,能认出自己的DNA,蛋白质就会选择性地消灭外来的DNA。细菌用这种方式自卫,保护自己不被噬菌体吃掉。”...
Cell | 综述:解密复杂性状的遗传与分子基础
细胞增殖是维持生命过程的基础,遗传变异可能通过影响细胞周期调控蛋白的表达或活性来促进或抑制细胞的增殖。例如,特定的基因变异可能导致肿瘤抑制基因的失活或癌基因的激活,从而导致细胞增殖失控,最终促进肿瘤的形成。肿瘤抑制基因的失活:如TP53基因的突变,可能导致细胞对DNA损伤的响应减弱,增加细胞癌变的风险。