【2024ICBC】学术分会场介绍 | S18 单细胞多组学技术与人类健康 &...

但机体的器官在组成时,不仅仅是有细胞的多样性,还有细胞空间位置的有序分布、基因组层面的转录调控以及蛋白水平的作用等,这些信息在传统的单细胞单组学数据中是无法展现的,因此多种组学技术的综合应用对于我们更完整地认识生命体的发育、工作机制以及疾病发生的机理是十分必要的。

【学术前沿】Cell Metab | 韩敬东课题组开发单细胞水平鉴定与定量...

进一步，在人体组织的单细胞数据上，SenCID结合轨迹重构算法重建了正常个体衰老、慢性疾病和新冠感染等不同生理病理状态下的细胞衰老轨迹，以分析细胞衰老过程中不同阶段的基因表达特征。此外，结合细胞通讯算法，本研究的分析结果还表明，衰老细胞不仅上调SASP基因作用于邻近的其他细胞，造成炎症微环境，而且还产生了许多分...

Cell子刊:韩敬东团队开发机器学习程序,在单细胞水平识别衰老细胞

随着单细胞转录组测序技术的进步,识别和量化单细胞干性的计算工具对于描绘分化树、层次结构及其规则变得至关重要。同样,在单细胞水平上建立一个稳健的衰老识别和量化指标,克服高drop-out率和异质性,将有助于重建细胞衰老轨迹和调控层次,从而更深入地理解衰老。为了解决上述挑战,该研究开发了一种机器学习程序——SenCID...

北京大学汤富酬团队再发文:新的单细胞全基因组测序方法

因此,在单细胞分辨率下研究SVs是至关重要的。基于第三代测序(TGS,也称为单分子测序)平台,近年来开发了转座子插入扩增长片段的单分子实时测序(SMOOTH-seq),利用低密度Tn5转座酶随机片段单个细胞的基因组DNA,实现相对均匀的基因组扩增。除了CNVs和SNVs外,该方法还能有效地检测出结构变异。然而,二倍体细胞中两种等位...

探秘人类四肢发育路径,中大科研团队发布首个人类肢体发育单细胞...

近日，中山大学中山医学院张宏波教授课题组在《自然》杂志（Nature）发表论文，发布了首个人类肢体发育单细胞时空图谱，解析了胎儿四肢的细胞演变路径和细胞空间位置决定过程。该研究为进一步研究肢体发育的详细调节机制、肢体发育异常的细胞生理机制，乃至更广泛的发育和再生过程中细胞命运调节机制和空间位置建成机制提供了...

人类四肢是如何长出来的 中国科学家发布首个人类肢体发育单细胞...

近日,中山大学中山医学院教授张宏波课题组在英国《自然》杂志发表论文,发布了首个人类肢体发育单细胞时空图谱,解析了胎儿四肢的细胞演变路径和细胞空间位置决定过程(www.e993.com)2024年11月9日。该成果为进一步研究肢体发育的详细调节机制、肢体发育异常的细胞生理机制,乃至更广泛的发育和再生过程中细胞命运调节机制和空间位置建成机制提供了重要参考。

2024年1月Cell期刊精华大合集!

CellHint利用机器学习来统一世界各地产生的单细胞数据,使更广泛的研究界能够访问这些数据,从而推动新发现。相关研究结果近期发表在Cell期刊上,论文标题为“Automaticcell-typeharmonizationandintegrationacrossHumanCellAtlasdatasets”。图片来自Cell,2023,doi:10.1016/j.cell.2023.11.026...

...生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

2024年1月23日,军事医学研究院应晓敏团队和伯晓晨团队在NatureBiotechnology期刊发表了题为:Mosaicintegrationandknowledgetransferofsingle-cellmultimodaldatawithMIDAS(利用MIDAS进行单细胞多模态数据的马赛克整合和知识迁移)的研究论文。该研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具...

中大科研团队发布首个人类肢体发育单细胞时空图谱

近日，中山大学中山医学院张宏波教授课题组在《自然》杂志（Nature）发表论文，发布了首个人类肢体发育单细胞时空图谱，解析了胎儿四肢的细胞演变路径和细胞空间位置决定过程。该研究为进一步研究肢体发育的详细调节机制、肢体发育异常的细胞生理机制，乃至更广泛的发育和再生过程中细胞命运调节机制和空间位置建成机制提供了...

实验揭示单细胞变多细胞过程

实验揭示单细胞变多细胞过程1月16日,据美国物理学家组织网报道,5亿多年前,地球表面的单细胞生物开始形成多细胞簇,最终变成了植物和动物.美国明尼苏达大学研究人员在实验室用普通的啤酒酵母菌复制了这一关键进化步骤,演示了这一过渡的发生过程.相关论文发表在近期出版的美国《国家科学院院刊》上.研究人员将啤酒酵母...