科学家研发新型核酸检测系统,无需依赖昂贵蛋白质酶,单次材料成本...
受自然酶和核酸酶的启发,通过实施异构模块(如aptamer、toehold)来设计异构的DNAzyme生物传感器,可以通过小分子、蛋白质、核酸或细菌等,调节因子介导其催化活性。传统的异构DNAzyme生物传感器通常被设计成多组分分子复合体,通过具有toehold的抑制链,来抑制并释放DNAzyme。以及通过在靶结合后分裂并恢复催化...
陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来“玩” | 走近科学
RNA大家族:不只编码蛋白质非编码RNA有哪些种类?这个领域的研究历程大概是怎样的?非编码RNA研究可以分为几个阶段。第一阶段是从20世纪60年代到80年代。这一时期,人们陆续发现了不同类型的持家非编码RNA,例如我们熟悉的核糖体RNA、转运RNA、小核RNA、小核仁RNA等。这些持家非编码RNA在细胞中的含量比较高,而且承...
2023年David Baker团队连发5篇Nature和Science论文,开启AI蛋白质...
:深度学习模型可以预测蛋白质和蛋白质之间的相互作用,从而帮助设计新的蛋白质复合物和抗体。蛋白质功能注释和预测:深度学习可以进行蛋白质功能注释和预测,识别蛋白质的功能域、结构域和功能位点等。这有助于预测蛋白质的功能和相应的生物学作用。蛋白质优化和筛选:深度学习可以用于优化和筛选设计出的蛋白质。通过...
更高准确性,覆盖蛋白等更多分子,DeepMind发布AlphaFold新版本
新版模型AlphaFold-latest(暂称)极大地扩展了应用范围,能够预测包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物的联合结构。这些不同的结构类型和复合物对于理解细胞内的生物机制至关重要。在大多数情况下,AlphaFold-latest比以前的专业工具大大提高了准确性:蛋白质-配体相互作用的准确性优于最先进的对接...
AlphaFold 3重磅发布,开启理解生命的新时代;因气候变化,这里成为...
但这一次,AlphaFold3使用了AI绘画模型中常见的扩散模型,可以直接预测原子的三维坐标,并在多步汇总后构建出精确的分子结构。论文摘要中写道,AlphaFold3能够对包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的蛋白质复合体进行联合结构预测,预测准确性大幅超过任何已有工具。
AlphaFold3:生物分子预测的大一统工具?
为了衡量AF3在预测不同生物分子结构上的表现,研究者分别在蛋白质-配体相互作用、蛋白质-核酸复合体、RNA结构、共价修饰、蛋白复合体四个任务上对AF3的准确性进行了测量(www.e993.com)2024年10月18日。对于蛋白质-配体相互作用预测,AF3在PoseBusters[5]基准数据集上进行测试。在蛋白质-配体相互作用任务上,主要有两类模型:一类仅使用蛋白质序列...
抗衰新希望!J Extracell Vesicles | 细胞凋亡囊泡能够助力DNA修复
数十亿细胞每天都经历着凋亡,产生大量的凋亡小泡(Apov),这对维持器官和身体的动态平衡至关重要。ApoV是细胞凋亡过程中释放的一种特殊类型的胞外小泡,包括1~5μm的凋亡小体、0.1~1μm的凋亡微泡和直径小于150nm的凋亡外体,携带着从亲本细胞遗传来的蛋白质、核酸、脂类和其他分子。
...配体|构象|靶点|蛋白质|复合体|靶向化疗药物_网易订阅
该公司在2023年10月训练的NeuralPLexer2模型对已有的方法论进行了大幅度改良。除了改进对创新靶点的预测精确度,研究团队还显著扩展了这一模型的应用范围,包括几乎所有生物结构类别,添加了蛋白/蛋白复合体,辅因子(cofactors),翻译后修饰和蛋白质/核酸复合体,并涵盖了蛋白质数据库(PDB)中的几乎所有结构。
2024年贵州医科大学硕士研究生招生考试生物医学综合(自命题)考试...
1.核膜,核孔复合体,核纤层成分、功能;核膜的崩解与组装。2.染色质DNA,染色质蛋白,核小体,染色质组装,染色质类型。3.染色质的复制与表达,染色质的复制与修复,染色质的激活与失活,染色质与基因表达调控,染色质的三维动态分布。4.染色体的形态结构,染色体的功能元件,染色体带型,特...
Nature Methods | 提高生物大分子成像分辨率:电喷雾技术在cryo-EM...
生物大分子复合物Cryo-EM特别适合研究多个蛋白质或核酸以及其它分子组成的大型复合物。这些大分子机器往往在细胞中承担关键功能,如核糖体、膜蛋白复合体、分子马达等。动态结构分析除了静态结构外,cryo-EM还能够捕捉生物分子在不同功能状态下的结构变化。这对于理解生物分子如何通过其结构变化来执行生物功能具有重要...