科学家在癌症进展过程中绘制细胞外染色体DNA的扩增图谱

为了理解染色体外DNA(ecDNA)扩增在癌症进展中的作用,研究人员检测并分类了8060例新诊断的原发性癌症、未经治疗的转移性癌症和经过多次治疗的肿瘤中的局部扩增现象。结果显示,未经治疗的转移性肿瘤和经过多次治疗的肿瘤中ecDNA的检测频率显著高于新诊断的癌症。尤其是化疗后处理的患者,其肿瘤中的ecDNA频率明显高于未经治疗...

Nat Genet | 基于WGS数据绘制癌症进展过程中ecDNA扩增图谱,揭示...

癌症的进展涉及基因组改变,包括局灶性DNA扩增,其可通过与染色体相连形成均质染色区域,或通过切除和环化DNA片段形成染色体外DNA(ecDNA)实现。其中,ecDNA在大多数癌症类型中被检测到,特别是在预后较差的癌症中。ecDNA携带或激活的基因包括一些常用抗癌抑制剂靶点基因和“不可成药”致癌基因;在肿瘤细胞中,ecDNA还参与癌基...

Adv Mater | 高灵敏度、高特异性的新型DNA等温扩增方法:AMPLON

AMPLON反应是一种基于DNA引物精确工程设计和协调的高度特异性和快速靶标扩增技术。该反应从LP(具有多臂PEG)与靶序列结合开始,通过反义L1DNA臂启动扩增,与正义L2DNA臂(通过PEG连接到反义臂)进行自启动,产生茎环PEG-DNA杂交结构。其他具有DNA的游离PEG臂启动AMPLON循环步骤,指导多臂扩增子的形成,最终用作AMPLON延伸步...

Nature Commun丨张勇与阮珏团队合作开发低DNA用量、无扩增的Pac...

DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误,影响基因组的完整性及变异检测的准确性。因此,低DNA用量、无扩增且操作简单的PacBio建库方法亟待开发。近日,中国科学院动物研究所张勇研究组与中国农业科学院深圳农业基因组研究所阮珏研究组在NatureCommunications杂志上在线发表了题为Low-inputPac...

扩增编辑可高效且精确地实现DNA从短序列到兆碱基和染色体规模的复制

研究人员开发了一种名为扩增编辑(AE)的基因组编辑工具,该工具能够在染色体规模上精确地进行可编程的DNA复制。AE可以复制20bp到100Mb的人类基因组,其大小与人类染色体相当。AE在各种细胞类型中表现出活性,包括二倍体、单倍体和原代细胞。AE对1Mb的重复显示出高达73.0%的效率,对100Mb的重复分别显示出3.4%的效率。

给鱼验DNA,江西这项行动目的何在?

环境DNA监测技术是一种水生态监测新技术,鱼类环境DNA监测是通过采集游离在水体中的鱼类DNA,经过样本富集、DNA提取、PCR扩增、基因测序等过程,并与相应的条形码数据库比对,揭示水体中可能存在的鱼类物种(www.e993.com)2024年11月11日。为做好此次监测工作,省监测中心技术人员严格按照技术要求,在采样前做好阴性对照用水、消毒液以及超纯水等相关准备工...

转基因食品的检测方法

外源DNA的检测目前对于外源基因的检测主要是通过对转入的外源基因进行PCR扩增,然后进行紫外或荧光检测。PCR技术全称“聚合酶链反应技术”,是一种在体外由引物引导的DNA聚合酶催化的聚合反应,能在短时间内准确地将目的序列大量复制。在转基因食品检测方面,主要是用于从DNA即基因水平来鉴定被测食品。由于它的快速、灵敏...

试用| 快!广!好!环境微生物DNA提取难?一盒解决提取烦恼!

有效扩增16s区域使用诺唯赞VNP-32P核酸提取仪搭配DM401-C3(V)和其他厂家同类型产品SupplierC-E提取各类环境样本的微生物基因组DNA,对16s区域(16s全长和338F/806R区)进行PCR扩增检测。电泳结果显示,DM401-C3产物都有清晰的目的条带且相对较亮,综合检出效果较优。

实验室管理之临床基因扩增检验实验室基本设置标准!

如需处理大分子DNA,应具有超声波水浴仪。(三)扩增反应混合物配制和扩增区1、核酸扩增仪2、微量加样器(覆盖1-1000ul)3、可移动紫外灯(近工作台面)4、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)5、专用工作服和工作鞋...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

表观遗传机制的研究在科学研究和医学中具有巨大意义,增强了对基因调控、疾病发生和遗传以及创新疗法发展的理解。DNA甲基化在器官和组织损伤中的变化机制DNA甲基转移酶(DNMTs)是一类在细胞中起关键作用的酶,可以调控DNA甲基化。DNMT主要负责向DNA中的胞嘧啶残基添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,从而实现DNA甲基化。DNMT能够...