诺贝尔化学奖将颁发给研究蛋白质结构的科学家

诺贝尔化学奖将颁发给研究蛋白质结构的科学家10月9日消息,2024年诺贝尔化学奖将授予DavidBaker(美国西雅图华盛顿大学)、DemisHassabis(GoogleDeepMind,英国伦敦)和JohnJumper(GoogleDeepMind),以表彰他们对蛋白质结构的研究。这是在该奖项网站上宣布的消息。白罗斯理想社对此进行了报道。诺贝尔委员会指出,贝克成...

因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质

所以,我们需要另外想出方法去获得定蛋白质的三维构型,这也是为什么我们想做蛋白质结构预测——我们想通过计算技术去把蛋白质的三维结构给算出来,而不是用实验仪器测出来。计算机预测蛋白质结构这个问题本身的定义很简单:假设我们有了一个蛋白质的氨基酸序列,能不能把它输入到计算机里面去,让计算机输出每个原子的三维坐...

中国科大在人类癌症细胞的多药耐药蛋白的结构和功能研究领域取得...

结构分析表明,apo-formABCC3结构呈现向细胞质基质开口(inward-facing)的构象:两个核苷酸结合结构域(NBD)彼此分开,两个跨膜结构域(TMD)形成一个朝向细胞质基质开放的“V形”底物转运通道。与经典的ABC转运蛋白不同,其N端有一个额外的五股跨膜螺旋组成的TMD0结构域。TMD0的五股跨膜螺旋聚拢在一起,形...

中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...

在该研究成果中,作者先用基于二氢叶酸还原酶的蛋白质互补分析体系来高效检测无序片段间的相互作用,系统研究了位点突变和截短对互作的影响,发现实验结果与AlphaFold2预测的α/β型复合物结构模型吻合;作者进一步用蛋白质序列设计深度学习模型ABACUS-R基于结构设计了多个突变体,成功获得一个突变体的晶体并解析了其结构。...

独家专访诺奖得主DeepMind CEO哈萨比斯:我们将看到一种全新的科学...

在实验室中,使用X射线晶体学等技术来预测蛋白质结构是一项艰苦的工作。无数博士都在研究单一蛋白质的折叠。CASP(CriticalAssessmentofStructurePrediction,结构预测关键评估)竞赛成立于1994年,该竞赛历时已久,其旨在通过每两年让计算机化预测方法相互竞争来加快研究速度。然而,没有任何一种技术能达到实验室工...

...Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互作用研究

01NatureMethods研究报道开发了DeepPBS模型,一种几何深度学习模型,旨在从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性(www.e993.com)2024年11月9日。02DeepPBS可以应用于实验或预测结构,提取残基的可解释蛋白质原子重要性评分,并通过突变实验验证这些评分。03该研究展示了DeepPBS如何与结构预测方法结合使用,以预测没有实验结构的蛋白质的特异性。

David Baker:可预测所有生物分子,生成具有高级结构的蛋白质

然后,该团队通过对去噪任务微调创建了新版本的RFdiffusion——RFdiffusionAll-Atom,该模型可以从头合成生成自然界中不存在的新型蛋白质。它围绕小分子构建蛋白质结构,即直接在小分子和其他非蛋白质分子周围构建蛋白质结构产生结合口袋。实验室测试表明,RFdiffusionAll-Atom可以产生具有高级功能的蛋白质,比方说,产生...

...生成式AI设计抗体,蛋白质设计领域“鼻祖”David Baker的最新研究

??DavidBaker不仅科学做得好,同时也是10多家生物医药公司的创始人/顾问导读3月18日,华盛顿大学蛋白质设计研究所所长DavidBaker在预印本BioRxiv上发文,首次使用生成式人工智能从头设计出了全新的抗体,这一重要发现未来有望让AI从头设计蛋白进入抗体药物市场

科学家揭示关键线粒体蛋白结构,助推线粒体相关的人类疾病研究

第二阶段，进行结构解析。为了进一步提高蛋白分辨率，获得更为清晰的结构，该团队不仅采用在样品包裹中增加甘油的方法，来改变冻蛋白的溶液，还通过收集庞大的冷冻电子显微镜技术数据，避免被组装成多聚体的蛋白发生散落现象。第三阶段，验证结构在细胞中的功能和作用。与其他蛋白质结构解析的研究相比，该研究的特色之处...

...副教授等:不同处理方法对蛋黄及其组分结构和性质的影响研究进展

这一系列研究表明,盐腌会显著提高蛋黄颗粒的乳化稳定性和蛋黄浆质的乳化活性,且基于盐的种类与浓度不同,蛋黄的乳化性能也不同。2)凝胶性蛋黄的凝胶性是指蛋黄蛋白质结构部分展开或者发生不可逆变性,蛋白分子间发生相互作用,聚集成有序的网络结构。盐腌对蛋黄及其组分凝胶性的影响主要通过其保水性和质构特性两个...