郑刚教授:非编码基因组在心血管疾病中的临床意义(下篇)
心肌病的病理生理学在很大程度上受到circALPK2、circSPHKAP、circCACNA1D和circSLC8A1的心脏特异性表达的影响,并作为诊断生物标志物[169]。DCM中高表达的circRNAs受BTBD7、NHLRC2、FAT1、LYPLAL1、DHX40、DHX4、ICA1、TTN和PKN2基因的调节[183]。4.6心脏再生动脉粥样硬化各种类型的circRNA参与心脏再生、重编程和...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
测序1百万个PacBio环形一致性序列(circularconsensus-sequencing,CCS)可以保证长度大于1kb的高表达基因测通,ONT测序技术也是如此。因此,测序深度主要影响低中表达的基因。低通量的局限性在研究功能基因组进行大规模差异基因分析时会更明显。为了获得足够的以保证转录组表达变化检测的准确性,需要对多个样品组的多个...
盘点那些与细胞相关的诺奖,细胞技术的诺奖之旅:探索生命的奥秘
随后,他们还发现了另一种名为let-7的微小核糖核酸,它在整个动物界中都广泛存在,具有保守的基因调控功能。微小核糖核酸技术的出现,为我们理解基因调控的复杂性提供了新的工具。通过调控微小核糖核酸的表达水平,我们可以影响目标基因的表达,从而干预生物过程。例如,科学家们可以利用微小核糖核酸技术来抑制肿瘤细胞的生长和...
追问daily | 大脑发育存在多种生成神经元的路径;基因表达改变如何...
结果显示,72%的基因在一个或多个轴上的全长异构体表达存在变化。剪接、转录起始位点和多腺苷酸化位点在不同细胞类型之间有很强的变异性,这影响了蛋白质结构,并与疾病相关的变异联系在一起。此外,神经递质运输和突触周转基因在解剖区域的细胞类型中存在可变性。在出生后第21天到出生后第28天的青春期过渡期间,细胞...
致敬2024年两位诺奖得主:甘坐“冷板凳”,一朝诺奖天下知
miRNA如何进行基因调控miRNA是一类重要的非编码RNA分子,在基因表达调控中发挥着不可替代的作用。它们通过复杂的调控机制和精细的调控网络,实现对细胞生长、发育和疾病进程的精确控制。miRNA的生物合成是一个复杂而精确的过程,它始于细胞核内的转录过程,主要包括编码作用和非编码作用两种路径。在编码作用中,miRNA的结构...
诺奖2024|解读:miRNA与众多疾病相关,药物为何难落地?
直到2000年,事情迎来了转机——鲁夫昆实验室在线虫中发现了第二条miRNA“let-7”,这是一条具有21个核苷酸长度的非编码miRNA,通过靶向lin-41基因的3’UTR降低lin-41的表达,与lin-4的调控机制相同(www.e993.com)2024年10月17日。鲁夫昆又证明了let-7在物种中的保守性,它在果蝇、斑马鱼、海胆和人类中都有表达。这以后,很多其他的科学家也...
诺奖2024|线虫研究四次斩获诺贝尔奖:科学是由普通人完成的
同一时期,鲁夫昆正在研究lin-14基因的调控。与当时已知的基因调控功能不同,他们发现lin-4抑制的并不是lin-14mRNA的产生。这种调节似乎发生在基因表达过程的后期,通过停止蛋白质生产来实现。其实验还揭示了lin-14mRNA中的一个片段对于lin-4的抑制是必需的。
Nature:重大进展!揭示MSL2确保哺乳动物双等位基因表达机制
他们的实验证实当杂交小鼠细胞中的MSL2缺失时,某些单倍剂量不足基因只能实现单等位基因表达。这意味着,在哺乳动物细胞中,MSL2是单倍剂量不足基因双等位基因表达所必需的,这能确保基因的功能,进而确保有机体的整体健康。有趣的是,许多受MSL2调控的单倍剂量不足基因都与神经系统疾病有关。
不止决定性别,XY染色体还广泛调控常染色体的基因表达
基于研究团队此前在性染色体基因表达线性建模方面的成功,研究团队现在调整和扩展了该模型,以检测X或Y染色体数量的变化是如何影响人类细胞中的常染色体的基因转录。该研究量化了不活跃的X染色体和Y染色体拷贝数变化对常染色体转录本的影响,探讨了这些影响的机制,发现了来自不活跃的X染色体和Y染色体上的一对保守转录因子...
中国科学家发布跨物种小脑皮层单细胞空间转录组图谱
综上所述,本研究构建了猕猴、狨猴和小鼠小脑皮层的时空单细胞图谱,描绘了灵长类特异性浦肯野神经元亚型、进化保守的神经元空间模式和基因表达的区域偏好,并建立了转录组的空间异质性与小脑内功能连接的紧密关系。这些数据为该领域的未来研究提供了全面的资源,揭示了小脑皮层在进化过程中的分子和细胞多样化,有助于深入...