...能够同时提供 20 种耐药基因目标区域内所有 SNP 位点的突变信息
专利摘要显示,本发明公开了检测结核分枝杆菌耐药基因的引物组、试剂盒及方法,其中耐药基因包括rpoB、katG、inhA、ahpC、embB、embA、pncA、rrs、rpsL、gyrA、gyrB、eis、rv0678、atpE、rplC、rrl、ddn、ethA、thyA和folC,引物组至少包括如SEQIDNO:1至SEQIDNO:52所示的引物;本发明将多重PCR扩增...
论著| 浙江省结核分枝杆菌耐药突变特征及其与基因型相关性分析
结论:浙江省MTB菌株对11种抗结核药物耐药相关基因突变以katG、rpoB、embB、pncA、rpsL、gyrA、rrs、thyA、inhA基因上的突变为主,其中rpsL基因、katG-315和rpsL-43位点突变与北京基因型相关。WGS耐药性分析对于异烟肼具有全面的耐药检测性能,但对个别基因突变位点的检测性能较弱。结核病的耐药问题依然严峻,尤其是耐多药...
精准前沿丨通过粪便靶向测序快速诊断结核病耐药性
Deeplex??MycTB检测靶向18个耐药相关基因(rpoB、ahpC、fabG1、katG、inhA、pncA、embB、gyrA、gyrB、rrs、eis、tlyA、gidBrpsL、ethA、rv0678、rrl、rplC)的全序列(即编码序列加部分启动子区)或最相关区域,结合基因组靶标进行分枝杆菌种类鉴定(hsp65)和结核分枝杆菌复合菌株基因分型(CRISPR基因座)。按照制造...
综述| 结核分枝杆菌全基因组测序数据分析方法与应用进展
由于MTB基因组的单克隆性,并且不同菌株间很难发生重组或者基因水平转移,因此,其主要通过核心基因或启动子的自发变异获得耐药性。目前已证实的耐药靶基因有rpoB(利福平)、katG和inhA(异烟肼)、rpsl和rrs(链霉素)、embB(乙胺丁醇)、gyrA和gyrB(氟喹诺酮类)和pncA(吡嗪酰胺)等。二、WGS在MTB基因组研究中的基本步骤...
前沿报道 | 余方友教授:MRSA、CRKP及结核分枝杆菌研究前沿
耐药基因分析表明除编码碳青霉烯酶的基因外,87.1%的分离株携带以blaCTX-M-15(65.6%)和blaCTX-M-15(18.9%)为主的ESBL基因。氨基糖苷类抗生素的耐药性由氨基糖苷类转移酶介导。此外,72.2%的分离株可检测到gyrA和parC基因中喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)的几个突变。值得注意的是,该研究仅检测到一株含有...