微生物所科研团队揭示金针菇驯化过程中的基因组进化并识别菌盖...

该研究通过对199个野生和栽培金针菇菌株的基因组序列的群体基因组、泛基因组及基于存在/缺失变异(PAV)和单核苷酸多态性的全基因组关联(GWAS)等分析,揭示了金针菇在驯化过程中的基因组进化,并通过遗传转化实验验证了对菌盖颜色和菌柄长度变异发挥功能的基因。研究表明,金针菇群体可以划分为与人工选择强度相对应的4个...

...郑钜圣团队:绘制中国健康人群衰老过程中肠道微生物结构变异的...

导读绘制人类衰老过程中肠道微生物结构变异(SV)的图谱,可能提供肠道微生物组与健康衰老关系的基本知识和机制理解。团队表征了3,230名中国参与者的肠道微生物SV,确定了与衰老、健康老龄化和与年龄相关的慢性病的关键SV。2024年11月9日,西湖大学医学院、生命科学学院郑钜圣团队在期刊《CellReports》上发表了题为...

...农田长期转化对土壤微生物呼吸温度敏感性及空间变异的影响

总的来说,相关研究结果凸显了与长期土地利用变化相关的生物地理变化对土壤微生物呼吸温度响应的潜在影响,并强调了将长期土地利用对土壤温度敏感性的影响纳入陆地碳循环模型以改进未来碳-气候反馈预测的重要性。研究论文近期在线发表于土壤学著名期刊《SoilBiologyandBiochemistry》。第一作者为北京林业大学博士研究生潘...

iMeta | 中科院微生物所王军组-MetaSVs:结合长、短reads用于宏...

微生物组是指在人体器官和许多其他类型的环境生态位中的复杂微生物群落,在改善人类和植物的健康状况、营养获取和免疫反应、影响动植物健康和改变环境生化特性等方面具有重要作用。其中,SVs是微生物基因组中高度可变的片段,影响基因组分子和细胞过程、调控功能、3D结构以及基因表达。SVs会使来自同一物种的细胞表现出复杂的...

科研进展︱八一农垦大学朱战波教授团队首次揭示肠道微生物可能是...

1)BVDV感染对肠道微生物的影响:16SrRNA测序发现BVDV感染并未改变WT小鼠肠道微生物的丰富度和多样性,对肠道微生物的组成也仅有轻微影响。然而,BVDV感染对菌群紊乱(Abx)小鼠的微生物结构和组成产生了较大影响。图1.BVDV感染对Abx小鼠肠道微生物的影响

宿主基因可调控人类肠道微生物结构变异

荷兰格罗宁根大学JingyuanFu和HermieJ.M.Harmsen共同合作,近期取得重要工作进展(www.e993.com)2024年11月20日。他们研究发现宿主基因可调控人类肠道微生物结构变异。相关研究成果2024年1月3日在线发表于《自然》杂志上。据介绍,尽管宿主遗传学对肠道微生物多样性和特定分类群丰度的影响已得到充分证实,但对宿主遗传学如何调节肠道微生物的遗传多...

EbioMedicine香港大学微生物系朱轩团队最新研究:揭秘新冠变异毒株...

研究团队利用一系列OmicronBA.2/5子代变异毒株(BL.1,BQ.1,BQ.1.1,XBB.1,CH.1.1,andXBB.1.5)感染小鼠和人鼻上皮细胞,证实OmicronBA.2/5子代变异毒株的繁殖效率和致病性在感染小鼠的肺组织中持续降低和减弱,但是在感染小鼠的鼻上皮组织中,BA.2/5子代变异毒株的繁殖效率和致病性与BA.2和BA.5...

易胖体质是因为“胖菌”?Nature Medicine最新研究揭示肠道微生物...

单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。全基因组关联研究(GWAS)是指通过扫描参与者基因组中数百万个单核苷酸多态性(SNPs),以寻找与疾病风险或其他性状相关的变异。这里则是将GWAS应用于人体微生物的基因变异与人体疾病的关联。

小小微生物竟是重要战略资源?

”微生物中的真菌就是天然的粮仓和优质蛋白质的来源。比如，香菇、木耳、牛肝菌等种类多样的可食用真菌，不仅味道鲜美，还是一类高营养、高蛋白、低脂、低糖、富含维生素和微量元素的健康食品；从真菌和放线菌中提取出的抗生素，在二战期间挽救了数百万人的生命，成为人类对抗细菌性感染病的良药；在工业上，微生物发酵...

从菌株之间的相互作用,解析控制着微生物群落的生态进化动态

基因组数据表明，同一物种的基因型变异，即菌株，共存，并且在天然微生物群落中丰富，然而，目前尚不清楚菌株在生态上是否等效，以及它们在什么特征遗传距离上可能表现出不同的相互作用和动态。我们通过在实验室中跟踪猪笼草Sarraceniapurpurea的10个分类学多样化的微生物群落来解决这个问题，超过300代，使用宏基因组测序，...