...课题组发表基于微环境感知图神经网络构建指导蛋白质定向进化的...
近日,上海交通大学自然科学研究院/物理与天文学院/张江高等研究院洪亮课题组设计了一种微环境感知图神经网络(ProtLGN),能够从蛋白质三维结构中学习有益的氨基酸突变位点,建立自然选择下的氨基酸序列分布,用于指导蛋白质氨基酸位点设计,最终实现蛋白质指定功能的提升(定向进化)。课题组通过生物化学室实验证明,这是一个通用...
上海有机所桂敬汉课题组:仿生骨架重组策略在甾体天然产物合成中的...
近期,中国科学院上海有机所桂敬汉课题组受邀在美国化学会AccountsofChemicalResearch上撰写综述,系统总结了研究团队过去8年里发展仿生骨架重组合成策略,实现甾体天然产物高效合成、结构修正以及天然产物合成导向的方法学研究等方面所取得的成果(Acc.Chem.Res.2024,57,568)。前沿科研成果仿生骨架重组策略在甾体...
湖南大学宋国胜教授课题组:TAD-NPs在分割光动力治疗中的应用
总结:综上所述,宋国胜教授课题组成功揭示了TAD-NPs在分割光动力治疗中的应用。TAD-NPs在光照期间和光照后均具有产生ROS的能力,并且在轻度光照条件下可以直接破坏生物分子,使其成为肿瘤治疗的有效工具。同时,该工作将长余辉成像集成到分割PDT中标志着一个重大的飞跃,长余辉成像提供了对治疗参数的精细控制,确保了在...
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
通过使用行为分析、遗传工具、神经成像和CRISPR基因编辑等技术,研究发现果蝇大脑中的关键神经节点在多个物种中是保守的,但这些节点能够灵活地响应不同的感官信号,例如D.melanogaster果蝇通过感知一种特定信息素,而D.yakuba果蝇则能在黑暗中通过7-三十碳烯(7-tricosene,一种化学信号)找到配偶。研究表明,外周神经回路...
华南理工李致贤和孔宪课题组ACS Catal.:定制羧甲基化提升共价有机...
今天,科技元素在经济生活中日益受到重视,中国迎来“科学技术爆发的节点”。科技进步的背后是无数科学家的耕耘。在追求创新驱动的大背景下,化学领域国际合作加强,学成归国人员在研发领域的影响日益突出,国内涌现出众多优秀课题组。为此,CBG资讯推出“人物与科研”栏目,走近国内颇具代表性的课题组,关注研究、倾听故事、记录...
北化梁浩课题组ACS Catalysis:理性构筑蛋白体内外自环化提升酶的...
理性设计蛋白体内外自发自环化以提升酶的耐热性和催化活性图1.环化酶的构建与验证(图片来源:ACSCatalysis)作者首先以β-葡萄糖苷酶(B0)为模型酶,分别在N端或C端修饰SpyTag/SpyCatcher来构建具有不同翻译序列的自发环化蛋白(称为CBT和TBC)(www.e993.com)2024年11月23日。通过SDS-PAGE观察到野生酶的条带位置与理论分子量一致。环化酶CBT和TB...
上科大杨晓瑜课题组ACS Catal.:不对称亲电胺化构建二芳基胺阻转...
综上所述,杨晓瑜课题组利用手性磷酸催化的亲电胺化反应实现了二芳基胺类阻转异构体的不对称合成。以良好的产率和高对映选择性得到了一系列具有大位阻的非N-芳基醌骨架的二芳基胺类阻转异构体,通过实验和计算系统地说明了该类化合物通过两根C-N轴协同转动的消旋机制。丰富的产物衍生化实验证明了该方法的应用潜力。
将量子比特数提升1个数量级,科学家用中性原子制备量子处理器,实现...
与之类似,中性原子是一种量子比特的实现方法,包括原子制备、量子受控门操作、量子态测量、误差纠正和量子存储等关键步骤都可被不断地提升发展,并且具有极大的可扩展性。该团队在每个光镊中放一个原子,利用12000个光镊捕获了6100个量子比特。图丨a、在12000个光镊阵列上的单个铯原子的代表性单镜头图像;b...
恭喜张老师|张贵军课题组:蛋白质结构预测的最新进展与挑战
2023年12月18日,张贵军课题组在JournalofChemicalInformationandModeling发表针对蛋白质结构预测的综述RecentAdvancesandChallengesinProteinStructurePrediction,主要讨论了在AlphaFold2出现后的一些主流方法。1背景介绍截至2023年6月,已有超过2.4亿个氨基酸序列被存入UniProt数据库,而只有大约20万个实验确定...
Nature子刊 | IT+BT,罗小舟课题组揭秘酶催化常数预测的“黑科技”
首先,研究团队以代表性的kcat数据集为例,系统的探索了机器学习模块16种不同的机器学习模型和2种代表性的深度学习模型(卷积神经网络和循环神经网络)在该数据集上五折交叉验证的性能,结果显示集成模型表现最好,尤其是随机森林和极端随机树显著优于其他模型,其中极端随机树表现最佳(R2=0.65)(图2)。