...海团队Trends in Parasitology封面综述丨寄生蜂基因组学研究进展

▲图1.寄生蜂基因组测序进展寄生蜂的基因组大小演化寄生蜂物种间的基因组大小变化较大,目前已知最小的为40Mb左右而最大的则超过了2Gb(图2)。近期的比较基因组研究表明,寄生蜂基因组大小的变化与其中的转座子含量显著相关。进一步的分析表明,不同类型的转座子在不同寄生蜂的基因组大小演化中扮演重要角色。

国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为主,测序读长长,可拼接长基因组序列,但数据产出量较低,准确性较低、测序成本较高,可实时产出数据,设备可便携[2]。各实验室可根据自身测...

...研究所猪遗传育种创新团队提出最优的低覆盖全基因组测序填充策略

但低测序深度的基因分型具有随机性和不确定性,为基因型准确填充增加了难度。本研究以具有低覆盖全基因组测序数据的1423头大白猪群体为研究对象,并选取该群体中遗传贡献最多的关键祖先个体进行高覆盖全基因组测序作为参考面板和混合填充的策略进行基因型填充,比较不同策略下的填充准确性,然后评估填充后的全基因组序列数据...

专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为主,测序读长长,可拼接长基因组序列,但数据产出量较低,准确性较低、测序成本较高,可实时产出数据,设备可便携。各实验室可根据自身测序样品...

...癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型关联的组合遗传策略

组合遗传策略作为一种新兴的研究方法,正在逐渐显现其独特价值。该策略通过综合运用多种遗传学手段,深入探究癌症的遗传机制,为癌症治疗提供新的思路。组合遗传策略是指在单一实验模型中同时操作多个遗传变量,以模拟癌症的多基因性质。这种策略不仅关注单一基因的作用,更重视不同基因间的交互作用及其对癌症发展的综合影响。

瑞孚迪:改变千万新生命——全基因组测序在新生儿筛查中的应用

这是一项全球大规模的、通过临床全基因组测序对看似健康的新生儿和儿童进行的主动筛查,并对两种概念不同的儿科筛查策略进行了并排比较(www.e993.com)2024年11月14日。为全基因组测序的临床应用提供数据为了开展这项研究,对562名看似健康的儿童进行了全基因组测序筛查;另外对606名儿童进行了覆盖268个儿科疾病相关基因的基于外显子组的基因pan...

生命解码:基因测序的群雄逐鹿

临床上,无创产前诊断技术通过胎儿基因组检测帮助判断胎儿是否带有遗传病。对于健康人群,基因测序也可以被用于亲缘/血统鉴定,健康风险评估/预防等领域。这些都得益于上游测序技术的快速发展。回看这20年,基因测序应用的普及,最大的推动力来自成本的大幅降低,这也是测序仪技术不断升级迭代的结果。

iMeta | 齐碳纳米孔测序助力揭示桑黄多酚抗结肠炎肠道分子机制

基于齐碳纳米孔测序平台及二代测序平台开展研究,通过16srRNA基因测序评估SH处理对小鼠肠道微生物群落结构的影响;通过对肠道微生物群落的宏基因组测序,确定与5-羟色胺-3-乙酸(5HIAA)生物合成相关的功能基因序列;通过对微生物,尤其是Alistipesonderdonkii等关键菌株的全基因组测序及组装,进一步理解微生物如何影响宿主健...

国产测序仪行业研究报告:近30款产品宣布商业化,市场重塑窗口期

1、测序技术存在不可能三角，各类技术互为补充基因测序技术包括Sanger测序技术、高通量测序技术、单分子测序技术。此处需要先明晰一下各个测序技术之前的关系。Sanger测序、高通量测序、单分子测序之间并非是代际关系，不适合用“一代”“二代”“三代”或“四代”来进行指代。各个测序技术之间方法学不同、测序原理不同...

Nature | 基因组学新纪元:超快速测序技术加速个性化医疗

云计算和大数据技术的融入,为超快速基因组测序提供了强大的数据处理能力和存储空间。通过云平台,可以实现海量基因组数据的高效管理和分析,极大提高了测序数据的处理速度和准确性。此外,云计算还能够提供弹性的计算资源,根据需要快速扩展或缩减,满足不同规模项目的需求,从而降低了基因组测序的成本和技术门槛。