地球上基因组最大的动物被发现!900亿对碱基,超人类30倍

欢迎了解南美肺鱼(Lepidosirenparadoxa),这种淡水生活的脊椎动物最近的基因组测序令人震惊:它拥有19条染色体,总共高达900亿个碱基对!这比人类的23条染色体上的30亿碱基对多出30倍,甚至超过了之前记录中最大的澳大利亚肺鱼的430亿碱基对的两倍,使其成为已知地球上基因组最庞大的动物。尽管南美肺鱼的基因组体积巨大,...

1600亿碱基对 拥有最大基因组的生物所携带的DNA数量是人类的50倍

一种名为"Tmesipterisoblanceolata"的不起眼的蕨类植物被发现拥有由1,604.5亿个碱基对(Gbp)组成的基因组。作为参考,人类基因组有3.1Gbp。另一种可视化的方法是想象DNA链解开的样子。我们的基因组会延伸出2米(6.6英尺),和勒布朗-詹姆斯差不多高。但是,T.oblanceolata的基因组将远远超过100米...

单碱基编辑器比“基因剪刀”还好用

目前，研究人员已经开发出几种主要的单碱基编辑器，其中包括胞嘧啶碱基编辑器（CBE）、腺嘌呤碱基编辑器（ABE）等。“这些编辑器相较于传统的基因编辑工具，有显著优势。首先，它们精确性更高，只修改特定碱基，而不会对周围的基因序列造成改变。例如，CBE可利用胞嘧啶脱氨酶将靶位点的胞嘧啶转变为胸腺嘧啶；ABE则通...

一种蕨类植物或拥有最大基因组,碱基对数量为人类基因组的50多倍

其每个细胞的细胞核DNA拥有3210亿对碱基。如果这些碱基对排成一条线,长度约有105米。相比之下,人类细胞的细胞核仅拥有略多于60亿对碱基,排列起来长约2米,仅为该蕨类植物的50分之一。相关论文发表于最新一期《交叉科学》杂志。披针叶梅溪蕨是一种罕见的植物,只生长在太平洋西南部的新喀里多尼亚和瓦努阿图的一些岛屿...

Nature Genetics | 揭示人类体细胞线粒体DNA嵌合性:探索遗传变异...

该研究通过对来自31名供体的三种细胞类型(结直肠上皮细胞、成纤维细胞和造血干细胞及祖细胞)的2096个克隆的基因组进行分析,共鉴定出6451个具有异质性水平(heteroplasmylevel)大于0.3%的线粒体DNA变异。这些变异包括碱基替换和插入缺失(InDels)。研究人员通过构建每个供体的早期胚胎系统发育树(phylogeny),追踪线粒体DNA...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

综上所述,HiFi测序的优势可以总结为五个方面(www.e993.com)2024年11月15日。首先HiFi是基于单分子测序,测序模板为单独的DNA链,因此可以用来区分相似序列之间的区别。其次是长读长,HiFi测序能够提供15,000-20,000个碱基对或更长的读长,能够让基因组组装变得更加准确、高效。此外,超长的读长使其可以对完整的mRNA直接进行从头测序,获得全长转录本...

PNAS丨谭蔚泓、韩达合作解密sgc8c DNA适体的复杂三维结构和功能优化

Sgc8c是通过Cell-SELEX技术获得的靶向白血病细胞的DNA适体,其分子靶标为酪氨酸蛋白激酶7(PTK7)。PTK7是一种无催化活性的跨膜蛋白,在多种肿瘤细胞中高表达。鉴于sgc8c对靶蛋白/细胞的高亲和力和高特异性,它被广泛应用于疾病检测和靶向治疗。然而,sgc8c执行精密功能的结构基础尚不清楚,导致其功能优化受到限制。作...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

AID(activation-inducedcytidinedeaminase,活化诱导的胞嘧啶脱氨酶)和AB(Apobec)是脱氨酶,通常与DNA碱基脱氨和脱氧核糖修饰有关,而不是直接参与DNA甲基化或去甲基化反应。它们在改变DNA碱基方面起作用,例如将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而不涉及DNA甲基的添加或去除。TDG(胸腺嘧啶DNA糖基化酶)和SMUG1(单链选择性单功能...

Nature子刊:汤玮欣团队开发更高活性、更好序列兼容性的腺嘌呤碱基...

目前约有60%的人类遗传性疾病源自于DNA上的单碱基突变,其中约有一半单碱基突变属于C:G到T:A的转换。腺嘌呤碱基编辑器(ABE)是进化的E.colitRNA腺苷脱氨酶(TadA*)与Cas9缺口酶(nickase)的融合蛋白,它可在不依赖双链DNA断裂的情况下实现A:T到G:C的转换,从而纠正C:G到T:A的突变,未来有望成为治疗这类因...

人造DNA 大跃进:科学家初探“搭积木”技术,可研制针对性药物

在DNA分子中,核苷酸形成的碱基对具有独特的分子几何结构,称为沃森和克里克几何(Watson-Crick),以1953年发现DNA双螺旋结构的科学家命名。新研究使用了人工扩展遗传信息系统(AEGIS),包含了两个新的碱基对。科学家通过从细菌中分离RNA聚合酶,测试它们与合成碱基对的相互作用,形成了一种类似于天然碱基对的沃森...