中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...
然而最近的底物结合AAA+蛋白的冷冻电镜结构不支持上述简单的一步转换模型,认为其ATP酶结构域围绕中心定位的底物多肽链以螺旋梯状排列,包括最近人源和鼠疫耶尔森氏菌Lon蛋白酶的冷冻电镜结构均支持持续性旋转机制。但在这些工作中,用于重构的细菌Lon是一个Walker-B突变体;而人源Lon的结构则显示了不同的底物结合方式和...
【科技自立自强】西安交大科研人员在生物酶多构象催化领域取得...
研究团队基于单颗粒电子显微镜成像与重构技术,发现T4连接酶在被AMP结合激活后呈现出四种稳定构象,且在与底物DNA进一步结合后依然保持四种构象,复合物中的DNA弯曲角度大约为0°、20°、60°或100°,显示了T4连接酶的多态催化构象。由电子显微镜重构得到的连接酶复合物结构呈现出明显的四种稳定构象进一步的单分子荧光实...
...教授等:食源性蛋白酪氨酸磷酸酶1B抑制剂的功能意义和结构-活性...
变构位点由一些独特的α-螺旋(α3、α6和α7等)组成,当PTP1B分子的C端结构域影响N端结构域时,PTP1B分子的整体构象发生变化,进一步使催化结构域与磷酸化底物之间直接接触,相互作用,PTP1B变构抑制剂通过切断他们之间的相互作用,使其不能呈现活性构象,从而使PTP1B失活。2PTP1B与2型糖尿病和肥胖症的关系...
上海大学高海燕教授、秦臻副教授等:β-1,3-葡聚糖酶的结构、功能
GH16家族β-1,3-葡聚糖酶三级结构富含β-折叠,这些链弯曲折叠成两个面对面反向平行的片层结构,构成一个供长链底物结合的狭长催化凹槽。GH16家族β-1,3-葡聚糖酶三维结构整体呈一种果冻卷结构,又称三明治夹心结构(图3)。GH16家族的β-1,3-葡聚糖酶遵循典型的保留水解机制,在反应历程中会形成不稳定的酶-糖基...
研究人员通过低温电子显微镜揭示了复制酶的原子结构
有趣的是,该结构与基于蛋白质的聚合酶有着惊人的相似之处,其模板结合、聚合和底物分辨结构域的分子形状类似于一只张开的手。"我们惊讶地发现,我们在试管中人工进化出的核糖酶竟然具有天然存在的蛋白质聚合酶的特征。"英国剑桥大学MRCLMB项目负责人PhilippHolliger解释说:"这表明,无论材料是RNA还是蛋白质...
中国科大解析致病菌细胞壁成分胞壁酸翻转酶的结构和功能机制
具有类似结构特点的ABC转运蛋白都可以利用这一机制通过相对微小的总体构象变化转运较大的底物(www.e993.com)2024年7月8日。作者进一步通过生化实验和计算机模拟确定了Targocil结合TarGH的精确位点,并阐明了其抑制TarGH转运胞壁酸的分子机制。研究结果将为设计和优化针对MRSA的新型抗生素提供结构基础和理论指导。
iMeta | 中国药科大学李萍/李菁-编码胆盐水解酶的乳酸杆菌的分类...
对7种结合BAs体外解离活性最高的乳酸杆菌是编码BSH‐T3的菌株。此外,在小鼠体内的研究表明,给予编码BSH-T3的罗伊氏乳酸杆菌可以改变肠道微生物组和代谢组的结构,并显著增加游离BAs和总BA排泄水平。我们的发现促进了人类肠道微生物组中编码BSH的关键乳酸杆菌的分类鉴定,并阐明了它们对BAs肝肠循环调节的贡献,这将有助...
干货| 酶切实验切开 or 切不开,真的是玄学吗?
??底物DNA在扩增过程中引入了突变,突变可能破坏已知的识别位点或创造出新的酶切识别位点,从而产生错切条带。可对模板DNA测序判断是否突变。-酶与模板DNA结合-??部分限制性内切酶(如FokⅠ,TauⅠ)可能会与DNA结合,导致电泳时出现明显的凝胶迁移,使用含SDS的上样染料,加热使酶从切割的DNA上解离开。
【科技前沿】PNAS丨温文玉团队发现HECT型E3连接酶活性的相分离...
泛素化是一种受到高度调控的蛋白质翻译后修饰,泛素激活酶E1-结合酶E2-连接酶E3的有序酶促反应催化单泛素分子或泛素链共价连接到底物蛋白,进而参与信号传导、蛋白酶体降解、细胞自噬、以及DNA损伤修复等一系列细胞活动1。E3介导将泛素由E2转移到底物的最后一步,因而决定了泛素化修饰的特异性。Nedd4家族(Itch,...
m6A-seq等揭示RBM33参与调控m6A去甲基化酶活性
ALKBH5的K132A、E153A和T265A突变体丧失与m6A修饰底物的结合能力;ALKBH5的K132A、E153A和T265A突变体丧失m6A去甲基化酶活性。(4)RBM33通过募集deSUMOylaseSENP1激活ALKBH5去甲基化酶活性RBM33KD显著诱导ALKBH5SUMOylation;RBM33KD不影响ALKBH5和PIAS4相互作用,但破坏了ALKBH5和SENP1的相互作用;...