Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

但是,3??mRNA-seq方法可能会受到转录本序列相似区域(homopolymericregion)导致的引物结合错误进而导致扩增出错误的片段的影响;也只能进行非常有限的转录异构体分析,这会抵消这一方法因为测序深度需求低带来的高性价比,尤其是对于那些仅够一次使用的样本。mRNAs的选择性多腺苷酸化(APA)会产生3??UTR长度不等的...

阿尔茨海默症的疫苗开发,有突破吗?Vaccin:DNA疫苗 vs. mRNA疫苗...

图4.G4DNA对DNA修复途径的影响注意G4DNA如何刺激紫外线诱导的DNA损伤的核苷酸切除修复(NER)机制,而它们在碱基切除修复(BER)介导的途径上显示相反的作用。另一方面,错配修复蛋白与G4结构的相互作用与任何DNA修复活性无关正如多项研究所证实的,基因组不稳定性起始处的双链DNA断裂是由G4形成的DNA所决定的,G4...

《食品科学》食品非热加工专栏:华南理工大学闫鹤副研究员等:低能X...

5.1DNA损伤修复细菌基因组DNA是在电离辐射或紫外线等氧化应激条件下产生的活性氧关键靶点之一。本实验结果显示,沙门氏菌会增强修复和防御,产生应激蛋白以减少电离辐射损伤。转录组结果显示同源重组的酶(RecA蛋白)的编码基因recA表达量显著上调了2.51倍。同明,与SOS系统相关的基因uvrA、recN、dinI、sulA和sbmC也表现...

上海交大陆婷婷课题组水稻染色体外环状DNA研究取得重要进展

这种差异可能与水稻作为喜光植物的生物特性有关,紫外线(UV)照射可以引起染色体断裂和DNA损伤。通过将水稻叶片暴露于强紫外线(78μW/cm??,持续20分钟)下处理,与对照组相比,水稻叶片中的eccDNA含量显著增加。要详细解析这一现象背后的机制,还需进一步深入的研究。综上所述,该研究开创性地证实了eccDNA在水稻中普遍存...

特别关注|脂肪自噬在非酒精性脂肪性肝病防治中的作用

肝脏X受体α(LXRα)是肝脂肪自噬的负调控因子,Kim等研究发现LXRα通过转录激活microRNAlet-7a-2和microRNA34a基因,下调了自噬相关的半胱氨酸蛋白酶ATG4B和自噬体、溶酶体形成相关的Rab-8B,抑制肝细胞中的自噬,降低线粒体物质合成和能量消耗,最终导致肝脂肪变性和脂肪性肝炎的进展。C9ORF72基因是由6个DNA碱基的...

癌症生物学系列:肿瘤发生与基因组的完整性

基因组DNA的外源性损伤细胞基因组也会受到外源诱变剂的损伤,这些外源诱变剂包括我们所吃的食物、呼吸的空气和进入机体的多种射线和分子(www.e993.com)2024年11月5日。其中研究最多的外源致癌物是X射线,与X射线相比,来自阳光的紫外线辐射是更加普遍的环境辐射来源。紫外光子攻击皮肤细胞中的DNA常常会形成嘧啶二聚体。也就是说,在同一条DNA链...

Cancer Cell:顾伟实验室长文总结p53领域45年研究进展

DNA损伤后,p53蛋白被稳定并激活以阻止细胞周期进行,为细胞提供时间窗口和足够的物质和能量,以修复受损的DNA。如果损伤太严重而无法修复,p53就会引发细胞凋亡和衰老,以消除受损的细胞。值得注意的是,p53激活的结果还取决于细胞和DNA损伤的类型。这三种功能被广泛认为是p53预防肿瘤发生的主要屏障。另外,p53也能被CRISPR-...

有一天,人类也将有可能活到400岁?

为什么我们需要改变基因的开启或关闭呢?有些基因缺陷可能是我们与生俱来的,有些DNA可能会随着时间的推移而受损。随着年龄的增长,我们的周围环境和正常的细胞生理过程会对我们的基因及其开关(表观遗传)造成损害。这种损害在人的一生中不断积累,并且会加速衰老。

Cancer Cell:顾伟/刘彦卿等2万字长文综述全面总结p53领域研究进展

一方面,p53介导的应激(尤其是DNA损伤,这是衰老的关键驱动因素)反应利于细胞存活、去除受损细胞、保护组织完整性并维持机体稳态,从而有可能延缓衰老。然而,p53调节的过度且持续的DNA损伤反应会对衰老产生相反的影响。另一方面,p53导致的干细胞耗竭会加速衰老过程,但也有反例。此外,p53调节代谢、免疫活性及其与Sirtuins家族...

研究发现:即使防晒 由紫外线诱导积累的DNA有害突变也很突出

皮肤是我们抵御毒素和紫外线等多种外在伤害的第一道屏障,每天除了会受到来自环境导致的DNA损伤外,也面临着内源性DNA损伤或DNA复制错误的问题,致使人体的体细胞基因组发生单碱基取代,插入和缺失,重排和拷贝数变化等突变,最终导致癌症等疾病的发生。这些引起突变甚至致癌的机制已然众所周知,但由于研究技术的限制,我们仍未...