AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质折叠成何种结构决定了它将具有何种功能,于是理解蛋白质如何折叠就成了一个十分重要的研究课题,这便是“蛋白质折叠问题”。一个蛋白质如果因为各种原因而没有正确折叠,就有可能不会正常发挥其功能,从而引发疾病,阿尔兹海默病、帕金森等疾病都和蛋白质的错误折叠有关。此外,在药物设计上面,研究人员常常需要开发具有...
追问|蛋白质结构预测模型再升级,解锁新功能直接作用药物设计
与之结合发挥药效,在此过程中“钥匙”和“锁”都不会改变,但事实是药物和体内蛋白分子都是柔性的,其形态会发生改变,但传统方法很难预测这个过程的变化,而从AlphaFold-latest最新的报道看,将蛋白序列和配体的SMILES共同输入程序,模型就能够同时兼顾蛋白质与其他分子相互作用时的结构柔性,从而有助于考虑药物和蛋白分子...
内毒素相关受体:sCD14与mCD14结构与功能的异同解析
内毒素相关受体:sCD14与mCD14结构与功能的异同解析sCD14存在于人和许多动物血清或血浆内,其蛋白质结构与mCD14蛋白质结构相同,但不含GPI结构,故分子量较mCD14小,为4.8万左右。在正常情况下,其血清含量约为2~6μg/ml。体内CD14分子主要以sCD14形式存在,约占体内总CD14分子的99%。目前认为sCD14是由mCD14直...
结构生物学:我们用一百年改变了什么?
蛋白质的折叠方式与空间构象对于蛋白质的功能有着决定性的作用。掌握了蛋白的三维结构,就掌握了开启和关闭蛋白功能的钥匙。在接下来的几十年里,一个又一个重要的蛋白质结构被解析出来,核糖体、肌动蛋白、ATP酶、氧化还原酶、RNA聚合酶……结构生物学的黄金时期一直持续到本世纪,以至于2006年诺贝尔化学奖获得者罗杰...
低调又迷人,它完成了DNA和蛋白质都无法做到的事 | 西湖大学付向东...
对。它把你想不到的、蛋白质做不到的事情、DNA做不到事情全做了。它既可以在某一个时期作非编码(noncoding)RNA,在某一个时期它也作一种传感器(sensor),在其他(other)时间它也作一个配体(ligand),然后甚至作激素(hormone)。为了教课,我还专门总结了一下RNA的功能。后来我就发现,几乎蛋白质能做到的事情它...
汪小我基于深度学习的交互式工具包,用于高效和有效的蛋白质设计
序列恢复率衡量的是在蛋白质结构不变的情况下,计算方法重现蛋白质天然氨基酸序列的能力,而复杂度评估的是模型对原生序列的预测能力(www.e993.com)2024年7月25日。结果表明,DIProT的性能更好。虽然序列恢复是评价设计模型的一个广泛使用的指标,但这还不足以判断其实际效果。因此,科研团队对单例和数据集进行了额外的评估。图3序列级实验结果...
...张文涛博士等:超声功率对牛肉干品质及牛肉肌原纤维蛋白结构的...
这说明超声处理破坏了肌原纤维蛋白的结构,促使其结构展开,暴露出更多疏水基团,在有效改善牛肉干嫩度的同时,也增加了水分的保持,加快了食盐渗透,进而提高了牛肉干的保水性和盐含量。但超声功率过高引起的高pH值和水分含量不利于牛肉干的贮藏,另外,过高的功率还会增加蛋白过度氧化的风险及额外的能源消耗。综上,结合感官...
7种基于TCR疗法的分子结构
TCR的功能单元是由六个蛋白质组成的八聚体复合体:克隆型TCRα/TCRβ半链和不变的CD3γ、CD3δ、CD3ε和CD3ζ链(图1a)。这些蛋白质按1:1:1:1的化学计量比组装,其二聚体亚基为TCRαβ:CD3δε:CD3γε:CD3ζζ。少数循环T细胞(γδT细胞)表达TCRγδ,而不表达TCRαβ。TCR半链蛋白都不具有信号转导...
DeepMind发布新版AlphaFold模型,能够精准预测生物分子结构
不过,新模型却不需要这些参考资讯,就能预测蛋白质与配体的结构,并且最终的结果也能超越目前最佳的对接方法,此外,新版本AlphaFold还可以模拟所有原子的位置,表达出蛋白质和核酸,在与其他分子互动作用时的灵活性。由于对接方法需要假设蛋白质和配体结构在互动时维持不变,因此就无法捕捉到这些结构的动态变化,因此整体来说...
甲减吃优甲乐体重不变
2.饮食习惯改变:在日常生活中适当调整饮食结构也可以帮助减轻体重,比如减少高热量食物的摄入,增加蔬菜、水果以及低脂蛋白质的摄入量。此外,适量运动也有助于消耗多余的脂肪和卡路里,有助于减轻体重。因此,在服药期间应遵循健康的生活方式,合理安排饮食和锻炼时间,以达到理想的体重管理效果。