怎么选择DNA酶I?
2、去除RNA样品中的基因组DNA污染:在进行RT-PCR或RNA测序之前,使用RNase-freeDNaseI处理RNA样品,以去除可能存在的DNA污染,确保RNA数据的准确性。3、体外转录后去除DNA模板:在体外转录反应后,使用RNase-freeDNaseI去除剩余的DNA模板,为后续的RNA操作提供纯净的RNA样品。4、DNaseI足迹法:基于DNA和蛋白质结合...
《自然》子刊:上科大团队揭示核酸酶降解RNA-DNA杂合核酸的新模式
此外,复制蛋白A(ReplicationProteinA,RPA)作为单链DNA结合蛋白,不仅可以提高RNaseH1对RNA3′-5′方向的降解速率和持续性,同时通过帮助解旋杂合链激活其5′-3′的外切酶活性(图1),从而保证RNaseH1对杂合双链的持续双向降解。这些发现揭示了RNase独特的酶活特性,提供了RPA促进RNaseH1降解杂合链的分子机制解...
Nat Commun | 孙博/李卫合作揭示核酸酶降解RNA-DNA杂合核酸的新模式
此外,复制蛋白A(ReplicationProteinA,RPA)作为单链DNA结合蛋白,不仅可以提高RNaseH1对RNA3′-5′方向的降解速率和持续性,同时通过帮助解旋杂合链激活其5′-3′的外切酶活性(图1),从而保证RNaseH1对杂合双链的持续双向降解。这些发现揭示了RNase独特的酶活特性,提供了RPA促进RNaseH1降解杂合链的分子机...
「耀文解读」一文读懂|mRNA加帽率检测方法汇总
首先使用RNaseH、以每个序列5'端的50个碱基为中心的互补DNA探针或核酶，将mRNA样品切割成约50个核苷酸的片段。通过LC-MS分析裂解的5'末端片段（图2e）。结果表明，与使用ARCA共转录加帽相比，使用牛痘加帽酶进行转录后加帽时，加帽效率更高。同时，他们进一步发现，通过微调ARCA反应可以最大限度地提高加...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
如前所述,RNaseH法使用核酸酶消化RNA:DNA复合物中的rRNA,但保留降解的mRNA用于后续测序。RNAexome方法使用寡核苷酸探针来捕获RNA-seq文库分子,非常类似于外显子测序(exomesequencing)使用的策略。这两种方法应用简单,并都能在保留降解的和片段化的mRNA的前提下降低混入的rRNA的影响,进而获得高质量的和高稳定性...
RNase-free DNase I的选择标准
1、RNA提取:通过使用DNaseI处理RNA样本,??可以有效地去除DNA,??从而获得高质量的RNA样品用于分子生物学研究(www.e993.com)2024年11月18日。2、去除RNA样品中的基因组DNA污染:在进行RT-PCR或RNA测序之前,使用RNase-freeDNaseI处理RNA样品,以去除可能存在的DNA污染,确保RNA数据的准确性。
下一个“合成致死”新星?阿斯利康、罗氏、恒瑞、英派等都看中的...
除了上述单个基因组改变之外,化学遗传学筛选还可以鉴定广泛的其他潜在基因组改变,作为ATR抑制剂的“合成致死”搭档,其中包括:RNAseH2复合体缺陷;APOBEC3A/B的改变;致癌基因激活,例如MYC扩增;RAS突变或NF1功能丧失;其他细胞周期检查点/DNA修复蛋白的缺陷,包括CCNE1扩增、TOPBP1、CDK12和ERCC1/XRCC1;剪接体热点突变,...
Nature子刊:带你认识甲状腺癌基因变异特征及临床管理|甲状腺癌|...
此外,DNA错配修复通路基因(例如MLH1、MSH2和MSH6)和ATM(参与DNA损伤)的截断突变主要发生于ATCs。对其他肿瘤谱系的功能研究,以及原发性甲状腺肿瘤和有错配修复缺陷的细胞系的观察性证据提示,DNA修复缺陷可能会增强ATC的基因组不稳定性和超突变表型。这些新抗原的存在可能引起免疫细胞的肿瘤浸润。
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
交联后的样本需要经过一系列的步骤来提取RNA-蛋白质复合物,并进行后续的鉴定。TREX技术的核心在于使用特异性的DNA探针和RNaseH酶精确地剪切目标RNA,从而释放出与其结合的蛋白质。将交联的样本用裂解液处理,释放细胞内的RNA-蛋白质复合物。添加特异性的DNA探针,这些探针能够与目标RNA特异性杂交。加入RNaseH酶,特异...
实验专题 | TRIzol 法同时提取 RNA、DNA 和蛋白质
实验专题|TRIzol法同时提取RNA、DNA和蛋白质TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质。TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。