R绘制中国地图,并展示流行病学数据

GIS地图有很多种存储格式,其中shapefile格式(.shp)可以通过R的maptools包打开。其他格式可以去R官网查询相应的软件包。地图数据基本可以分为点、线、面三种数据,在maptools包内分别有对应的函数来读取(????readShapePoints??????、????readShapeLines??????和????readShapePoly??????函数)。...

IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践

近日,中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊Protein&Cell(IF=21.1)发表了题为”“ThebestpracticeformicrobiomeanalysisusingR”的综述论文,建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR,助力微生物组学发展。图文摘要本文详细介绍了基于R语言的324个常用R包进行微生物组数据...

R语言学习 - 热图美化 (数值标准化和调整坐标轴顺序)

data<-read.table(text=data_ori,header=T,row.names=1,sep=";",quote="")#去掉方差为0的行,也就是值全都一致的行data<-data[apply(data,1,var)!=0,]dataGrp_1Grp_2Grp_3Grp_4Grp_5a6.620.9100.1600.05.2b20.899.8700.03.719.2c100.0800.06.221...

R语言航班延误影响预测分析:lasso、决策树、朴素贝叶斯、QDA、LDA...

data=read.table("12_months_dataFinal.csv")head(data)colnames(data)在审查数据之后,有几个方面被认为对航班延误有影响。1.航空公司:航空公司,尾号和航班号。2.时间:季度、月和日。3.操作:承运人,尾号和航班号。4.地理:起源机场和目的地机场。选择一些变量做个图看一下变化趋势点击标题查阅往...

数据代码分享|R语言回归分析:体脂数据、公交绿色出行与全球变暖2...

如何使用R准备数据进行回归分析(查看文末了解数据免费获取方式),定义一个线性方程并估计回归模型。案例1:体脂数据回归分析data=read.table("bodyfat.txt",header=F)给变量名赋值colnames(data)=c("Densitydeterminedfromunderwaterweighing","PercentbodyfatfromSiri's(1956)equation","Age","We...

R语言广义加性混合模型(GAMM)分析长沙气象因子、空气污染、PM2.5...

本研究旨在使用R语言中的广义加性混合模型(GAMM)方法,帮助客户来探索长沙地区气象因素与空气污染之间的关系,并进一步研究它们对PM2.5浓度变化的影响(www.e993.com)2024年11月10日。我们将采集长沙地区的逐日气象数据、空气污染指标以及PM2.5浓度数据,应用GAMM模型进行分析。在分析过程中,我们将考虑多种气象因素,如温度、湿度、风速等,并结合空气污染...

作出SCI论文中的table 1 原来这么简单!

今天给大家分享一下如何使用R语言完成表1的设计。library(tableone)library(survival)首先是加载tableone包,使用survival包中的pbc数据集进行演示data(pbc)head(pbc)查看pbc数据集的数据varsToFactor<-c("status","trt","ascites","hepato","spiders","edema","stage")pbc[varsToFactor]<-lapply...

R语言中进行Spearman等级相关分析

本文展示了r语言中如何进行Spearman等级相关的例子###---###Spearmanrankcorrelation,frigatebirdexampleData=read.table(textConnection(Input),header=TRUE)cor.test(~Pitch+Volume,data=Data,method="spearman",continuity=FALSE,conf.level=0.95)Spearman'srankcorrelationrhoS...

10个令人相见恨晚的R语言包

和其他语言(比如Python和Java)相比,R可以更模糊和麻烦。好消息是,有大量的包可以在R基础库上提供简单和熟悉的界面。这篇文章是我喜欢和每天使用的10个包,并且我希望自己能早些知道他们。1.sqldfR语言学习曲线中最陡峭的一部分就是语法,我花了一段时间才习惯使用<-代替=。我听到很多人问如何实现VLOOKUP?!?R...

R语言自然语言处理NLP:情感分析上市公司文本信息知识发现可视化

Negative=read.table("NegativeWords.txt")文本清理和分词qrxdata=gsub("\n","",qrxdata)words=lapply(X=qrxdata,FUN=segmentCN);初始化统计结果x=wordspwords=positivenwords=negativeLitigious=LitigiousStrong=StrongWeak=WeakUncertainty=Uncertainty...