R语言中进行Spearman等级相关分析

本文展示了r语言中如何进行Spearman等级相关的例子###---###Spearmanrankcorrelation,frigatebirdexampleData=read.table(textConnection(Input),header=TRUE)cor.test(~Pitch+Volume,data=Data,method="spearman",continuity=FALSE,conf.level=0.95)Spearman'srankcorrelationrhoS...

R语言中Data Frame数据框的那些事!

我们做数据分析、数据挖掘常用到R语言来处理,而运用得好坏常常关系到函数的熟练程度,下面我们大圣众包(dashengzb)小编就为大家总结下R语言当中常用的DataFrame数据框基本操作!DataFrame的概念DataFrame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类...

IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践

微生物群落的表格数据输入主要是使用utils包(代码1A,GitHub中的脚本)中的read.table()、read.delim()和read.csv()等函数完成的。进化树文件的读取依赖于ape/ggtree/treeio包中的read.tree()或Phyloseq包中的read_tree()之类的函数。为了读取微生物组中具有代表性的序列文件,通常使用Biostrings包(Pages等,2016)中...

R语言学习 - 热图美化 (数值标准化和调整坐标轴顺序)

data<-read.table(text=data_ori,header=T,row.names=1,sep=";",quote="")#去掉方差为0的行,也就是值全都一致的行data<-data[apply(data,1,var)!=0,]dataGrp_1Grp_2Grp_3Grp_4Grp_5a6.620.9100.1600.05.2b20.899.8700.03.719.2c100.0800.06.221...

R语言航班延误影响预测分析:lasso、决策树、朴素贝叶斯、QDA、LDA...

data=read.table("12_months_dataFinal.csv")head(data)colnames(data)在审查数据之后,有几个方面被认为对航班延误有影响。1.航空公司:航空公司,尾号和航班号。2.时间:季度、月和日。3.操作:承运人,尾号和航班号。4.地理:起源机场和目的地机场。

R语言广义加性混合模型(GAMM)分析长沙气象因子、空气污染、PM2.5...

本研究旨在使用R语言中的广义加性混合模型(GAMM)方法,帮助客户来探索长沙地区气象因素与空气污染之间的关系,并进一步研究它们对PM2.5浓度变化的影响(www.e993.com)2024年11月10日。我们将采集长沙地区的逐日气象数据、空气污染指标以及PM2.5浓度数据,应用GAMM模型进行分析。在分析过程中,我们将考虑多种气象因素,如温度、湿度、风速等,并结合空气污染...

10个令人相见恨晚的R语言包

install.packages("randomForest")library(randomForest)#下载泰坦尼克号幸存者数据集data<-read.table("httpmath.ucdenver.edu/RTutorial/titanic.txt",h=T,sep="\t")#将Survived列转为yes/no因子data$Survived<-as.factor(ifelse(data$Survived==1,"yes","no"))#拆分为训练集和测...

华人力量无处不在,微软在发展中寻求突破 | KDD 2017

来自微软的研究员们分别组织了五场不同主题的教程演讲(Tutorials)以及一场实践教程(Hands-onTutorial),内容涵盖了利用对照实验(A/Btesting)加速软件创新,群体感知(crowdsourcing),大规模层次数据分类技术,社交网络数据分析,城市计算,以及利用R语言的可扩展的数据科学技术等核心技术领域。其中,微软亚洲研究院资深研究...

R语言自然语言处理NLP:情感分析上市公司文本信息知识发现可视化

Negative=read.table("NegativeWords.txt")文本清理和分词qrxdata=gsub("\n","",qrxdata)words=lapply(X=qrxdata,FUN=segmentCN);初始化统计结果x=wordspwords=positivenwords=negativeLitigious=LitigiousStrong=StrongWeak=WeakUncertainty=Uncertainty...

R包神器 | 系统发育和进化分析 - ape (一)

APE(AnalysisofPhylogeneticsandEvolution)是1个用R语言编写的用于分子进化和系统发育分析的免费软件包,提供了读写数据和操作系统发育树的实用函数,以及几种用于系统发育和进化分析的高级方法(e.g.比较和群体遗传方法)。APE利用了许多用于统计和图形的R函数,并为开发、实现进一步的进化过程分析的统计方法,...