体积电子显微镜中全细胞细胞器分割
新算法可以在全细胞超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。这一工具离不开位于Janelia的特殊防振室中的聚焦离子束扫描电子显微镜(focusedionbeamscanningelectronmicroscopy,FIBSEM)。高分辨率电子显微镜一层一层地捕捉数千张高压冷冻的Hela细胞样品的图像,构建出全细胞数据库。在一部...
这个项目组,一天2篇Nature,披露更多细胞内部细节,或将更新教科书!
首先科学家们使用专门的电子显微镜,一层一层地捕捉到数千张细胞图像(1)。在这些图像的一部分中,科学家们煞费苦心地手工追踪单个细胞器(2)。叠加追踪图层会创建一个3D数据集。然后,科学家根据数据训练机器学习算法,教计算机识别不同的细胞器(3)。有了足够的示例数据,计算机可以有效地从以前从未见过的图像中挑选细胞...
...浩宇合作团队发明计算超分辨图像重建算法,稳定提升荧光显微镜2...
因此,稀疏解卷积是通用荧光显微计算超分辨率成像算法,可被广泛应用于提升其他荧光显微模态分辨率,观察不同种类细胞器的精细结构及动态(图3)。图3|稀疏解卷积广泛应用于提升不同显微成像模态空间分辨率,揭示各类细胞器精细结构动态。比如稀疏解卷积增强的商业超分辨转盘共焦结构光显微镜(SD-SIM)7,可以实现XY...
技术线上论坛|6月8日《科学家首次实现单个活细胞中细胞器的操纵...
共聚焦显微镜等大型仪器的技术支持与运行管理,在多尺度生物样品的原子力制样与成像力学检测、单细胞注射与分离等显微操作、生物荧光成像与图像处理分析等方面有着丰富的经验,为校内外100余课题组提供技术服务,辅助课题组在Nature、Cell、NatureCellBiology等国际期刊发表论文30余篇。
活细胞也能进行细胞器操纵?多功能单细胞显微操作FluidFM技术首次...
1行:用悬梁臂探针提取单细胞细胞器的示意图。2行:不同孔径的悬臂扫描电镜图。3行:FluidFM悬臂探针孔径与对应的流体力范围。(C)示意图:使用FluidFM技术进行细胞器注射。通过调整悬臂探针中的正压(+Δp)进行将探针中的细胞器注射到受体细胞内。图2:(A)FluidFM悬臂探针的扫描电子显微镜图像。具体尺寸参数是:L...
科学家用最先进的成像技术揭开细胞结构的神秘面纱
沿纵轴切开并从上方观察的人类中心粒模型(www.e993.com)2024年9月20日。图片来源:??CentrioleLab这种细胞器对细胞骨架的组织至关重要,在功能障碍的情况下与某些癌症、脑部疾病或视网膜疾病有关。这项发表在《细胞》(Cell)杂志上的研究成果阐明了中心粒组装的复杂性。它还为研究其他细胞器开辟了许多新途径。
单个活细胞&细胞器操纵新突破丨多功能单细胞显微操作技术首次实现...
本文使用的FluidFM技术采用微型探针,可以在微环境中以高时空分辨率操纵单细胞或者对单个细胞进行采样,并与组学方法相结合,使细胞器的研究成为可能。FluidFM技术将原子力显微镜的高精度力学调节手段与光学检测下的纳米尺度微流控系统相结合,提供与单细胞操作相关的力学和定量的体积控制。这些特性在现有微型探针中是独一无二...
Nature一周论文导读|2023年5月25日
本研究报告一套DNA条形码方法,通过序列成像提升分辨率(RESI),使用现成的荧光显微镜硬件和反应试剂,将分辨率提升至??ngstr??m级别。通过在环境条件下对完整细胞进行分子间成像,RESI缩短了超级分辨率显微镜和结构生物学研究之间的差距,为理解复杂生物系统提供关键信息。]...
只要几小时!机器学习能快速揭示细胞内部结构
最新的机器学习工具可在电子显微镜数据中精确定位突触,即神经元之间的连接。研究人员调整了算法来绘制或分割细胞中的细胞器,该分割算法为图像中的每个像素分配一个数字,这个数字反映了像素离最近的突触有多远,算法使用这些数字来识别和标记图像中的所有突触。COSEM算法的工作方式与之类似,但维度更多。研究人员根据每个像素...
“虚拟细胞”或将改变一个领域
理解这个模型的另一种方法是,比如我想要进行一项用荧光蛋白标记细胞的实验,但我没有实际执行那个实验,我手头只有这些非常便宜的明场显微镜图像。所以我要求机器预测这个荧光标记实验的结果。然后,如果我在生成的图像中看到了什么有趣的东西,我就可以去做那个实验,(验证机器的预测结果)。