...复旦大学:通过促进非晶态区域的分子间纠缠实现超强蛋白质基水...
强蛋白基水凝胶可以作为整合功能成分的基质,这已成为提高机械性能的普遍策略。基于蛋白质的水凝胶的大分子结构通常与半结晶聚合物的结构相似。基于这一概念,规则折叠的二级结构,即β-折叠或螺旋,被确定为对蛋白质基水凝胶的机械性能有重大贡献的结晶区域。因此,对于具有明确晶体区域的蛋白质,控制二级结构的状态一直是制...
...等解读AI赋能的蛋白质结构与功能预测及设计丨Cell Press线上讲座
我们致力于拓展蛋白质的拓扑结构,以探索拓扑结构的构效关系以及生物医药应用。利用可基因编码的多肽标签-蛋白质化学反应,通过合理的设计及与蛋白质折叠的结合,我们已经合成了多种具有复杂拓扑结构的蛋白质,包括轮烷、纽结蛋白质、套索蛋白质、蛋白质索烃等。在此基础上,我们发展了单结构域蛋白质的拓扑改造方法,实现了一...
AlphaFold3问世,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构
AlphaFold3在预测类药物相互作用方面实现了前所未有的准确性,包括蛋白质与配体的结合以及抗体与其目标蛋白质的结合。AlphaFold3比PoseBusters基准测试中最好的传统方法准确率高50%,无需输入任何结构信息,这使得AlphaFold3成为第一个超越基于物理的生物分子结构预测工具的人工智能系统。预测抗体-蛋白质结合的能力对...
追问|蛋白质结构预测模型再升级,解锁新功能直接作用药物设计
DeepMind称,AlphaFold-latest可以预测蛋白质数据库(PDB)中几乎任何分子的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)以及含有翻译后修饰(PTM)的生物分子。DeepMind表示,这一模型的扩展功能和性能将加速生物医学领域的突破,推动人类迈向下一个“数字生物学”时代,为疾病通路的功能研究、基因组学、生物可再生材料...
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|蛋白质是具有数亿种不同形状的分子。从在血液中携带氧气到引发化学反应,每一种蛋白质都具有特定的生物功能。功能通常由其形状或结构来定义。(来源:RCSBPDB)当谷歌将这一消息推向世界时,媒体为之疯狂。头条新闻宣称AlphaFold2“将改变一切”。那些毕生致力于研究单个蛋白质结构的蛋白质生物学家担心自己会失业...
揭示蛋白质结构谜团:圆二色谱计算二级结构的方法与意义探析
1.功能和结构关联蛋白质的二级结构与其功能之间存在密切的关联(www.e993.com)2024年9月7日。二级结构元素的类型和相对位置决定了蛋白质的折叠方式和稳定性,从而影响其功能。圆二色谱计算二级结构可以帮助我们理解蛋白质的功能与结构之间的关系。2.结构演化研究通过圆二色谱计算二级结构,我们可以研究蛋白质结构的演化和进化。通过比较不同物种或不...
灵魂追问:胶原蛋白究竟有没有未来?
从学术上讲,完整的结构一定具有完整的功能,部分的结构有可能具有部分的功能。注意,是有可能,同时因为胶原蛋白与皮肤细胞的作用位点是比较明确的,所以必须符合那一段序列才能起效。就是作用的位点是很精确的几个氨基酸,只要位点保留,那这个功能也是存在的。当然这里就需要展开具体的研究。
AlphaFold3迎来革命性进展!国内大佬手把手教授!
蛋白质-蛋白质相互作用预测:深度学习模型可以预测蛋白质和蛋白质之间的相互作用,从而帮助设计新的蛋白质复合物和抗体。蛋白质功能注释和预测:深度学习可以进行蛋白质功能注释和预测,识别蛋白质的功能域、结构域和功能位点等。这有助于预测蛋白质的功能和相应的生物学作用。
FSHW | 鲜食水稻成熟过程中蛋白质结构和功能特性的变化
图3五个成熟时期鲜食水稻食用功能的表征Conclusion鲜食水稻成熟过程中,蛋白质由小分子肽段逐渐结合成大分子肽段;通过凝胶渗透色谱、扫描电镜等仪器分析,五个时期的鲜食水稻蛋白质二级结构均发生了变化,随着成熟期延长,蛋白质中的无序序列含量逐渐下降,有序序列含量逐渐上升;乳熟前期溶解性最好、完熟期的鲜食水稻...
无目的的物理学,如何涌现出有目的生命?
在这个层级结构中,功能涌现于细胞器及以上水平[12]。例如,在人类中,基因调控网络在细胞水平上控制蛋白质的合成,以维系身体并生长;我们大脑中的神经网络处理环境线索,来预测结果并决定我们的行为;心脏将氧气泵送到身体的所有细胞,使我们保持活着(图1),依此类推。通过在长时间尺度上作用的进化过程(如心脏的结构源于...