FSHW | 鲜食水稻成熟过程中蛋白质结构和功能特性的变化
籽粒变硬,这也说明随着籽粒成熟时期的发展,其蛋白质密度升高,肽链之间的氢键增强,进而增强分子间相互作用,更有利于每条肽链进行折叠和螺旋,从而使整个蛋白的有序结构增加,并且蛋白质分子的α-螺旋和β-折叠往往被包埋在多肽链的内部,当有序结构增多,无序结构减少会使蛋白质分子的二级结构更加有序致密且...
汇集结构质谱尖兵,开拓蛋白质结构生物学的新天地——第十四届质谱...
为将蛋白结构质谱技术的应用拓展至生物样本乃至临床样本中,我们针对背景基质复杂、糖基化等修饰异质性高、超大分子量颗粒结构层次多样等问题,以非变性质谱等质谱手段为核心工具开发了一系列组合策略,提供生物样本乃至临床样本中的蛋白高级结构和相互作用关系信息。报告人:中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军报...
深圳湾实验室周耀旗:填补AlphaFold 2缺口,开启所有蛋白质结构的高...
其二,大多数深度突变扫描实验都是通过功能筛选进行的。例如抗生素抗性蛋白、荧光蛋白和具有特异结合性能的蛋白。鉴于数千种蛋白质功能,不可能针对不同的功能开发不同的筛选技术,更不用说并不是所有的蛋白质功能都适合高通量研究。因此,利用人工同源序列进行结构推断,将需要一种技术,它是基于结构稳定性来筛选结构上...
AlphaFold3问世,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构
就在刚刚,GoogleDeepMind发布了AlphaFold3模型,该模型能够对包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物进行联合结构预测。AlphaFold3的准确性对比过去许多专用工具(蛋白质-配体相互作用、蛋白质-核酸相互作用、抗体-抗原预测)有显著提高。这表明,在单个统一的深度学习框架内,可以实现跨生物分子空间的高精...
...技术能够迅速分析和处理大量生物医学数据,预测大分子结构及功能
鉴于AI技术能够迅速分析和处理大量生物医学数据,预测大分子结构及功能,AI已经逐渐渗透到创新药研发的各个环节。目前公司已将AI技术应用到蛋白质的改造过程中,通过协同AI计算和模拟的“干实验”与高通量的“湿实验”,将AI技术与基于力场的计算机虚拟筛选方法结合,不断闭环迭代,从而最终得到具有特异性的蛋白质。比如全能...
从头设计出自然界中不存在的蛋白质,他让人类离“上帝之手”越来越近
这款名为Foldit的游戏由于能帮助学生更好地了解蛋白质的三维性质以及蛋白质结构和功能间的关系,已被一些大学引入课堂(www.e993.com)2024年7月25日。更令人吃惊的是,一些该游戏的高级玩家还曾通过这款游戏破解了一种逆转录病毒的蛋白结构,并将成果发表在了《自然》杂志子刊上。▲Foldit玩家确定M-PMV逆转录病毒蛋白酶结构的过程(图片来源:参考资...
科学家解析光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体结构,助推原核生物光合...
“这些高分辨率的结构,清晰地揭示了光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体(Reactioncenter-Lightharvesting,RC-LH)中所有蛋白质亚基和色素分子的组成和空间排布。而对其理化性质的研究,则进一步扩展了人们对不放氧光合系统的多样性,以及分子进化的认识,有助于通过合成生物学方法,将这一简单独特的光合系统应用于光生物电化...
丛斌:揭示生命本质,要既见树木也见森林
以医学研究的进化过程为例,丛斌院士说明了研究范式转变的重要意义。以往在还原论“范式”的指导下,人们试图通过认识单个基因或蛋白质的结构与功能来阐明个体的生理或病理活动,认为对复杂生命系统的理解可以通过将其拆解为组成的零部件并逐个拿出来进行研究来实现。
站在科学范式转折点上的科学教育
其核心是寻找巨量现象之间的相关性;“第四范式”称为数据科学,从基因测序、蛋白质结构、深空星系到覆盖全球的社交媒体,这些研究对象的复杂性导致单个研究者穷尽一辈子都无法了解其全貌,更有许多超越人类感官能力极限的现象,而人工智能却能够通过机器学习在短时间内把握与分析,因此“第四范式”主要是基于人工智能和...
大火的美拉德反应,竟与衰老相关?清华王钊团队综述,报道美拉德反应...
大量研究发现,MR在导致体内营养物质损失和有毒有害化合物产生的同时,通过几种有害过程促进与衰老相关的组织结构和功能的年龄依赖性衰退。内源性形成的AGEs可能积聚在细胞内和细胞外的蛋白质、脂质和核酸上,并与氧化应激、高血糖和高脂血症等病理变化以及各种炎症有关。