关于举办“第二期基于 AI 的蛋白质结构解析与设计专题(线上)培训...
蛋白质是生命活动的体现者,其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。解析蛋白质的空间结构可以更准确地认识蛋白质的功能、功能的执行、及生物大分子间的相互作用。然而,随着人工智能及大数据的快速发展,蛋白质可以通过人工智能设计从而解锁更多的功能,这在食...
统计物理视角下的 AlphaFold 与蛋白质组研究|周二直播·生命复杂...
我们的比较分析表明,在更复杂的生物体中,蛋白质表现出更大的回转半径、更高的螺旋结构比例、更慢的振动频率,同时具有更复杂的域组织和更高的结构灵活性。通过各种物理分析方法,我们揭示了蛋白质结构特征、动态行为和功能特化如何随着生物体复杂性的增加而演化。通过对AlphaFold数据库中的蛋白质进行统计分析,我们发现...
Nature子刊!清华团队提出蛋白质序列-功能空间压缩的概念
EvoScan可以针对不同的蛋白质相互作用捕获蛋白质锚点,如蛋白质-蛋白质、蛋白质-配体和蛋白质-核酸相互作用。文章中提出的蛋白质序列-功能空间压缩的概念也有望应用于不同种类的蛋白质,并对自然界如何在有限时间内完成蛋白质空间的搜索和物种的高效进化产生一定的启发作用。相关研究成果以“EvoAI实现蛋白质序列空间...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
...Methods | 揭示糖基化奥秘:GlycoShape工具助力精准糖蛋白结构...
Re-Glyco算法:Re-Glyco是GlycoShape的核心算法,用于将糖链连接到蛋白质结构上,以恢复糖基化后的糖蛋白三维结构。用户可以从GlycoShape数据库中选择糖链,并将其连接到蛋白质的特定糖基化位点上,从而模拟糖蛋白的原生功能形式。Re-Glyco算法通过计算蛋白质与糖链之间的空间互补性,来预测糖基化位点是否能够被占据。
...江汉大学王红波副教授等:大豆多糖与纳豆多糖结构特征和主要...
<0.05),多糖纯度提高(www.e993.com)2024年11月24日。胡彦波等研究发现,含少量蛋白质的粗多糖样品对后续抗氧化活性的研究无明显影响。因此,大豆和纳豆的粗多糖样品无需进行后续脱蛋白处理。2大豆多糖和纳豆多糖的结构表征2.1FTIR光谱结果由图1可知,大豆多糖和纳豆多糖具有相似的多糖特征吸收峰,但吸收带强度不同,表明纳豆芽孢杆菌发酵过程中...
讲座预告:植物蛋白的结构功能构效关系及应用开发
报告题目:植物蛋白的结构功能构效关系及应用开发报告人简介:陈凌云,加拿大阿尔伯塔大学教授(加拿大首席科学家)。近五年主持并完成了包括加拿大首席科学家基金和加拿大国家自然科学基金在内的20项科研项目,课题经费400万加元;陈凌云教授对生物质大分子再生资源新材料及蛋白质聚多糖的研究工作已在国内外天然高分子领域形成较...
Cell Press Live:蛋白质结构与功能预测及设计—新闻—科学网
具有非线型复杂拓扑结构的蛋白在大自然中较为少见,大多与特定的功能优势相联系。我们致力于拓展蛋白质的拓扑结构,以探索拓扑结构的构效关系以及生物医药应用。利用可基因编码的多肽标签-蛋白质化学反应,通过合理的设计及与蛋白质折叠的结合,我们已经合成了多种具有复杂拓扑结构的蛋白质,包括轮烷、纽结蛋白质、套索蛋白质...
上海应用技术大学2025考研招生入学考试大纲:338生物化学
2.掌握氨基酸的结构与性质3.掌握蛋白质一级结构4.掌握蛋白质二级、三级和四级结构特点,维持蛋白质空间结构的主要化学作用力5.掌握蛋白质结构(包括一级结构与高级结构)与功能的关系6.掌握蛋白质相关实验技术,如透析、蛋白质变性与沉淀、蛋白质的紫外吸收、双缩脲反应、纸层析、离子交换层析、凝胶过滤层析...
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质是美食的代名词,更是生命功能的物质基础,处处发挥作用:负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由...