Nat Cell Biol | 万刚团队揭示多相凝聚体结构的不混容性调节小RNA...
结合亲和质谱和免疫共沉淀实验发现HERD-1可能通过降低或者阻止Z颗粒的蛋白网络与相邻两个生殖颗粒的支架蛋白(GLH-1和MUT-16)之间的相互作用,促进多相结构的形成。图一HERD-1抑制多相凝聚体蛋白互作网络的模式图最后,为了证明生殖颗粒多相凝聚体结构融合和小RNA信号通路之间的关系,该研究利用GFP融合蛋白-GFP纳米...
Nature Methods:基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动临床...
例如,研究者可以通过该平台假设特定蛋白质的结构与功能关系,从而为自然或合成变异的分子表型提供见解。通过G2P平台,可以方便地检索并可视化基因-蛋白质的映射关系,并且能够将数据下载用于后续分析。这一工具为基因组学与蛋白质结构之间的桥梁提供了极大的便利,为探索与疾病相关的遗传变异的结构功能机制铺平了道路。近...
同时生成蛋白序列和结构,David Baker团队序列空间扩散新模型
蛋白质功能源于序列和结构特征的复杂相互作用;因此,设计新的蛋白质功能需要对序列和结构空间进行推理。许多蛋白质设计方法分步对结构和序列进行采样,通常先生成蛋白质主链,然后使用逆折叠方法生成序列。传统方法,如Rosetta灵活主链蛋白质设计,在结构和序列设计之间交替进行,而最近基于深度学习的方法通常先生成主链,然后...
...等解读AI赋能的蛋白质结构与功能预测及设计丨Cell Press线上讲座
在此基础上,我们发展了单结构域蛋白质的拓扑改造方法,实现了一系列单结构域蛋白质拓扑异构体的选择性合成,并初步探讨了拓扑对构效关系的影响。结果表明,拓扑结构可显著提升蛋白的稳定性和耐酶切稳定性、抗变性、抗聚集能力,提示其在蛋白质药物和工业酶等方面具有广泛的应用前景。进一步地,我们认为可能存在着与目前线...
沃信图文科普:紫外交联仪可用于修复DNA分子中的单链断裂
紫外交联仪可用于交联RNA分子与蛋白质的相互作用、RNA与RNA之间的交联,以及分析RNA序列和形态的相互关系,从而研究RNA的结构和功能。三、其他应用UV灭菌紫外交联仪还可用于UV灭菌,消除PCR等实验中的污染问题,确保实验结果的准确性。RecA突变筛选在分子生物学研究中,紫外交联仪可用于RecA突变筛选等实验,以研究DNA...
关于发布上海市2024年度计算生物学领域项目申报指南的通知
方向2:核酸结构预测和设计优化研究目标:建立自主可控的核酸大语言模型,提升核酸结构与功能的预测精度,核酸设计优化性能相比国际同期最高水平提升5%以上(www.e993.com)2024年10月5日。研究内容:基于大量核酸序列训练数据,开发自主可控的通用核酸序列语言模型,精准预测核酸结构、甲基化修饰、可变剪切等事件,实现RNA病毒演化趋势的预测,以及更高蛋白表达...
AJHG | 首个决定大脑“镜像效应”的基因确定!研究揭示ZNRF3基因...
综上,该研究表明,单个基因中的突变可通过Wnt/β-catenin信号以相反的机制发挥作用,并以蛋白质结构域依赖的方式影响镜像脑大小表型。总研究概要ZNRF3拷贝缺陷的发现大约十年前,一名大脑异常小、言语发育迟缓及外胚层发育不良(一种影响头发、指甲、牙齿和皮肤的先天性疾病)的罕见病患者引起了研究团队的注意,通过DNA...
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
1、基因表达谱分析:通过对基因表达谱数据进行深度学习,可以预测基因功能、发现新的生物标志物和生物路径径。2、结构生物学预测:通过对结构生物学数据进行深度学习,可以预测蛋白质结构、功能和互动。3、生物信息学数据集预处理:通过对生物信息学数据集进行深度学习,可以提高数据质量、减少噪声和缺失值,从而提高预测模型...
2025天津医科大学全国硕士研究生入学统一考试《618生物化学与分子...
掌握目前蛋白质一级结构的测定方法掌握蛋白质结构与功能的关系掌握蛋白质的分离纯化的原则和方法2.核酸化学考试内容核酸的种类和分布及核酸的生物功能核苷酸的结构DNA和RNA一级结构的概念和二级结构要特点;DNA的三级结构核酸的主要理化特性核酸的研究方法...
质谱检测蛋白质:从结构到功能的科学探索新前沿
1.蛋白质结构:蛋白质的结构是其功能的基础,质谱鉴定可以揭示蛋白质的分子量、氨基酸序列和修饰等结构信息。2.蛋白质功能:质谱鉴定不仅可以鉴定蛋白质的结构,还可以探索其功能,如蛋白质的互作关系、代谢途径和生物活性等。二、质谱鉴定蛋白质的方法与技术...