讲座预告:植物蛋白的结构功能构效关系及应用开发
报告题目:植物蛋白的结构功能构效关系及应用开发报告人简介:陈凌云,加拿大阿尔伯塔大学教授(加拿大首席科学家)。近五年主持并完成了包括加拿大首席科学家基金和加拿大国家自然科学基金在内的20项科研项目,课题经费400万加元;陈凌云教授对生物质大分子再生资源新材料及蛋白质聚多糖的研究工作已在国内外天然高分子领域形成较...
丰富的蛋白质结构域,与蛋白质组大小JoelAMalek之间是什么关系
蛋白质中的保守结构域在蛋白质相互作用、DNA结合、酶活性等重要的细胞过程中起着关键作用。由于最近发布的关于人类基因组中基因数量的预测少于之前的许多人的预测,蛋白质结构域之间的相互作用可能被证明是蛋白质组复杂性的核心。蛋白质结构域在许多物种中通常是保守的,因此,它们提供了一个有趣的数据集,用于分析基因...
修饰蛋白质组学:解析蛋白质与修饰之间的关系
蛋白质的结构与功能密不可分,而修饰是调控蛋白质结构的重要手段之一。磷酸化修饰、乙酰化修饰等可以改变蛋白质的电荷状态和构象,进而影响其相互作用和功能。通过修饰蛋白质组学技术,我们能够解析修饰与蛋白质结构之间的关联,深入了解蛋白质结构的多样性及其对功能的影响。3.探索修饰与蛋白质功能的关系蛋白质的功能...
模拟5亿年自然进化史,全新蛋白质大模型ESM3诞生!前Meta老将力作Le...
每个蛋白质的序列、结构、和功能的部分位置会被掩码,模型在训练过程中需要逐渐理解三者之间的深层联系,从而预测掩码位置。如果遮蔽所有位置的标记,就相当于执行生成任务。由于在蛋白质的序列、结构和功能上联合训练,对这三种模态可以任意进行掩码和预测,因此ESM3实现了「全对全」预测或生成(alltoall)。也就是说...
许田:从罕见病研究到批量转化数十亿美元项目,我和同学是如何做到的?
同样的道理,这位2013年就开始拥抱人工智能的生物学家认为:当红的蛋白质结构预测工具AlphaFold并不会令真正的结构生物学担忧,因为结构功能之间关系的背后有很多生物学的东西,不是简单预测个结构就能完成的事情,而且大量的结构解析能够推动产业化的应用。目睹了技术的进步只用了十多年的时间把约100亿美元才测得人类...
Cell|上科大免化所团队揭示冠状病毒同时挟持细胞糖受体和蛋白受体...
通过对不同状态下的结构分析,发现冠状病毒刺突蛋白不仅可以分别识别宿主细胞表面的糖受体与蛋白受体,而且病毒与这二者的识别出人意料地展现出协同过程,大大促进了病毒入侵宿主细胞的效率(www.e993.com)2024年7月24日。该协同作用具体表现为(图1):病毒刺突蛋白与糖受体结合被激活,并展示出“up”构象,暴露出与蛋白受体结合的功能区,促使其与蛋白...
追问daily | 观看他人的偏见行为会无意识地形成偏见;全新的面部...
肝素硫酸修饰蛋白是一类在细胞表面和细胞间基质中发现的蛋白质,它们通过附着糖聚合物肝素硫酸来组装信号复合物,影响细胞生长和细胞与环境的相互作用。这些信号通路还调节自噬,即一种清除细胞内受损或功能失调成分的细胞修复过程。在阿尔茨海默病的果蝇模型中,研究团队发现,通过减少肝素硫酸链的功能,可以抑制神经元死亡并...
专访Generate:融资超7亿美元的AI蛋白质独角兽,如何炼成的?
Generate:Biomedicines成立于2018年,旨在通过人工智能(AI)技术来理解蛋白质序列、结构与其功能之间的关系,从而从头设计前所未见的全新蛋白质。2022年底,GenerateBio公司开发出的Chroma模型引发了行业的震动,首次大规模将扩散模型用于精确的蛋白质设计,能够生成“自然界中完全不存在的蛋白质。”...
灵魂追问:胶原蛋白究竟有没有未来?
从学术上讲,完整的结构一定具有完整的功能,部分的结构有可能具有部分的功能。注意,是有可能,同时因为胶原蛋白与皮肤细胞的作用位点是比较明确的,所以必须符合那一段序列才能起效。就是作用的位点是很精确的几个氨基酸,只要位点保留,那这个功能也是存在的。当然这里就需要展开具体的研究。
重大突破!谷歌AI模型登《自然》期刊
据DeepMind此前表示,在短短3年里,阿尔法折叠2已被180万研究人员使用,绘制出约600万种不同的蛋白质结构。但这些图是单个静态蛋白质的图像,不包含细胞内部发生的化学通讯。“生物学是一个动态系统,”DeepMind首席执行官戴密斯·哈萨比斯解释,“你必须了解细胞中不同分子之间的相互作用如何产生生物学特性。”...