AI革新:蛋白质设计新突破,助力癌症与痴呆症研究
然而,结构生物学领域历来专注于研究折叠成稳定3D结构的蛋白质和核酸,目前对蛋白质在细胞中如何发挥功能的理解大多基于“序列-结构-功能”关系这一概念。而真核生物中约有30%的蛋白质并不折叠成稳定的3D结构,这些动态变形的蛋白质就是IDPs,或者当它们位于其他结构化蛋白质域的背景下时,被称为“固有无...
重磅突破!AI 填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制...
然而,结构生物学领域历来专注于研究折叠成稳定3D结构的蛋白质和核酸,目前对蛋白质在细胞中如何发挥功能的理解大多基于“序列-结构-功能”关系这一概念。而真核生物中约有30%的蛋白质并不折叠成稳定的3D结构,这些动态变形的蛋白质就是IDPs,或者当它们位于其他结构化蛋白质域的背景下时,被称为“固有无...
1448789-45-4;diSulfo-Cy5 NHS ester的特点和性质
Cy5核心结构:Cy5是氰二亚甲基系列的荧光染料,具有长的共轭体系,提供强烈的远红外荧光。两个磺酸基团:两个磺酸基团(-SO??H)增强了染料的水溶性,使其在水相环境中稳定存在。NHS酯基团:NHS酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯)是一种常用的活化酯基团,能够与氨基反应,形成稳定的酰胺键。光学性质吸收波长:Cy5的吸收...
人工智能首次预测蛋白质“光学指纹”
科技日报合肥6月9日电(记者吴长锋)记者从中国科大获悉,该校微尺度物质科学国家研究中心江俊教授与其合作者合作,通过利用人工智能机器学习中的神经网络技术,模拟了蛋白质肽键结构与性质之间的构效关系,大大降低了计算量,为预测蛋白质的光学特性提供了一种高效的工具。相关成果日前发表在《美国科学院院报》上。蛋白...
重磅突破:AI 填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制...
他们设计了具有特定结构性质的蛋白质变体的通用算法。该算法利用粗粒度模拟和自由能计算,结合蒙特卡洛采样方法,在序列空间中进行搜索,生成具有目标结构特征的蛋白质序列。研究人员使用该算法设计了多种蛋白质变体,并对其进行了实验验证,结果表明该算法能够有效地设计具有不同紧密度、长程相互作用和相分离倾向的蛋白质变体。
从图神经网络到几何深度学习:AI4Science的下一个颠覆性突破在何处?
对于第一张照片这种2D图像,我们希望对象在图片中的位置不影响所设计的机器学习方法对它的识别,例如经典的卷积神经网络(ConvolutionalNeuralNetworks,CNNs)就可以不受它所在位置的影响,提取出歌剧院的总体特征(www.e993.com)2024年9月7日。对于分子结构数据,这种具有关系属性的数据,其特点在于这些节点之间有着一些特殊的几何关系或者是空间结构...
2024年动物源食品科学与人类健康国际研讨会-李士明教授:海参皂苷
海参皂苷的结构与活性功能因为海参营养价值很高,它又是传统的食用和药用海洋资源。海参含有丰富的皂苷、蛋白质、多肽、糖类、脂肪酸、维生素和多种微量元素。具有抗癌、抗凝血、抗细菌和真菌、防止氧化等生理活性。海参皂苷是海参的主要活性物质之一。海参皂苷是海参特有的三萜化合物,其结构复杂性在于其苷元环上的取代...
基于几何图学习的物理系统建模:从动态系统到复杂系统
静态复杂系统一个明显例子是对蛋白质结构进行建模,代表性的模型有AlphaFold,RoseTTAFold等等;动态系统则是研究某种分子/粒子的轨迹,或者对其动态特性进行研究,如分子动力学模拟。当然,这个划分只是为了方便研究,在真实场景下是二者皆有的,比如对蛋白动态对接的过程进行研究,这既要对蛋白结构进行建模(静态),也要对分子...
上海交大夏小霞教授/钱志刚研究员AFM综述:人工蜘蛛丝材料的创制
介观组装:过程精细,排列有序介观层面的材料组装不仅涉及蛋白质分子如何相互作用和构建更高级别的结构,还涉及如何利用这些结构来实现和优化特定宏观性质,例如力学强度、韧性和生物相容性。因而缺乏对亚微米级组装的理解会在微观分子和宏观材料之间造成脱节。文章总结并展望了这些组装过程及其对人造蜘蛛丝最终性能的调控作用...
浙江海洋大学房传栋博士等:不同添加物结合真空渗透处理对冻藏虾仁
蛋白质的表面疏水性可反映蛋白质分子表面疏水性残基的相对含量,其出现变化说明蛋白质表面性质发生改变,故而可用其定量分析蛋白质的结构变化。由图4可以看出,在90d冻藏期间,虾仁肌肉中肌原纤维蛋白的表面疏水性持续上升。这可能是由于冻藏期间,肌原纤维蛋白发生冷冻变性,埋藏在内部的部分疏水基团被暴露出来,致使表面疏...