Cancer Cell | 钱丹雯等绘制肿瘤内B细胞的单细胞RNA测序全景图谱
研究人员利用单细胞RNA测序技术,对七种癌症类型中的肿瘤浸润B细胞和浆细胞进行了深入的分析和图谱构建。研究基于15个不同研究的数据源,鉴定出10个肿瘤浸润B细胞表型,包括四个B细胞簇、四个浆细胞簇和两个具有增殖和生发中心特征的过渡细胞簇。这些细胞簇分别展现了从初始B细胞到记忆B细胞,再到浆细胞的不同分化阶段...
CRISPRa与单细胞RNA测序:细胞调节模式的深度解析
一种新方法将多重基于CRISPR的基因激活(CRISPRa)与单细胞RNA测序(sc-RNA-seq)相结合,以识别以细胞类型特异性方式控制基因表达的顺式调节元件。美国研究人员将这种新方法应用于慢性粒细胞白血病细胞(K562)和iPSC衍生的兴奋性神经元,揭示了细胞类型之间的不同调节模式。2、文章题目:Highlyefficient...
肺发育的奥秘,快来了解下吧!Cell Research,单细胞RNA测序解锁肺...
单细胞RNA测序技术能够帮助科学家们识别肿瘤微环境中的细胞异质性,这对于理解癌症的发生发展机制至关重要。通过分析肿瘤细胞及其周围非肿瘤细胞(如免疫细胞、成纤维细胞等)的基因表达谱,研究人员可以发现肿瘤细胞如何逃避免疫监视,以及它们是如何与周围的微环境相互作用以促进肿瘤生长。此外,空间转录组技术还能提供这些细胞...
【9月25日直播预告】解锁单细胞奥秘,洞察生命微观世界
告别传统的批量细胞基因表达分析,单细胞测序让我们得以见证细胞多样性的真正复杂性。2024年9月25日,下午两点10xGenomics携手生物谷倾情呈现——单细胞测序入门大讲堂!在这次精心筹备的系列网络研讨会中,您将获得:单细胞分析产品选购指南,助您轻松选择最适合的研究工具单细胞基因表达研究的经费申请资源,助力您的...
单细胞蛋白质组测序原理
单细胞蛋白质组测序是一种基于质谱分析的方法,用于分析单一细胞中的蛋白质组成。它旨在揭示单细胞水平上的蛋白质异质性,并提供关于生物过程、疾病状态和药物响应的更深入理解。一、细胞分离首先,需要获得单一细胞。这通常通过流式细胞仪或微流控设备完成,这两种设备都可以对单一细胞进行排序并分离出来。
这秘密总算藏不住了!Cancer Cell|单细胞RNA测序与多重荧光免疫组...
研究者基于对单细胞测序结果的分析,描绘了ICI治疗前后pCR患者和非pCR患者肿瘤微环境的变化,这需要进一步的组织学验证,为此,研究者还采用了多色免疫荧光技术进行多重免疫组化(mIHC)技术,检测了ICI治疗前后pCR患者和非pCR患者多种肿瘤微环境细胞在肿瘤组织中的分布(图4C、5E、7D),得到了与scRNA-seq一致的结果(www.e993.com)2024年10月18日。相比于...
ATVB 蔡哲钧/宋伸/宋江平/杨劲合作利用单细胞转录组测序解析小鼠...
图5.在弹性蛋白酶诱导后,腹主动脉组织中的中性粒细胞簇发生变化图6.腹主动脉瘤相关的炎症将4种不同的B细胞亚群招募到微环境中为了揭示炎症细胞之间的调控路径,研究人员应用CellChat分析,对小鼠单细胞测序数据进行分析,确定了不同时间点AAA组织中的细胞间相互作用。结果表明,炎症细胞在AAA诱导后的相互作用不...
用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质
彭广敦,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员,国家高层次青年人才、广东省杰青。课题组主要研究方向是利用单细胞测序、单细胞谱系示踪、生物信息学以及高通量、高精度原位空间多组学技术来揭示在体多能干细胞在器官发育、疾病与组织再生中的分子谱系。
单细胞测序之后再怎么做?这篇文章告诉你答案
01单细胞测序揭示巨噬细胞异质性研究者首先通过单细胞测序和流式细胞术发现了小鼠胚胎肝脏中除了数量最多的EI巨噬细胞亚型外,还存在3种其他的亚型,这些巨噬细胞亚型存在不同的基因表达谱特征。02单细胞测序配-受体分析揭示巨噬细胞和HSC存在紧密的细胞-细胞交流...
系统学习单细胞多组学、空间转录组和机器学习单细胞分析应用线上...
2.单细胞转录组测序技术发展及其原理3.单细胞转录组样本处理、建库及测序4.单细胞组学在肿瘤、发育、免疫等科研领域的应用及研究思路5.单细胞测序常用图表解读第二节课:R语言入门及图形绘制1.R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明2.多种来源R包的安装及使用...