博格隆(Bestchrom)丨寡核苷酸药物纯化策略

主要表现为单个或多个寡核苷酸的差异(N-x/N+x),保护基团的保留,例如DMT+、3'+产物,以及嘌呤的脱除等。这些基团或者序列的改变会导致杂质分子与目标产物之间存在性质上的差异。主要表现为:??磷酸基团(Phosphategroup):寡核苷酸所带静电荷取决于磷酸或修饰基团的数目、碱基的数目以及二级结构是否遮蔽带电基团。...

这篇Nature系列综述,发人深思,“聚合”和“解聚合”中的“水”!

在现代生命体中,核苷酸的活化和缩合反应,特别是如何将核苷酸转化为活化的核苷酸-5'-磷酸这个过程涉及到使用三磷酸核苷(NTPs),它们结合了热力学激活和动力学稳定性,使得聚合反应可以被催化控制。然而,在非酶催化的条件下,如何实现这一步骤仍然是一个未解决的问题。在水溶液中进行的核酸合成的同样具有挑战性,包括如何...

Annu Rev Biochem综述丨饶枫团队等系统总结焦磷酸肌醇作为一种多...

PPIP5Ks则通过调节新核苷酸的生物合成,影响细胞生长和增殖。此外,PP-IPs在高能挑战下的动态变化也表明其在能量平衡和代谢调控中的重要性。这些发现为焦磷酸肌醇代谢酶作为代谢调节剂的功能提供了新的见解。5.靶向焦磷酸代谢激酶的药物开发潜力针对焦磷酸肌醇代谢酶的药物开发显示出巨大的潜力。IP6K抑制剂,如TNP和...

...Chemical Biology | 叶存奇课题组发现磷脂合成调节核苷酸…

在核苷酸酶的底物抑制效应下,Kennedy通路缺陷促使细胞激活补偿机制,进行从头核苷酸合成。这种依赖于磷酸戊糖途径的从头核苷酸合成促进了还原型辅酶NADPH的产生,进一步提升谷胱甘肽合成;同时,Kennedy通路的缺陷会让细胞更依赖于PE甲基化的过程来合成PC,而这一反应所具备的甲基吸收池(methylsink)功能也将协调促进谷胱甘肽的合成...

NAT CHEM BIOL | 浙江大学叶存奇课题组发现磷脂合成调节核苷酸...

这一通路因EugeneP.Kennedy而命名为Kennedy通路。另一种策略是CTP激活脂溶性前体磷脂酸(PA),将其转变为胞嘧啶核苷二磷酸-甘油二酯(CDP-DAG),这种激活态的脂质可以与多种头部基团前体代谢物反应,合成不同种类磷脂。本项研究中,作者以真核模式生物酿酒酵母为研究模型,发现CTP在参与磷脂合成过程时,自身实现了循环...

【前沿进展】Annu Rev Biochem综述丨饶枫团队等系统总结焦磷酸...

它由肌醇(一种环己基己醇化合物)通过磷酸基团取代其羟基形成(www.e993.com)2024年11月12日。焦磷酸肌醇的两个主要形式是5-IP7和IP8,分别由六磷酸肌醇激酶(IP6Ks)和七磷酸肌醇激酶(PPIP5Ks)合成。PP-IPs在细胞和生理功能中的多种作用模式,包括作为能量调节剂、磷酸供体、空间变构体调节剂和G蛋白偶联受体信使等,正在逐步被揭示。它们的...

Nat Chem Biol | 叶存奇课题组发现磷脂合成调节核苷酸代谢和细胞...

这一通路因EugeneP.Kennedy而命名为Kennedy通路。另一种策略是CTP激活脂溶性前体磷脂酸(PA),将其转变为胞嘧啶核苷二磷酸-甘油二酯(CDP-DAG),这种激活态的脂质可以与多种头部基团前体代谢物反应,合成不同种类磷脂。本项研究中,作者以真核模式生物酿酒酵母为研究模型,发现CTP在参与磷脂合成过程时,自身实现了循环...

国际要闻回顾

生命出现前的化学环境成功模拟美国斯克里普斯研究所科学家新发现了一种合理途径,可以说明原始细胞如何形成并实现其多种功能。研究表明一种称为磷酸化的化学过程(将磷酸基团添加到分子中),远比此前认为的要更早发生。这导致结构更复杂的双链原细胞能以多种功能分裂,为生命奠定了基础。

癌症生物学系列:癌症中的细胞信号网络

PIP2经PI3K修饰后变成了PIP3。PIP3的肌醇头部在3,4,5位都带有一个磷酸,似乎是磷酸化肌醇最重要的组成基团。许多与PIP3作用的胞浆蛋白都有一个pleckstrin同源(PH)结构域,这个结构域对三磷酸化的肌醇头部有很强的亲和力。Akt又称为蛋白激酶B(PKB),是一种含有PH结构域的丝氨酸/苏氨酸激酶。PI3K催化PIP3生成一...

【科技前沿】Nature | 高璞/张立国/高昂等揭示环二核苷酸和叶酸的...

CDN二聚体单元呈现碱基在中间、磷酸糖环在两端的构象,这种特殊的组装方式依赖于两个CDN碱基间的堆叠和氢键互作,以及碱基与磷酸基团之间的氢键互作。虽然不同CDN的结合模式大致类似,但它们各自的二聚体单元却存在明显的构象差异,这反应了SLC19A1对不同CDN具有广泛的包容性。由于CDN二聚体所占据的空间相较单体更大,...