??研究蛋白质热稳定性的几种方法
蛋白跟核酸不一样,核酸都是由四个碱基组成,只是组成的顺序不一样,但是整体的结构都是类似的双螺旋结构。而蛋白由20多种不同氨基酸组成,需要折叠成正确的三维结构才能发挥自身作用。所以每个不同功能的蛋白长得样子其实都是不同的。蛋白的高级结构决定其功能,行使功能需要正确折叠。蛋白由20多种不同氨基酸组成,需要...
测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?
这些dNTP底物在其磷酸基团上被标记四种不同颜色的荧光基团,分别代表四种碱基。反应时,当一种与正要合成的碱基一致的dNTP经过时,就会被酶较长时间地抓住。激发光从小孔的底部照进来,打在被抓住的dNTP上,就会发出荧光,仪器根据拍到的荧光颜色,就可以判断是哪种碱基了。由于测序小孔直径很小,激发光的穿透能力会逐渐...
华大发布新型纳米孔基因测序仪,长短读长牵手捅破市场天花板
简单来讲,二代测序是将长的DNA碎片化,然后固定在不同材质表面做DNA扩增,从而放大信号强度,并使用不同荧光基团标记4种碱基,通过荧光信号来确定碱基序列。而纳米孔测序仪的工作原理,是由马达蛋白牵引单链DNA通过纳米尺寸的孔,记录不同碱基通过监测电流信号的变化,就可以确定过孔碱基的序列。在二代测序技术的开发...
科研进展 | 中科院高福团队:m-AMSA抗非洲猪瘟病毒pP1192R双功能...
对于这两个位点,m-amsa的平面吖啶发色团通过范德华作用和π-π相互作用平行插入碱基对,其位置与先前在m-amsa毒化的人类Topi-β结构中显示的位置相同,消除了碱基对之间的堆叠相互作用。虽然吖啶发色团主要介导m-AMSA与插入位点两侧DNA碱基的相互作用,但甲磺酸-间甲氰胺基团也参与药物-DNA相互作用,特别是...
这些动物模型,为小核酸药物再添一场东风
还有一类可以用来递送RNA的聚合物称为树枝状大分子(dendrimers),它们以一个核心分子为中心,通过聚合反应重复增长合成树枝状的聚合物,树枝上修饰有阳离子基团,可以与带负电RNA生成复合物。这种结构可以将RNA递送到中枢神经系统,将siRNA递送到肝脏内皮细胞中,还能用于肌肉注射,并且这种树枝状大分子的结构可不易被降解,...
与mRNA的故事,诺奖得主、“屠夫女儿”考里科中文自传出版
DNA的结构是双螺旋(就像一个螺旋楼梯,有两条脱氧核糖磷酸的“扶手”和由两个碱基配对连接形成的每个“梯级”),但大多数RNA只是一条单链——就像一排楼梯被电锯垂直向下切掉了一半(每个梯级只有一个碱基)(www.e993.com)2024年9月20日。此外,RNA“扶手”中的核糖分子具有游离羟基,可以与连接核苷的磷酸基团相互作用。这些相互作用会破坏RNA的长链...
PCR反应的几大要素(各组分和条件)
图3:缓冲液离子对DNA双链形成的影响。钾离子和镁离子(K+和Mg2+)能够与DNA骨架上的磷酸基团(P–)结合并稳定双链形成,而铵离子(NH4+)能够与碱基(N)之间的氢键相互作用并破坏双链形成。由于Mg2+与K+具有相似的稳定效应,因此,当使用KCl缓冲液时,MgCl2的建议浓度通常较低(1.5±0.25mM),当...
张锋最新综述论文:系统总结基于CRISPR的基因编辑工具及其递送载体
一类主要的化合物是阳离子聚合物,其中包含一个带正电荷的基团,与核酸的阴离子磷酸二酯骨架静电相互作用。这类化合物的化学成分多样,包括支链酯胺,它将编码Cas9的DNA递送至细胞系;螺旋多肽,例如PPABLG,可以递送编码Cas9和sgRNA的质粒DNA,对小鼠进行基因编辑;以及聚胺酯(PACE)可在体内递送mRNA。
维生素C参与产生一种全新的DNA修饰
进一步的研究表明,这两种新修饰都是在5mC的甲基碳上增加了一个甘油基,二者由于空间结构的差异而互为立体异构体,因此将其统一命名为5-甘油基-甲基胞嘧啶(5gmC)。这也是除了目前已知的5mC、5hmC、5fC、5caC、6mA、5hmU和baseJ以外,在真核生物中发现的第8种DNA碱基修饰。更加意外的是,在研究5gmC上甘油基...
法医DNA检测:下一个爆发的蓝海,百亿市场可期
基于荧光标记和可逆保护基团的聚合酶延伸的Solexa技理术具有边合成边测试和实时监测的特点,是目前应用最广泛的NGS测序技术,占据了NGS测序仪市场约70%的市场份额。IonTorrent技术基于的是半导体测序原理,其对于连续碱基的检测易产生系统误差,因此用量较少。CompleteGenomics采用的是cPAL(复合探针-锚定分子连接)技术,该技术...