蛋白质组学驱动精准医学加速发展
“蛋白质对生命活动的作用更加直接。”国家蛋白质科学中心(北京)教授秦钧说,作为生命活动的直接执行者,蛋白质组学在医学上的应用可以展现出比基因组学更大的优势。当前,对于临床样本的蛋白质组检测,已经实现微量样本短时间内对上万个蛋白质的检测,蛋白质组学技术已经具备应用于临床样本的条件。“通过早期肝细胞癌蛋...
Nat Commun:郁金泰/程炜/冯建峰团队构建首个基于蛋白质组学的多...
“本研究的结果非常令人兴奋,我们发现蛋白质组学数据可以对多种疾病和死亡风险具有很好的预测效能,并且在相当一部分疾病中蛋白质的预测表现显著优于既往临床预测指标。这一结果证明蛋白质组学是未来精准医疗的绝佳切入点,让人对其未来的应用前景充满希望,一滴血预测未来疾病风险或将真的实现。”本研究的共同通讯作者,我...
大咖面对面|高友鹤:尿液蛋白质组学 实现更早期的诊断
生物标志物是与机体生理及病理状态相关的可监测到变化的生化指标,蛋白质组学是精准医学中生物标志物研究至关重要的一环,其最终目的也是为了指导临床,服务精准医学。尿液可以被连续、大量、重复收集并便捷、稳定地保存,且组分相对简单,易于分析,是理想的标志物研究样本。我们邀请了20余年来一直从事尿液蛋白质组学研究...
代谢组学、单细胞蛋白组学……ASMS2024上这些质谱新技术值得关注
适用于6545XTAdvanceBioLC/Q-TOF的AgilentExD池可增加电子捕获解离(ECD)功能,助力肽和蛋白质表征。ECD特别适合用于研究大分子蛋白质、易损修饰和异构体残基——仅使用传统的碰撞诱导解离(CID)方法难以明确表征这些分析物。结合6545XT本身就有的完整蛋白质分析能力,ExD池还适用于对较大的和高电荷的蛋白质(如...
Cell | 上海药物所合作绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
而蛋白质作为生命功能的执行者,是95%以上药物的作用靶点,目前尚缺乏从蛋白质组层面对小细胞肺癌进行系统研究,因此,全面系统地表征小细胞肺癌的蛋白质组学图谱,有利于深入理解小细胞肺癌的病理机制,对于实现更精准的小细胞肺癌分子分型和个性化治疗具有重要意义。
学科前沿 | 上海药物所周虎课题组合作绘制小细胞肺癌蛋白基因组学...
而蛋白质作为生命功能的执行者,是95%以上药物的作用靶点,目前尚缺乏从蛋白质组层面对小细胞肺癌进行系统研究,因此,全面系统地表征小细胞肺癌的蛋白质组学图谱,有利于深入理解小细胞肺癌的病理机制,对于实现更精准的小细胞肺癌分子分型和个性化治疗具有重要意义(www.e993.com)2024年10月16日。
【学会动态】第三届中国生物物理学会代谢组学分会年会在厦门成功...
税光厚教授利用多组学分析现功能脂质进行脂质代谢调控新发现。以果蝇作为研究模型,构建精确定量代谢组学的分析方法(关注功能脂质组学-蛋白质组学-代谢组学-遗传筛选),研究鞘磷脂的代谢通路。白玉教授基于多组学对偏头痛患者进行代谢特征研究,聚焦色氨酸和短链脂肪酸代谢通路,使用随机森林模型,构建对肠道菌群+粪便代谢物...
阻击超级细菌 我科学家从抗菌肽找到思路
日前,中科院昆明动物研究所天然药物功能蛋白质组学课题组赖仞研究员和张治业副研究员等人设计改造了一种强抗菌活性、高稳定性和低毒性的抗菌肽——ZY4,为应对当前越来越严重的耐药性鲍曼不动杆菌和绿脓杆菌的传播及感染问题提供了良好的候选药物分子,也为设计高效低毒的抗菌肽提供了参考新策略。研究成果在线发表于《...
追问|通过监测血液中这三种蛋白质,能提前15年预测痴呆?
澎湃科技:研究使用了人工智能算法对蛋白质组学进行了分析,能否介绍一下?郁金泰:本研究采用的人工智能算法为轻量级梯度提升机(lightgradientboostingmachine,LGBM)机器学习算法。LightGBM是一种基于梯度提升框架的机器学习算法,使用LightGBM模型计算SHAP(ShapleyAdditiveexPlanations)值,并使用shapviz包中的可视化...
通过监测血液中这三种蛋白质,能提前15年预测痴呆?—新闻—科学网
郁金泰:本研究的主要优势在于创新的数据驱动的蛋白质组学策略,基于迄今为止最大的前瞻性的基于社区的长期纵向随访队列,我们从1463个血浆蛋白中发现了预测痴呆发病的重要血浆生物标志物。联合单个血浆蛋白与基本人口学指标,即可以很好地预测未来痴呆的发病风险。