Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
蛋白质与DNA的结合特异性预测是一项复杂但至关重要的任务,对于理解基因调控具有重要意义。通常情况下,蛋白质-DNA复合物会与特定的DNA靶位点结合,而蛋白质会以不同的结合特异性与多种DNA序列结合。为了捕捉这种信息,8月5日NatureMethods的研究报道“Geometricdeeplearningofprotein–DNAbindingspecificity”,...
从肽图中窥探生物药物的奥秘:蛋白质肽图分析的重要性与应用
蛋白质是生物体内功能最为重要的分子之一,对于生物药物的研究和开发具有重要意义。蛋白质的肽段覆盖率是评估其结构和功能的关键指标之一。通过对蛋白质的肽图进行分析,我们可以深入了解蛋白质的构象、翻译后修饰和相互作用等信息,从而揭示生物药物的奥秘。本文将详细探讨蛋白质肽图分析的重要性与应用,为读者呈现一篇既富...
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种蛋白质氨基酸和翻译后...
单分子蛋白质测序技术可以提供更高的灵敏度和准确度,有望助力单细胞蛋白质组学的发展。2023年,Nature杂志将单分子蛋白质测序技术评为未来一年对科技创新产生巨大影响的七项新技术之一。相比于核酸的4种核苷酸基本单元,蛋白质由20种氨基酸组成,具有更复杂的化学多样性。无论采取哪种读出方式,检测20个可区分的信号本...
Nature | 何裕隆/张常华团队揭示乳酸通过NBS1蛋白乳酸化修饰在DNA...
研究发现NBS1蛋白可与MRE11和RAD50蛋白形成一个MRE11-RAD50-NBS1(MRN)复合物,在DNA的复制和DNA双链断裂的修复等过程中起重要作用,主要包括DNA双链断裂部位的识别和启动HRR。乳酸化修饰质谱提示NBS1蛋白存在乳酸化修饰,且NBS1蛋白乳酸化修饰在耐药的肿瘤细胞系中显著上调。乳酸可进一步增强NBS1蛋白的乳酸化修饰。
《食品科学》:哈尔滨工业大学王振宇教授等:食源性蛋白酪氨酸磷酸...
蛋白质磷酸化在细胞周期、生长、凋亡和信号传导等过程中起着重要调控作用。在体内,pTyr是动态可逆过程,是由特异性蛋白质酪氨酸激酶(PTKs)和蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTPs)平衡调控的。蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)是一种在胰岛素靶向组织中普遍表达的细胞内非受体型PTPs,是PTPs超家族中的一员。自PTP1B被发现以来,它...
国自然:热门的蛋白翻译后修饰(糖基化、SUMO化)标书撰写技巧教学
O-GlcNAc糖基化修饰:是一种动态可逆的糖基化修饰过程,涉及将N-乙酰葡萄糖胺(O-GlcNAc)添加到蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基上(www.e993.com)2024年9月7日。这种修饰可以影响蛋白质的功能、稳定性和细胞内定位。SUMO化:是一种类似于泛素化的翻译后修饰,涉及将小分子泛素样修饰蛋白(SUMO)共价地附加到目标蛋白质上,影响其功能、定位和蛋白...
4D蛋白质组学解析:从静态到动态的生物大数据分析
通过结合静态和动态分析,我们可以更全面地了解蛋白质组的复杂性和功能。这在生物医学研究中具有重要意义,特别是在疾病诊断、治疗策略制定和药物研发中。例如,在癌症研究中,4D蛋白质组学分析可以帮助我们揭示肿瘤发展过程中蛋白质表达和相互作用的动态变化,为个性化医疗提供基础。尽管4D蛋白质组学在生物大数据分析中...
【科学普及】蛋白质糖基化与疾病
蛋白糖基化的角色意义在许多重要的生物学过程中,蛋白糖基化都扮演着关键角色。例如:细胞信号传导调节一些细胞信号分子(如生长因子、激素等)与蛋白质结合时可能会发生糖基化,这会影响它们在细胞内的传递和作用。这种糖基化修饰可以改变蛋白质的活性、稳定性和降解速率,从而调节细胞的功能和代谢。
iMetaOmics | 张勇/李福平-先进糖蛋白组学在男性生殖研究中的潜在...
糖基化修饰在男性生殖的生理和病理过程中发挥着关键作用。它影响着成千上万的蛋白质,并在生殖的所有阶段,包括精子生成、成熟、获能和受精过程中,持续进行。尽管糖基化修饰的重要性不言而喻,但人们对男性生殖过程中的糖基化修饰理解仍然有限,这在很大程度上是由于在糖蛋白组学领域遇到的技术障碍。最近的进展已经实现...
蛋白翻译后修饰(PTM)研究超全指南(上)
蛋白翻译后修饰(PTM),如磷酸化、泛素化、乙酰化、SUMO化等,在细胞信号转导、蛋白稳定和转换、蛋白识别和相互作用、空间定位等方面发挥着重要作用,具体功能如下:表1:不同类型PTM的功能和特点多项研究表明,PTM的失调与癌症、心力衰竭、神经系统和代谢疾病等息息相关。鉴于PTM对于疾病治疗和药物开发的重要性,因此小...