基于171种猴痘病毒蛋白质的完整单点突变图谱,探索潜在疫苗及药物...
pLDDT是检查预测结构质量的另一个指标,研究团队收集了171种蛋白质中所有氨基酸的pLDDT,其中有75.5%的pLDDT值非常高或很高(图2C)。结构中的螺旋(coil)是蛋白质紊乱的指标,研究团队还分析了所有氨基酸的二级结构,发现coil仅占24.9%。现有的实验结构、pLDDT值和二级结构分析表明,预测结构的质量良好,可用于预测MPXV...
...郑州大学张毅团队揭示提高癌症免疫治疗效果的新靶点——PLPP1
肿瘤组织内的CD8+T细胞表达的磷脂磷酸酶1(PLPP1)减少,而PLPP1负责催化PE和PC的合成。特异性敲除CD8+T细胞中的Plpp1基因会损害其抗肿瘤免疫功能,并通过铁死亡促进CD8+T细胞死亡。肿瘤微环境(TME)中的不饱和脂肪酸刺激Plpp1??/??CD8+T细胞的铁死亡。从机制上来说,CD8+T细胞中的PD-1信号通路导致GAT...
山东大学王旭《AFM》:受关节软骨启发的持久润滑水凝胶
ε-PL是一种独特的多氨基酸,通过肽键将L-赖氨酸的羧基与其ε-氨基连接而合成,具有典型的生物相容性、热稳定性和抗菌能力。该分子具有独特的结构,可以促进氢键、疏水和库仑相互作用,从而与脂质形成潜在的非共价键,从而扩大了其在生物材料中的应用范围。该水凝胶的合成过程包括将HEMA、MBAA、ε-PL和I2959的精确共混,...
Immunity:提高T细胞抗肿瘤功能,郑州大学张毅团队揭示磷脂代谢的...
用PD-1单抗阻断PD-1信号,可增加PLPP1的表达,恢复CD8+T细胞的抗肿瘤功能。同时,研究还发现PLPP1表达水平与PD-1单抗治疗疗效正相关。▲研究示意图:(左)PD-1通路激活,抑制PLPP1表达,导致T细胞发生铁死亡,抗肿瘤功能降低;(右)PD-1单抗增强了PLPP1表达,提高T细胞抗肿瘤功能(图片来源:参考资料[1])张毅教授表...
Plant Physiol | 西北农林科技大学王晓峰团队揭示番茄BR信号调控...
质谱分析发现SlBIN2s主要磷酸化SlBIML1的Ser136、Ser262、Thr266和Thr280氨基酸位点。将上述氨基酸残基突变为模拟非磷酸化形式的丙氨酸,发现这四个磷酸化位点对于SlBIML1的蛋白稳定性十分重要,其中Thr266和Thr280位点突变以后还会影响SlBIML1的转录活性。通过观察自身启动子驱动的SlBIML1位点突变回补转基因植株的表型,...
ALPPL2/ALPP: 具有肿瘤特异性的潜力靶点
人碱性磷酸酶包括:肝/骨/肾碱性磷酸酶(ALPL)、肠道碱性磷酸酶(ALPI)、胎盘碱性磷酸酶(ALPP)和生殖细胞碱性磷酸酶(ALPPL2/ALPG)(www.e993.com)2024年10月20日。ALPPL2和ALPP在氨基酸序列上几乎相同(同源性98%),两者与ALPI具有高度同源性(87%同源性),与ALPL具有一定的同源性(57%同源性)。
少吃一种氨基酸或可延年益寿?Cell子刊发出最新证据 | 热心肠日报
少吃一种氨基酸或可延年益寿?Cell子刊发出最新证据|热心肠日报Cell子刊:少吃异亮氨酸或助健康长寿?CellMetabolism——[29]①异亮氨酸膳食限制(IleR)可降低年轻和老年UM-HET3小鼠的体重并改善血糖,同时增加食物摄入量和能量消耗,促进代谢健康,改变能量平衡;②IleR以性别和年龄依赖性方式重新编程肝脏代谢;③...
知耕PI专辑|AlphaFold 3 预测了所有生命分子的结构和相互作用
图4a的顶部行中,我们将链对ipTM(界面预测TM分数)与界面准确性度量绘制出来:蛋白质-蛋白质DockQ,蛋白质-核酸iLDDT以及蛋白质-配体成功,成功定义为在经过阈值处理的口袋对齐RMSD值下的例子百分比。在图4a的底部行中,我们将每个蛋白质、核苷酸或配体实体的平均pLDDT绘制出来,与我们专门设计的LDDT_to_polymer指标进行比...
Nature系列重磅论文:首次全面总结细胞衰老和组织衰老的标志物
在人类中,定义为KIT+PECAM1-PTPRC-(也称为c-kit+CD31-CD45-)的心脏祖细胞显示CDKN2A水平增加,SA-β-gal活性增加,γH2AX灶减少。血管衰老的特征是动脉增厚、僵硬和内皮功能障碍。多种衰老相关标志物,包括细胞周期抑制剂(Cdkn2a、Cdkn1a和Trp53)、DNA损伤灶和SASP因子,在衰老小鼠的主动脉中上调。内皮细胞和血管...
抗体寡核苷酸偶联药物(AOC)的精确控制偶联方法
几个可光活化的基团,包括二苯甲酮或马来酰亚胺苯甲酰亚胺(MBP)、苯甲酰基苯甲酸、对苯甲酰基苯丙氨酸(BPA)、光亮氨酸(pLeu)和光甲硫氨酸(pMet),已成功地整合到FcBP中。光交联的主要优点是其高特异性,这是由于激发的中间体的寿命短。这种方法的缺点是可能生成具有一个或两个标签的异质性AOC。