抗体亲和力增强17倍,百奥几何、复旦AI方法模拟细微蛋白质互作
通过多关系图构建、几何消息传递和大规模未标记蛋白质数据的预训练,GearBind在多个测试集上的表现优于现有方法。研究人员基于GearBind推导出一个强大的集成模型,成功用于增强两种不同抗体的结合能力,实验数据显示设计的抗体突变体显著提升了性能。该研究以「Pretrainablegeometricgraphneuralnetworkforantibody...
【蛋白纯化直播课】详解蛋白纯化优化技巧与蛋白互作技术
在此系统中,两种标签均可随意搭配两种链霉亲和素突变体,根据亲和力级别选择合适的搭配,其中Strep-Tactin??XT与Twin-Strep-tag??的亲和力已高达pM的范围。图1.Strep-tag??标签与配体IBALifesciences公司提供用于纯化的填料、重力柱、上机柱,用于蛋白互作研究的磁珠、SPR试剂盒、BLI试剂盒。此外还有质粒、抗体、...
Nat Cell Biol | 万刚团队揭示多相凝聚体结构的不混容性调节小RNA...
近年的研究表明,生物大分子凝聚体是蛋白质-蛋白质互作网络,非竞争的蛋白质的互作促进凝聚体的形成和凝聚体组分的招募,但是竞争性的蛋白质互作可以促进多相凝聚体的形成。综上所述,该研究提供初步证据提示凝聚体中存在抑制不同凝聚体蛋白互作网络融合的调控蛋白,进一步的蛋白互作解析可以揭示多相凝聚体形成的具体分子机...
中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...
在该研究成果中,作者先用基于二氢叶酸还原酶的蛋白质互补分析体系来高效检测无序片段间的相互作用,系统研究了位点突变和截短对互作的影响,发现实验结果与AlphaFold2预测的α/β型复合物结构模型吻合;作者进一步用蛋白质序列设计深度学习模型ABACUS-R基于结构设计了多个突变体,成功获得一个突变体的晶体并解析了其结构。...
Nature 子刊:中山大学万刚团队发现新蛋白HERD-1,通过多相凝聚体不...
综上所述,该研究提供初步证据提示凝聚体中存在抑制不同凝聚体蛋白互作网络融合的调控蛋白,进一步的蛋白互作解析可以揭示多相凝聚体形成的具体分子机制。同时,这些结果提示多相凝聚体可以有序协调复杂RNA调控网络,而凝聚体的融合则可能会导致不同小RNA信号通路的竞争和RNA调控网络的异常,并最终导致生殖细胞永生性的破坏和...
神经退行性疾病|FIDA分子互作与Label free技术表征合集
α-突触核蛋白等蛋白质的淀粉样原纤维是神经退行性疾病的标志,许多研究都集中在它们的动力学和形成机制上(www.e993.com)2024年10月17日。关于这类结构的热力学稳定性的问题得到的关注要少得多,通过传统的技术方法也十分难以检测。在传统研究蛋白聚集体热力学特征时,一般采用化学解聚的方法。化学解聚实验中使用的实验技术可分为两类:第一类通常...
DMFold:精确到氨基酸的互作蛋白结合位点预测分析工具
在此基础上,进一步通过截短突变体探索蛋白质之间的互作结构域,甚至是通过氨基酸点突变为丙氨酸来确定互作的氨基酸位点。在没有前人相关研究报道的情况下,通常需要先分析预测互作蛋白质之间可能的氨基酸结合位点。而在药物设计研究中,这样的相互作用通常称作分子对接,也有多种Dock相关的分析预测网站,很多网站需要繁琐的注册...
Monolith互作荣登Cell:清华/南方医大团队发现降低胆固醇新激素
在这篇科研工作中,通过微量热泳动(MST)技术检测到野生型和突变型肠抑脂素-His对GPR146结合的验证。该技术对于分子互作亲和力的检测,Monolith系列仪器不依赖于分子量的改变,蛋白用量少,可以在溶液中表征肠抑脂素-His与GPR146的亲和力,十分有利于蛋白的结构平衡。
通过使用基于生物膜干涉技术的Octet分子互作仪进行生命科学分析
结果显示,与野生型相比,几种突变型HA1的BLI结合信号减少了50%以上,并且BLI和HI测定存在很强的相关性。该研究展示了一种系统分析流感疫苗体液反应中抗体免疫优势的方法。Octet系统测试方法:将rHA1蛋白偶联到HIS1K生物传感器(专门捕获his标签蛋白的传感器,可再生!)中,然后结合免疫流感疫苗的血清。基线120...
植物分子伴侣HYPK调控NatA及蛋白质周转和干旱胁迫响应的分子机制
研究人员利用CRISPR/Cas9创制了HYPK功能完全缺失突变体hypk-cr1和编码缺失N末端α螺旋但是保留C末端Ubiquitin-associated(UBA)结构域蛋白质的hypk-cr2突变体。表型分析发现,功能缺失突变体hypk-cr1表现出明显的生长发育缺陷,而hypk-cr2表现出居中表型。蛋白质互作和N末端乙酰化修饰组学表明,虽然截短的hypk-cr2仍可以...