中药单体靶点筛选新技术 | Phytomed揭示雷公藤红素靶向YY1和HMCES...
2.雷公藤红素对蛋白质丰度和溶解度的调节接下来,还进行了基于质谱的蛋白质组学研究,以研究雷公藤红素对K562T315I细胞中蛋白质表达水平的调节(图2a)。在8316个定量蛋白中,ANOVA检验发现了304个不同组之间的差异表达蛋白(DEPs)。通过表达模式的k-means聚类,这些dep被分为6个簇(C1-C6)(图2b)。随着雷公藤红素浓...
CRISPR筛选在高阶遗传干扰研究中的新应用
虽然CRISPR-Cas9筛选技术允许每个细胞进行最多三种干扰,Cas12a的发现为通过单一启动子产生多个CRISPRRNA提供了可能,这可能实现更大规模的干扰。然而,Cas12a的DNase活性可能带来基因毒性问题。为了降低这种风险,研究人员广泛采用了DNase失活的Cas融合蛋白,例如dCas9用于CRISPR干扰和激活。利用DNase失活的Cas12a(dCas12a)构...
David Baker 任科学顾问,发布世界最大蛋白质相互作用数据库!
他开发了基于酵母双杂交系统的创新技术,特别是通过重编程酵母交配(yeastmating)来表征蛋白质-蛋白质相互作用,极大地提高了蛋白质-蛋白质相互作用筛选的效率,也为AlphaSeq的研发提供了强大的支持。A-AlphaBio的另一位创始人RandolphLopez,主要从事合成生物学和计算机科学工作。此前他还曾担任Illumina...
中国科大筛选出特异针对点突变蛋白的适配体
近日,中国科学技术大学生命科学学院单革教授实验室发明了一种新的筛选方法,从而筛选出能特异针对具有细微改变(比如单氨基酸残基突变)蛋白质的核酸(RNA)适配体。该研究成果于7月27日发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上。RNA适配体是人工合成及筛选出的能特异结合小分子、蛋白质,甚至完整细胞的非编码RNA。RNA适配体的...
AI技术辅助蛋白高效设计,普言生物实现蛋白功能提升10倍以上
以重组人源化胶原蛋白为例,我们通过大规模语言模型进行百亿级别序列筛选,生成的序列经过实验验证其蛋白功能达到+673%,相比传统重组胶原蛋白的功能提升约10倍以上。”普言生物CEO进一步补充道。图:数据与深度学习辅助蛋白质高效设计普言生物将继续致力于人工智能(AI)技术在合成生物领域的应用发展,推动算法模型与工程...
灵敏度提高56%,港中文/复旦/耶鲁等联袂提出全新蛋白质同源物检测...
DHR方法:一种超快速、灵敏的蛋白质同源物搜索管道DHR方法的核心思想是将蛋白质序列编码成密集的嵌入向量,从而有效地计算出序列间的相似性(www.e993.com)2024年10月16日。具体来说,该研究通过初始化ESM和集成对比学习技术来有效训练序列编码器,从而为蛋白质语言模型的构建创造了条件,并使得DHR能被更有效的用来检索同源物。
药学院齐昀坤特聘教授与清华大学、中国科学技术大学合作在《Chem...
新闻网讯近日,药学院教师齐昀坤与清华大学化学系刘磊教授、中国科学技术大学生命科学学院郑基深教授合作,在《Chem》杂志(2024IF=19.1,《Cell》姊妹刊)发表了题为“Mirror-imageproteinandpeptidedrugdiscoverythroughmirror-imagephagedisplay”的前瞻性研究综述,总结了镜像多肽和镜像蛋白质药物的最新研发进展...
...Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查技术
01NatureMethods杂志发表了ORFtag高效标记与筛查技术,突破了蛋白质功能研究瓶颈。02ORFtag技术通过逆转录病毒载体,实现对内源开放阅读框的融合标记,具有多功能性、成本效益高且效率高。03该技术成功应用于多达1300个基因的系统标记,但在全基因组范围内覆盖仍面临挑战。
...基因合成、细胞改造、蛋白质挖掘与改造、高通量筛选、高通量...
公司设有合成生物技术平台,平台拥有基因编辑、基因合成、细胞改造、蛋白质挖掘与改造、高通量筛选、高通量分析、多组学联用等多项领先技术,推动了公司合成生物技术在兽用疫苗、抗体药物,以及酶制剂、益生菌、兽用药物原料、添加剂原料、相关中间体等方面新质生产力升级。公司已与中国科学院天津工业生物技术研究所、...
解析免疫共沉淀(Co-IP)技术:深入了解蛋白质相互作用及生
蛋白质是生物体内执行重要功能的基本分子。它们通过相互作用形成复杂的网络,调控生物过程的发生与发展。了解蛋白质相互作用对于揭示细胞的功能和疾病的机制至关重要。免疫共沉淀(Co-IP)技术是一种常用的方法,通过该技术可以研究蛋白质之间的相互作用关系,并在生物药物领域取得了一系列突破性进展。