分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
免疫共沉淀(CoIP)技术基于抗体和蛋白的特异性亲和作用,通过ProteinA、G琼脂糖珠或者磁珠偶联目标蛋白的特异性抗体,进而从复杂的样品(如细胞裂解液)中捕获及富集目标蛋白,同时可以测定与目标蛋白相互作用的蛋白或其它生物大分子。??技术特点Co-IP是经典的检测蛋白互作的技术,实验步骤相对简单,不需要用到特殊的仪器...
...Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互作用研究
蛋白质-DNA结构通常通过X射线晶体学、核磁共振光谱或冷冻电子显微镜实验获得,并存储在蛋白质数据银行(PDB)中。尽管这些结构显示了一个结合的DNA序列和相关的物理化学相互作用,但它们并不包含所有可能结合的DNA序列。相反,结合特异性数据可以通过蛋白质结合微阵列、SELEX测序、染色质免疫沉淀测序等实验获得,但这些...
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
与传统的RNA蛋白质相互作用分析方法相比,TREX技术能够更加精确地识别出与特定RNA区域直接相互作用的蛋白质,无论这些相互作用发生在细胞的哪个部位,都能被有效捕获和鉴定。通过利用RNaseH酶特异性地降解与DNA探针杂交的RNA区域,TREX技术不仅可以揭示已知的RNA-蛋白质相互作用,还能发现新的、未被发现的相互作用,为我们理...
质谱解码蛋白质之间的密语:蛋白相互作用质谱技术深度解析
蛋白质相互作用是细胞内生物过程的基础,通过相互作用形成的复合物调控着细胞的功能和代谢。蛋白质相互作用对于细胞信号传导、基因调控、药物研发等领域都具有重要意义。解码蛋白质相互作用可以揭示细胞内的调控机制和疾病发生的分子基础。2.蛋白质相互作用质谱技术的基本原理:蛋白质相互作用质谱技术是基于质谱分析的方法,...
拓展蛋白质相互作用研究的新视野:最新鉴定方法与技术进展
包括双杂交技术、裂解互补技术、蛋白质交叉连接技术等,为蛋白质相互作用的鉴定提供更加准确和可靠的方法。三、生物物理化学方法1.表面等离子共振(Surfaceplasmonresonance,SPR):通过检测蛋白质相互作用引起的光信号变化,实时监测蛋白质的结合和解离过程。
AlphaFold3问世,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构
AlphaFold3在预测类药物相互作用方面实现了前所未有的准确性,包括蛋白质与配体的结合以及抗体与其目标蛋白质的结合(www.e993.com)2024年9月7日。AlphaFold3比PoseBusters基准测试中最好的传统方法准确率高50%,无需输入任何结构信息,这使得AlphaFold3成为第一个超越基于物理的生物分子结构预测工具的人工智能系统。预测抗体-蛋白质结合的能力对...
...上海应用技术大学田怀香教授等:蛋白质-香气化合物结合作用的...
1蛋白质与香气化合物的结合作用机制根据结合方式的不同,蛋白质主要通过非共价键合、共价键合和传质效应3种方式实现对挥发性成分的吸附(图1),进而改变顶空中香气化合物的浓度。其中,蛋白质与香气化合物的非共价键合作用主要由疏水相互作用、范德华力、氢键和静电相互作用力来提供,这些作用方式均是可逆结合,常应...
河南工业大学布冠好教授等:大豆主要致敏蛋白及其检测技术研究进展
Badley等利用电子显微镜和X射线散射技术,首次揭示了大豆球蛋白的四级结构,阐明大豆球蛋白的物理形状是一个低扁圆柱体,其尺寸为11.0nm×11.0nm×7.5nm,其中两个三聚体位于另一个三聚体之上,从而形成大豆球蛋白六聚体。同时两个三聚体通过静电作用相互连接,而三聚体中的亚单元则主要通过疏水力结合。迄今为止,仅有...
科研人员开发首个靶向蛋白质-DNA相互作用及液液相分离的cGAS环肽...
北京大学深圳研究生院全军民教授团队联合中山大学卜宪章教授团队在NatureCommunications在线发表了题为“DevelopmentofcyclopeptideinhibitorsofcGAStargetingprotein-DNAinteractionandphaseseparation”的研究论文,这项研究通过靶向PPIs(蛋白质-蛋白质相互作用)环肽库的体外筛选,鉴定出一类新型cGAS环肽抑制剂。联合...
汇集结构质谱尖兵,开拓蛋白质结构生物学的新天地——第十四届质谱...
的交联蛋白质复合物,实现了亚细胞器空间分辨的蛋白质相互作用精准解析;在上述基础上,利用基于化学交联距离约束的分子动力学技术获得了蛋白质复合物的动态系综构像,实现了活细胞微环境下蛋白质复合物组成、相互作用界面及作用位点的规模化精准解析,为规模化地揭示蛋白质复合物功能状态下的结构调控机制提供了重要的技术...