AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评
2020年12月1日,谷歌旗下的DeepMind公司宣布,其新一代AlphaFold人工智能系统在国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)上击败了其余的参会选手,精确预测了蛋白质的三维结构,准确性可与冷冻电子显微镜(cryo-EM)、核磁共振或X射线晶体学等实验技术相媲美。这一消息引发了全球媒体关注,前Genentech首席执行官ArthurD.Levinson博士...
从计算机跨界生物学,坐了10年冷板凳后,他开创蛋白质预测新范式
许锦波被誉为“AI预测蛋白质结构全球第一人”。他是麻省理工学院博士后，曾任美国芝加哥丰田计算技术研究所终身教授、基因测序巨头Illumina的SeniorFellow，多次荣获美国斯隆研究奖、美国自然科学基金早期职业奖、《PLoSComputationalBiology》创新突破奖、国际计算生物学顶级会议RECOMB最佳论文奖和时间检验奖等国际顶级奖...
Nature | 蛋白质测序技术突破:PASTOR单分子水平精准解读蛋白质...
研究开发了一种基于纳米孔(nanopore)和解折酶ClpX的蛋白质测序技术——PASTOR(ProteinAnnotationbySingle-moleculeTranslocationandOverwriting),其核心在于通过纳米孔读取单分子蛋白质链的电流信号,并结合机器学习和物理建模技术实现蛋白质序列的精准测序。研究通过设计特殊的蛋白质结构块(每块59个氨基酸)并引入单个氨...
Nature Methods | 基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动...
近年来,人工智能(AI)技术的进步极大地推动了结构生物学的发展,尤其是AlphaFold等AI驱动的蛋白质结构预测工具,为研究者提供了大量高精度的蛋白质结构模型。此外,高通量测序(High-ThroughputSequencing)技术的普及,使得我们能够更好地理解基因变异及其与疾病的关系。然而,尽管基因组学(Genomics)和功能基因组学(Functional...
“阿尔法折叠2”预测蛋白结构近原子水平
科技日报北京7月18日电(记者张梦然)据英国《自然》杂志16日发表的一项结构生物学最新研究,世界著名人工智能团队深度思维(DeepMind)描述了神经网络“阿尔法折叠2”能以就计算机方法而言前所未有的准确度,根据蛋白质的氨基酸序列预测其三维结构。蛋白质折叠问题被认为是人类在21世纪需要解决的重要科学前沿问题之一。理解蛋...
单分子蛋白质测序技术是什么
单分子蛋白质测序技术(Single-MoleculeProteinSequencing)是一种新颖的生物技术,它能够在单分子水平上解析蛋白质的氨基酸序列(www.e993.com)2024年11月3日。这种技术在生物学、药物研发、疾病诊断等领域具有广泛的应用前景。一、单分子蛋白质测序技术的重要性在过去的几十年里,DNA测序技术的飞速发展极大地推动了生物科学的进步。然而,DNA的测序并...
串联质谱蛋白质测序方法综述:技术、应用与挑战
蛋白质作为生物体内功能和结构的关键组分,对于理解生命过程具有重要作用。揭示蛋白质的氨基酸序列对于研究其功能、疾病机制以及药物开发具有重要意义。而串联质谱蛋白质测序作为一种强大的技术手段,已成为蛋白质研究的重要工具。本文将对串联质谱蛋白质测序的原理、技术方法、应用以及所面临的挑战进行综述。
西湖大学李子青/深圳湾实验室周耀旗等解读AI赋能的蛋白质结构与...
8月22日(周四)晚19:00,CellPress细胞出版社旗下数据科学期刊Patterns将联合TrendsinBiotechnology()为大家带来本年度第四场CellPressLive线上讲座,主题为《蛋白质结构与功能预测及设计》。本次会议邀请到来自西湖大学的李子青、深圳湾实验室的周耀旗,复旦大学的朱山风、北京大学的张文彬、以及来自瑞典查尔姆...
Nature | 不止蛋白质结构!AlphaFold3可高精确度预测生物分子结构...
准确预测的生物分子复合物结构,对于人们理解细胞功能和开发合理治疗方法至关重要。随着AlphaFold的发展,人们在蛋白质的结构预测方面已经取得了巨大的进步,AlphaFold2使得蛋白结构预测达到实验层面的精度,此外,在AlphaFold2思想和技术基础上开发的一系列新算法和研究新进展也使这一领域得到了长足发展。AlphaFold在问世不久后,...
川大科研团队破译蛋白质测序难题
本报讯(成都日报锦观新闻记者黄雪松)记者29日获悉,在省科技计划支持下,四川大学生物治疗全国重点实验科研团队成功破译蛋白质测序难题,提出并验证了测序新方法,代表我国生物传感技术与蛋白组学工具的原始创新能力进入全球前沿方阵。每个人体内都有超过百万种蛋白质,由氨基酸组成的蛋白质是生命活动的主要承担者,许多疾...