...大学陈鹏团队开发相分离体系中蛋白质互作的时空特异性光交联技术

该研究报道了一种时空特异的蛋白质光交联技术——DenseMAP(Condensation-enhancedSpatial-directedMetabolicIncorporation-AssistedPhoto-crosslinking),通过将空间特异的蛋白质标记与凝聚增强的光交联相结合,对活细胞中特定生物分子凝集体的蛋白质相互作用进行了高效捕捉和鉴定。首先,研究团队利用生物信息学手段分析了20种...

负性情绪神经环路;肠道微生物健康;新技术捕捉蛋白互作;PD-1促癌...

北京大学陈鹏教授课题组在近期发表的研究中,开发了一种名为DenseMAP的光交联技术,旨在捕捉活细胞中特定生物分子凝集体中的蛋白质互作。研究指出,传统方法在动态形成的凝集体中难以有效保留互作信息,而该技术通过空间特异性蛋白质标记与凝聚增强的光交联结合,提升了捕获效率并降低了假阳性结果。这一进展为理解细胞内无膜结...

FIDA技术:自带“质控”的蛋白分子互作新技术,解决复杂样本难题

导读:FIDA技术是近年来分子互作领域的一项创新性突破,它首次采用第一性原理来获取亲和力,开创了无需固定溶液动力学技术(Kon/Koff)的先河,同时也是首个能够实时校正粘度因素的生物物理技术。“我确信这一点,我以前从未能够直接在细胞裂解液中检测到我构建的三元复合物的形成——这只用了不到两小时。”——托马斯·...

中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...

在该研究成果中,作者先用基于二氢叶酸还原酶的蛋白质互补分析体系来高效检测无序片段间的相互作用,系统研究了位点突变和截短对互作的影响,发现实验结果与AlphaFold2预测的α/β型复合物结构模型吻合;作者进一步用蛋白质序列设计深度学习模型ABACUS-R基于结构设计了多个突变体,成功获得一个突变体的晶体并解析了其结构。...

FIDA解决一切分子相互作用难题,在原生条件下同步进行分子互作三个...

因此,从实际角度看,使用BRIC技术具有几个关键优势:保持原生条件:BRIC允许在生理条件下研究生物分子相互作用,在和小分子互作研究中可测量无标记蛋白质的BRIC变化,而不必因温度变化而破坏或改变分子的原生结构,从而提供更准确和可靠的数据。与复杂介质的兼容性:BRIC在恒温下测量相互作用,且考虑背景噪音的干扰,使BRIC在...

...| 陈鹏团队开发相分离体系中蛋白质相互作用的时空特异光交联技术

综上所述,本研究巧妙地融合了空间特异的蛋白质标记技术与凝聚增强的代谢光交联探针,开发了一种高效且普适的时空特异光交联技术——DenseMAP(www.e993.com)2024年11月17日。这一策略能够精准地捕捉和鉴定活细胞中特定生物分子凝集体内蛋白质的相互作用,为深入阐释无膜细胞器的功能机制、动态变化过程和疾病相关机理提供了强有力的工具。

分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...

技术特点实验步骤相对简单,不需要用到特殊的仪器设备。实验条件温和。可以证明两个蛋白有直接的相互作用。该实验是体外实验,可能无法完全反映体内条件下的蛋白互作情况,可结合Co-IP技术进行检测。??实验步骤1、GST标签蛋白表达和纯化;2、GST标签蛋白偶联GSH琼脂糖珠或者磁珠;...

互作蛋白筛选的常用方法与检测技术

互作蛋白筛选通常需要合适的检测技术来确认蛋白质相互作用的存在。常用的检测技术包括免疫印迹、荧光共振能量转移、质谱分析等。(1)免疫印迹:免疫印迹是一种常用的蛋白质检测方法,通过将蛋白质转移到膜上并使用特异性抗体进行检测,确定目标蛋白质及其相互作用伴侣的存在。

上海交大陆钰明课题组建立新型植物内源蛋白检测技术

研究团队进一步探究了TagBIT技术在检测植物内源蛋白-蛋白互作(PPIs)方面的应用潜力。尽管HiBiT和LgBiT具有出强烈的相互作用,但其实验表明单独的LgBiT并未能有效沉淀目标蛋白,这表明此类应用需要额外的相互作用强度。因此,他们采用抗HiBiT抗体进行co-IP实验,以检测内源TagBIT蛋白及其互作蛋白。他们选择了雷帕霉素靶蛋白(TO...

Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破

01RNA与蛋白质相互作用是调控基因表达的重要机制之一,影响细胞的命运和生理状态。02TREX技术是一种创新的实验方法,能够精确识别出与特定RNA区域相互作用的蛋白质。03TREX技术具有高特异性、高灵敏度和操作简便等优势,可应用于不同细胞类型和疾病研究。