中国科学家建立了新的蛋白质从头设计方法
“SCUBA模型+ABACUS模型”构成了能够从头设计具有全新结构和序列的人工蛋白完整工具链,是RosettaDesign之外目前唯一经充分实验验证的蛋白质从头设计方法,并与之互为补充。在该研究中,团队展示了9种从头设计的蛋白质分子的高分辨晶体结构,它们的实际结构与设计模型一致,其中5种蛋白质具有天然蛋白质中尚未观察到的新型拓扑结...
《食品科学》:上海应用技术大学田怀香教授等:蛋白质-香气化合物...
蛋白质与香气化合物之间的结合作用主要包括非共价键合、共价键合和传质效应,但由于食品组织结构的复杂性以及蛋白质和香气化合物的自身特性和结构差异,两者结合作用的本质与规律性研究仍是一个系统且复杂的过程。基于此,上海应用技术大学香料香精技术与工程学院的陈臣、周琪琪、田怀香*等人综述了蛋白质与香气化合物的结合...
...多尺度研究院马剑鹏团队在计算生物学取得突破,实现蛋白质结构...
未来,团队将继续以人工智能为技术中枢,构建新一代生物体系分析工具与方法,解读生物遗传信息,加速生命科学在分子层面的研究,通过对蛋白质、核酸等生物大分子功能结构的预测与设计,为药物研发提供支持,支撑全链条AI-赋能新药研发的先进技术平台。算法在GitHub开源,地址为:httpsgithub/alncat/opusDSD论文链接:...
利用氢氘交换质谱技术解析蛋白质结构与动态变化
2.1蛋白质结构解析:氢氘交换质谱技术可以提供关于蛋白质结构的信息。通过测量氢氘交换速率,我们可以推断蛋白质中不同区域的稳定性和结构特征。这有助于揭示蛋白质的折叠状态、结构域边界和结构稳定性等关键信息。2.2蛋白质-配体相互作用研究:氢氘交换质谱技术可用于研究蛋白质与配体之间的相互作用。通过测定氢氘交...
对话复旦复杂体系多尺度研究院院长:蛋白质结构预测为何突破
他甚至认为,对于国家来说,这是核心卡脖子技术之一。“我们必须从核心算法等底层技术做起,这也是我们现在重中之重的工作。”据介绍,复旦大学复杂体系多尺度研究院在蛋白质结构预测领域近期也取得突破,其自主研发的opus-fold软件在蛋白质侧链结构的预测精度上,超越了DeepMind的AlphaFold2,相关论文目前处于审稿阶段。
“三螺旋结构”重组胶原蛋白技术迎突破,千亿市场蓄势待发|行业...
具体而言,胶原蛋白的“三螺旋结构”技术瓶颈主要卡在修饰工艺(恢复胶原蛋白所具有的二级或更高级结构),难点在于基因片段的选择及三螺旋结构的稳定性(www.e993.com)2024年9月16日。目前市面上大规模量产的重组胶原蛋白多为单链结构,三螺旋结构在重组胶原蛋白技术上还很难实现产业化。如今,创健医疗核心技术的突破,让完整“三螺旋结构”重组胶原...
深圳湾实验室周耀旗:填补AlphaFold 2缺口,开启所有蛋白质结构的高...
也就是说,这种具有成本效益的技术可以在任何分子生物学实验室进行,而不需要昂贵的设备。相比用实验方法解析这些结构,如X射线衍射或冷冻电镜等,费用要低至少一个量级,而且该方法实验操作简单,后续有望改写蛋白质结构的研究范式。此外,这一技术可以进一步扩展到预测蛋白质复合物,以及具有翻译后修饰的蛋白质的结构...
生物技术敲开新大门:蛋白质设计的AI时刻
此外,在AI加持下,蛋白质设计能变得更高效和精确,大大提高了研究效率。同时,AI蛋白质设计还可以设计出更加复杂和多样化的蛋白质结构,拓展蛋白质的应用领域。面对广阔的机遇,AI蛋白质设计的创业浪潮开始翻涌,深原质药便是其中之一。与其他行业入局者不同,深原质药最大特色是基于蛋白质的结构去做蛋白质设计。
《自然》发布2024年值得关注的七大技术,中国科学家研究成果位列其中
科学家正在努力缩小超分辨率显微镜与结构生物学技术之间的差距。这些新方法能以原子级分辨率重建蛋白质结构。2022年,德国科学家借助名为MINSTED的方法,使用专用光学显微镜,能以2.3埃(约1/4纳米)的精度解析单个荧光标记。较新的方法则使用传统显微镜来提供类似的分辨率。2023年,马克斯·普朗克生物化学研究所(MPIB)开发...
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|JohnKendrew(左)和MaxPerutz(右)利用X射线晶体学技术揭示了血红蛋白和肌红蛋白的结构。随后,他们用球(代表原子)和棒(代表化学键)建立了物理模型。(来源:MRCLaboratoryofMolecularBiology)从那时起,无数研究人员不仅努力了解不同蛋白质的外观,还试图了解它们如何形成那样的外观。“了解事物的外观...