Nat Chem | 陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能...
2024年9月2日,南京大学陈加余课题组在NatureChemistry杂志发表了题为“ChemoproteomicprofilingunveilsbindingandfunctionaldiversityofendogenousproteinsthatinteractwithendogenoustriplexDNA”的研究论文,首次系统性揭示了内源性三链体DNA互作蛋白及其多样化的调控模式与分子功能5。当前,三链体DNA...
Cell | 微胶质细胞衍生的C1q调控衰老大脑蛋白质稳态的新机制
而作者通过改进神经元免疫染色方法,发现与原位微胶质细胞相比,成年动物中更多的C1q蛋白与神经元共定位,并涵盖了多个脑区,包括海马和运动皮层。C1q编码基因条件性敲除证实微胶质细胞和脑相关巨噬细胞是神经元C1q的来源。进一步利用新构建的神经元核糖体特异性荧光标记小鼠,作者发现C1q在成年小鼠的神经元内部部分与RNP复合...
DMFold:精确到氨基酸的互作蛋白结合位点预测分析工具
分子生物学相关研究中,蛋白质互作经常会涉及到,通过Co-IP、酵母双杂交、GST-pulldown、BiFC、荧光共振能量转移(FRET)、免疫荧光共定位、邻位连接技术(PLA)等方式验证蛋白质之间的相互作用。在此基础上,进一步通过截短突变体探索蛋白质之间的互作结构域,甚至是通过氨基酸点突变为丙氨酸来确定互作的氨基酸位点。在没有...
Cell 50周年专刊 | 时空组学在生物学和医学的新机遇
虽然转录组显著提升了我们对基因表达和调控的理解,但这也仅是单层信息,目前时空组学在其他组学检测方面,包括基因组学、表观组学、翻译组学、蛋白质组学和代谢组学相关的技术不断出现,实现在时空维度对DNA序列、调控元件、转录后调控、蛋白质功能和代谢途径的深入理解。在时间分辨率方向,虽然目前的时空研究主要限于连...
【前沿进展】Molecular Cell | 北京大学王伟课题组发现蛋白酶体...
该研究通过探究蛋白酶体进入SG、组装、酶活,以及对底物水解能力,阐明蛋白酶体可被招募进入SG,维持SG内的蛋白平衡、调控其稳态,提高植物耐高温的重要生物学意义。值得一提是,近两年王伟课题组的工作(NaturePlants,2023;MolecularCell,2024)深入解析了植物SG的功能和生物学意义,其涉及的技术和方法为该研究领域提供了...
上科大团队揭示化学药物相分离驱动新机制,为新药开发提供新思路
在此之后,该课题组一方面通过组学研究,确认了阿霉素可以引起染色质开放区域以及三维互作的减弱;另一方面,体外实验表明,阿霉素可以与组蛋白H1结合并形成丝絮状凝聚体,为观察到的相变现象提供了机制上的解释(www.e993.com)2024年10月17日。不同于常见的液-液相分离的圆形液滴,这个比较少见的丝絮状凝聚体显示阿霉素引起的相变,更倾向于胶体...
武汉病毒所建立研究活细胞内蛋白质互作的新方法
近日,中国科学院武汉病毒研究所/病毒学国家重点实验室胡志红、王曼丽研究团队在蛋白质相互作用的研究方法方面取得新进展,相关研究成果以Mito-docking:Anovelinvivomethodtodetectprotein-proteininteractions(《线粒体锚定:一种研究活细胞内蛋白间相互作用的新方法》)为题发表在国际学术期刊SmallMethods上。
技术线上论坛| 6月22日《全自动外泌体荧光检测分析系统——开启单...
美国NanoViewBiosciences推出的全自动外泌体荧光检测分析系统—ExoViewR200,采用了全新的SP-IRIS技术,实现了对单个外泌体的全面表征,包括了外泌体的荧光成像、亚群粒径检测、计数、内容物分析、蛋白共定位等。短短三年,在全范围内已有100多家实验室采用该设备,发表SCI近200篇。
北京林业大学林金星团队发表活体检测蛋白互作技术方面综述论文
近年来,越来越多的研究使用共定位分析技术来确定两个或多个蛋白可能发生的体内相互作用。简单来说,就是通过检测两个或多个不同荧光标记蛋白成像后图像共定位以及相关系数的计算,最终以相关性分析来确定其互作程度。过去,由于蛋白标记与成像技术的限制(例如:衍射极限、时空分辨率以及活体成像等),共定位只能粗略的间接...
时空月速览 | 194篇文章,追踪发育/结构/机理/疾病研究前沿(2022年...
内容概要:总结了多组学技术用于肿瘤图谱解析的最新研究进展,并重点关注空间基因组和染色质构象、空间转录组和蛋白质组、液态活检和药物有效性评估的体外模型。此外,还分析了这些技术临床转化所处的阶段,并讨论了将其整合到肿瘤精准治疗中的未来前景。3.解码精子发生程序:来自转录组学分析的新见解...