Phytomedicine | CETSA和TPP策略用于天然产物的靶点鉴定和药物...

因此,2D-TPP能够同时测量温度依赖性蛋白质的热稳定性和浓度依赖性药物亲和力。2D-TPP结果可以显示在由药物浓度轴和温度轴组成的2D热图中,而不是TPP中每个蛋白的一维熔解曲线,这导致对靶标结合的评估不仅限于熔解曲线中的Tm位移,而且还限于每个选定温度点的药物的目标占用效价(pEC50)(图2)。因此,与tp-tr或tp...

汪劲:描述生物系统涌现行为的景观和流理论视角

两个关键因素决定了识别:一个是亲和力,量化两个分子之间结合的稳定性;另一个是特异性,区分一个靶标与另一个靶标。在实际的药物发现设计中,亲和力和特异性的准确量化,是分子紧密结合和避免副作用所必需的。蛋白质折叠和分子结合的底层驱动力都是疏水和静电相互作用[15,21,22]。类似于蛋白质折叠,底层的结合能...

...致幻剂抗抑郁新机制!与致幻作用无关,且受体亲和力是现有药物...

研究人员使用放射性3H标记麦角酰二乙胺(3H-LSD),发现3H-LSD可以直接结合人、大鼠和小鼠的TrkB,并且具有超乎想象的结合亲和力,是氟西汀、氯胺酮等抗抑郁药物的1000倍。PSI同样以高于常用抗抑郁药物的亲和力与TrkB结合。研究人员将TrkB的跨膜结构域二聚体嵌入含有丰富胆固醇的膜中,模拟生物膜环境,使致幻剂与TrkB进行...

五种单抗药物是什么

五种单抗药物是指利妥昔单抗、曲妥珠单抗、阿达木单抗、西妥昔单抗和依那西普。它们是利用基因工程手段制备的特异性针对某一特定蛋白分子的抗体,主要用于治疗癌症、自身免疫性疾病等。这五种单抗药物通过阻断特定的细胞因子或者受体信号通路来发挥作用,具有高度特异性和亲和力,能够选择性地与目标分子结合,抑制其活性或...

Nature | 我国科学家揭示甲基苯丙胺与 TAAR1受体结合的分子机制

此外,这些作者还探讨了临床候选药物SEP-363856(一种5HT1AR和TAAR1双激动剂)和选择性TAAR1激动剂RO5256390与TAAR1结合的结构药理学。结构分析和诱变实验揭示了这些化合物如何与这种受体相互作用,以及它们表现出不同选择性和亲和力的原因。例如,TAAR1或5-HT1AR识别SEP-363856的共同相互作用可能...

解析与人C5a结合并可能调节C5a受体信号传导的设计抗体样肽的结构

此外，归一化CD和荧光滴定数据的拟合提供了估计的DePAKd为~0.82-0.94μM，DePA1Kd值为~0.70-0.88μM，表明肽对C5a具有明显的结合亲和力(www.e993.com)2024年11月19日。通过对10μMDePA和DePA1反向滴定低浓度C5a来进一步证实C5a与肽的结合。此外，10nMC5a的存在还能够改变DePA和DePA1的近紫外CD特征，这也支持了C5a和肽之间的...

Nature子刊丨候选药物的药理学表征,提高疗效减少失败率

药物的亲和力通常用Kd(平衡解离常数)的倒数来表示,反映了药物在特定浓度下与受体结合的能力。Kd值是药物与受体复合物解离速率(koff)与结合速率(kon)的比值,当药物浓度等于Kd时,大约50%的受体被药物占据。对于拮抗剂而言,Kd值是评估其影响体内信号传导能力的重要参数,但需要注意的是,Kd值可能会受到局部药物浓度的...

...| 杨海涛/饶子和/孙蕾等揭示冠状病毒同时挟持细胞糖受体和蛋白...

病毒与不同物种来源的受体蛋白的结合能力,是决定其跨物种传播潜力的关键因素之一。为深入探究HCoV-HKU1的宿主多样性,研究团队综合运用序列分析、生物膜干涉技术以及结构生物学分析等多学科交叉手段,系统评估了多个物种的TMPRSS2蛋白作为HCoV-HKU1功能性受体的可能性。研究发现,来源于骆驼、羊驼和大鼠的TMPRSS2在关键互作...

Nature | 抗体设计的未来:AI技术助力挑战传统药物研发

抗体序列优化:利用深度学习模型,研究人员可以预测抗体变异对其亲和力和特异性的影响,从而指导更有效的抗体序列设计。结构预测:AI模型能够根据已知的蛋白质序列预测其三维结构,这对于理解抗体如何与其特定抗原结合至关重要。亲和力改进:通过分析大量的抗体-抗原互作数据,神经网络可以发现提高抗体亲和力的设计原则。

新药研发(六)| 先导化合物下篇:药物设计之苗头化合物的改造

RSBDD(Receptor-baseddrugdesign)的基本思想是通过对受体结构进行分析和理解,可以预测药物分子与受体之间的相互作用,并据此设计具有高亲和力和选择性的药物分子。又细分为分子对接法、从头设计法和同源建模法。2.2.1.1分子对接法(Docking)Docking是一种计算机辅助药物设计方法,它可以用来预测药物分子与蛋白质分子之...