Mol Cell | 王小林/单革团队发现ZC3H14蛋白促进反向剪接的新机制

研究团队基于无内含子基因来源的环形RNA构建了circGFP报告系统,进行全基因组CRISPR-Cas9敲除筛选,鉴定出ZC3H14蛋白作为环形RNA生成的正调控因子。通过高通量测序分析,作者发现ZC3H14促进约40%环形RNA的生成,但对mRNA的表达与可变剪切没有显著影响。此外,ZC3H14在真核生物中高度保守,其酵母同源蛋白Nab2的敲除同样抑制裂殖...

2024诺贝尔生理学或医学奖 | microRNA:揭开细胞发育之谜

随着越来越多的microRNA基因被克隆,多个研究团队也投入了对microRNA生成及其作用机制的研究(Bartel,2004)。microRNA基因的转录策略多种多样。有些microRNA基因是独立的转录单元,有时成簇分布,而另一些则位于编码蛋白质基因的内含子中。经典的初级microRNA(pri-microRNA)由RNA聚合酶II转录,具有发夹结构。这种发夹结构在...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

结果表明内含子保留的转录本相比于完全剪切的转录本具有稍长的PolyA尾巴。虽然dRNA-seq还处于起步阶段,但是其能直接检测RNA碱基修饰的潜力有望在表观转录组领域促进更新的发现。长读长测序与短读长测序技术的比较虽然长读长测序技术在转录本分析方面比短读长测序技术有一些明显的优势,但是也存在一些局限。跟成熟的...

上海交大王传德课题组发文揭示RPD1蛋白介导线粒体内含子剪接的...

近期发现核编码蛋白参与细胞器内含子剪切(PNAS,2020;NucleicAcidsResearch,2024);较系统地阐明了PPR蛋白参与线粒体RNA的3’端加工成熟的多样性分子机制(NucleicAcidsResearch,2017;PlantPhysiology,2022;NucleicAcidsResearch,2023);揭示了油菜核编码蛋白Rfo在翻译水平上抑制不育基因的表达,从而恢复Og...

中国科大在经典核酶的自剪接机制研究取得重要进展

自剪接内含子(核酶)是具有催化活性的RNA,主要参与RNA的加工与成熟。与蛋白酶类似,核酶也会折叠成高级结构发挥功能。RNA在一级序列的基础上形成局部的helix、loop等二级结构元件,再在金属离子的帮助下进一步折叠成具有酶活中心的三级结构,在无需蛋白质的情况下催化反应。但由于RNA的异质性和灵活性,使RNA结构的解析受到...

Neuron:孙疏影团队揭示额颞叶失智症/ALS等的病理新机制

其中poly-GR表达最低但毒性最大(www.e993.com)2024年11月15日。前期研究显示在FTD/ALS患者脑组织中存在大量的RNA可变剪接异常,外显子跳跃(exonskipping)和内含子保留(intronretention)事件在C9ORF72-FTD/ALS患者脑组织中尤为突出,但是其分子机制并不清楚。2024年8月23日,约翰斯霍普金斯大学医学院孙疏影团队在Neuron杂志在线发表题为Disruption...

【Nature子刊】中国科学院范祖森团队:揭示小核仁RNA如何推动肝癌...

鉴于SNORD88B在人类和小鼠中具有高度同源性,小鼠直系同源物snord88b也位于chr7的2410002F23Rik基因位点的第4和第5外显子的内含子区域,长度为93nt。小鼠snord88b的关键基序与人类相同,并通过测序进一步验证。然后,团队使用CRISPR/Cas9技术生成snord88b敲除(KO)小鼠,以评估其体内功能。团队发现,只有删除snord88b位点...

或比CRISPR更安全更灵活,RNA编辑疗法加速发展|科技创新世界潮

这项技术靶向前信使核糖核酸（pre-mRNA）。pre-mRNA包括外显子和内含子。外显子是RNA转录物中含有制造蛋白指令的部分，内含子不含此类指令。RNA剪接机制将内含子从pre-mRNA中去除，并与外显子连接在一起，形成最终的mRNA，mRNA随后被翻译成蛋白质。位于波士顿的Ascidian医疗公司正在利用RNA剪接过程去除含有突变的外显...

RNA编辑疗法加速发展

这项技术靶向前信使核糖核酸(pre-mRNA)。pre-mRNA包括外显子和内含子。外显子是RNA转录物中含有制造蛋白指令的部分,内含子不含此类指令。RNA剪接机制将内含子从pre-mRNA中去除,并与外显子连接在一起,形成最终的mRNA,mRNA随后被翻译成蛋白质。位于波士顿的Ascidian医疗公司正在利用RNA剪接过程去除含有突变的外显子...

Science丨挑战教科书——非编码RNA的滚环式逆转录生成毒蛋白,助...

文章对肺炎克雷伯菌的DRT2逆转录酶系统如何发挥抵抗噬菌体感染的机制进行了解析。结果显示,噬菌体侵染时,DRT2逆转录酶会以非编码RNA为模板进行滚环式逆转录和cDNA第二链合成,最终形成的双链DNA中包含有效启动子和蛋白编码序列,双链DNA经过转录翻译产生的毒性蛋白Neo能有效阻滞细菌的生长,最终抵抗噬菌体感染。