...杨茂君破译线粒体超大分子量多酶复合物的全景空间结构及组装机制

丙酮酸脱氢酶复合体(PyruvateDehydrogenaseComplex,PDHc)和α酮戊二酸脱氢酶复合体(2-OxoglutarateDehydrogenaseComplex,OGDHc)是定位于线粒体基质的超大分子量多酶复合物。二者同属α-酮酸脱氢酶复合体家族(OADHcfamily)1,该家族成员主要由三个种类的酶单元多聚构成:(E1)α-酮酸脱氢酶家族蛋白;...

中国科大揭示Rpd3S/HDAC结合和催化核小体底物的分子机制

该研究解析了酵母Rpd3S/HDAC全酶复合体结合特定修饰核小体底物的复合物结构,首次发现完整的天然底物H3尾巴(1-24aa)结合在Rpd3S底物结合口袋,且H3K18残基的侧链朝向催化中心待催化;阐明了Rpd3S底物特异性的结构基础以及通过构象变化实现多位点催化的机制,尤其是Rco1亚基在核小体结合和位点特异性催化中起着关键作用,...

中国科大发现人类胆汁酸外排蛋白ABCB11的一种新颖底物结合和转运...

为了探究ABCB11转运生理底物的分子机制,研究组继续解析了ABCB11在不同浓度牛磺胆酸钠存在时的两个3.7??复合物结构:低浓度时结合一个牛磺胆酸钠分子,高浓度时结合两个牛磺胆酸钠分子。结合ATP酶活性实验和底物转运实验,阐明了两个口袋具有明显的底物亲和力梯度,使得底物可以顺亲和力梯度依次结合两个口袋,最终完成跨膜...

中国科大揭示α-tubulin末端去酪氨酸酶的催化机制及其在有丝分裂...

解析了α-tubulin末端去酪氨酸酶复合物SVBP/Vasohibin-1以及该异二聚体分别与α-tubulin羧基端模拟多肽、抑制剂分子epoY的高分辨复合物晶体结构,通过研究其功能突变体的体外/体内酶活确定了SVBP/Vasohibin-1复合体的底物结合界面及催化机制,并通过细胞生物学实验发现其在星体微管的形成中具有重要...

研究阐释猴痘病毒DNA聚合酶F8-A22-E4-H5四元复合物的工作机制

在猴痘病毒聚合酶四元复合物结构中,已知的复制持续因子A22-E4结合在活性中心上游的模板ssDNA区域(图2C),在分子机制上与PCNA完全不同。该工作的结构分析认为,A22-E4可能一方面通过E4与ssDNA的结合特性促进聚合酶与DNA底物的结合,另一方面A22、E4以及F8的部分结构域共同组成了一个封闭的环,环绕ssDNA区域防止DNA底物...

Science丨施一公/周瑞团队揭示γ-分泌酶识别并切割底物的分子机制

从局部结构特征和催化机制的角度来看,γ-分泌酶的内肽酶和羧肽酶活性之间几乎没有差异,主要区别在于底物形成β-strand的长度:对于Aβ49的产生,C99形成比较长的β-strand区域;对于羧肽酶切割(Aβ49→Aβ46→Aβ43→Aβ40),底物β-strand区仅包含三个连续的氨基酸残基(www.e993.com)2024年10月31日。随着底物向细胞内侧移位进行切割,底物跨膜α...

施一公,发论文!|蛋白|细胞|底物|前体|反恐|复合物|化学家|特种...

在硅模拟和在纤维素荧光显微镜支持稳定酶-底物复合物的FAD突变。秀丽隐杆线虫中C99和/或早老素-1的神经元表达仅在FAD突变的转基因中导致突触丢失。设计的稳定酶-底物复合物和阻断Aβ产生的突变同样导致突触丧失。总的来说,这些发现暗示了在FAD发病机制中,γ-分泌酶裂解底物的停滞过程,而不是产物。

P450酶催化糖肽分子内苯酚偶联反应机制获揭示

P450酶催化的分子内C??O和C??C苯酚偶联反应在天然产物生物合成中扮演着关键角色,广泛存在于糖肽类抗生素如万古霉素和替考拉宁中。虽然糖肽类抗生素中多个催化分子内苯酚偶联反应P450酶的功能和晶体结构相继被解析,但底物复合物结构的缺失导致该类反应的催化机制一直是未解之谜。

研究揭示Gabija复合物抗噬菌体侵染的分子机理

该复合物切割环状DNA以抑制噬菌体DNA复制,进而阻断噬菌体扩增。该研究与近期发表的其他工作共同揭示了Gabija系统感知噬菌体入侵的分子机制及其切割DNA底物的偏好选择,为探索宿主抗噬菌体免疫及噬菌体免疫逃逸的相关研究提供了新的方向。此外,Gabija系统也有望为分子生物学工具酶的研发奠定结构和生化基础。

...| 西湖大学胡奇、吴建平团队揭示RAS棕榈酰转移酶调控机制

为研究辅助蛋白GCP16对DHHC9活性的调控机制,团队表达纯化了人源DHHC9-GCP16复合物及其在酵母中的同源蛋白Erf2-Erf4复合物,并解析了二者的冷冻电镜结构(图2)。图2RAS酰基转移酶的整体结构结构显示,GCP16通过稳定DHHC9的结构调控DHHC9活性,而非直接参与DHHC9的催化过程(图3)。