抗体亲和力增强17倍,百奥几何、复旦AI方法模拟细微蛋白质互作
通过多关系图构建、几何消息传递和大规模未标记蛋白质数据的预训练,GearBind在多个测试集上的表现优于现有方法。研究人员基于GearBind推导出一个强大的集成模型,成功用于增强两种不同抗体的结合能力,实验数据显示设计的抗体突变体显著提升了性能。该研究以「Pretrainablegeometricgraphneuralnetworkforantibody...
...Res:我国学者开发零样本突变效应预测模型,高效指导蛋白质设计...
该方法在模型架构、训练数据类型及规模、模型性能和下游应用上均有突破,为破译蛋白质结构与功能密码、探索庞大蛋白质突变空间、预测突变效应并指导蛋白质设计改造提供了全新策略。随着各类蛋白质多样化改造需求不断增加,ProMEP零样本且MSA-free的特性尤为重要,有望显著降低蛋白质设计改造难度和实验成本,为生物学家快速研制...
全球首次湿实验证实,上交成功实现“蛋白质功能定向进化”,零数据...
洪亮团队设计的能够提取氨基酸周围微观环境信息的等变图神经网络的预训练框架ProtLGN,结合蛋白质的结构信息对蛋白质上的每个氨基酸进行同步编码,学习蛋白质三维结构中有益的氨基酸突变位点和突变类型,用于指导具有不同功能的蛋白质单位点突变和多位点突变设计。ProtLGN框架示意图LGN的零样本学习训练框架如上图所示。首先...
生物技术敲开新大门:蛋白质设计的AI时刻
这个过程中,36氪近期接触的深原质药,从2022年创立便专注于AI蛋白质设计领域,核心使命是以先进AI模型为工具设计蛋白质,并近期在其官网(dProtein)上开放了CUTEDGEopt和AtomSeg两个算法的公开测试,以供更多行业用户了解和使用,从而为AI蛋白质设计的进一步发展提供了新的思路。革新/蛋白质设计进入“AI生成时代...
生物医药工程建设 分子生物与蛋白纯化实验室设计
生物医药工程建设:分子生物与蛋白纯化实验室设计CEIDI西递我们以一个建筑面积千平左右研发慢性代谢性疾病药物的生物药实验室为例,可以规划为:分子生物实验室、蛋白纯化和化学修饰实验室、发酵实验室、细胞生物学实验室,以及每个实验室的辅助空间和办公区。
从FBIF2024看安琪酵母如何重塑食品风味:减盐增鲜新策略
04减盐增鲜的产品方案安琪酵母研究的主要是酵母抽提物(YeastExtract,YE)(www.e993.com)2024年9月19日。酵母抽提物是一种天然食品鲜味配料,具有天然的食品属性。安琪专注于自然醇厚和鲜味升级,和味精及添加剂显著不同。因为酵母抽提物的生产工艺和流程非常清晰且温和,从蛋白质中提取或降解出鲜味物质,这个过程完全基于生物发酵和提取,没有化学反应...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
日前,QuantaMagazine科学作家YaseminSaplakoglu在一篇长文中详细介绍了蛋白质折叠问题的历史——从早期实验学家使用X射线晶体学解析蛋白质结构,到计算生物学家尝试通过算法预测结构,再到AlphaFold的出现及其带来的颠覆性影响。同时,她也探讨了人工智能在蛋白质科学领域的突破性进展,特别是AlphaFold如何改变蛋...
专访腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组...
论文二中的scPROTEIN框架,针对单细胞蛋白组数据的特殊性提出了解决方案,能够处理数据中的不确定性、缺失值、批次效应和噪声问题。为基于单细胞蛋白质组的肿瘤发生发展机制研究、药物靶点发现和肿瘤早筛和微环境研究提供重要的AI辅助作用。第三篇论文中提出的scpDeconv方法,是一种全新的反卷积方法,能够从“组织...
Nature(IF=64.8)|北大核药设计重磅成果!可增强放射性核素治疗
因此,开发一种有选择性地将放射性药物固定在肿瘤靶蛋白上的靶向结扎策略,将是一种理想的解决方案。(Fig.2)Fig.2 2024年5月22日,北京大学/昌平实验室的刘志博教授团队,在《Nature》上发表了一篇关于核药物设计的文章,这是《Nature》近50年来发布的首篇放射性核素治疗领域的论文。(Fig.1)研究意义...
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
蛋白质设计中很重要的一部分为酶工程,在食品、轻工业、医药等多个领域得到了重要应用。使用AI进行蛋白质设计或优化,可以获得性能更好的工业酶,2023年,合成生物公司Arzeda成功利用人工智能平台研发出一种酶,能够提高将甜菊提取物转化为高纯度且更昂贵的甜味剂的效率。