中国科学家建立了新的蛋白质从头设计方法
SCUBA采用一种新的统计学习策略,基于核密度估计(或近邻计数,NC)和神经网络拟合(NN)方法,从原始结构数据中得到神经网络形式的解析能量函数,能够高保真地反应实际蛋白质结构中不同结构变量间的高维相关关系,在不确定序列的前提下,连续、广泛地搜索主链结构空间,自动产生“高可设计性”主链。理论计算和实验证明,用SCUBA...
Nature Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查...
独立验证筛查靶蛋白:图2d展示了对选定筛查靶蛋白的独立验证结果。通过流式细胞术检测GFP强度,结果显示所有测试候选蛋白质,包括先前未与相应生物过程相关联的靶蛋白,均能够在招募实验中验证其功能。例如:骨架蛋白Pxn或未表征蛋白1700102P08Rik的招募足以强烈激活转录。E3泛素连接酶Trim8和未表征蛋白Msantd3的招募则足以抑...
...Res:我国学者开发零样本突变效应预测模型,高效指导蛋白质设计...
在此基础上,研究团队开发了一种不依赖多序列比对(MSA-free)和现有实验数据(零样本)的突变效应预测方法——ProMEP(ProteinMutationalEffectPredictor),同时利用蛋白质序列和结构上下文精确预测氨基酸突变效应,预测速度比现有最优方法AlphaMissense快2-3个数量级,并在实际指导蛋白质设计改造方面展现了巨大的应用潜力!相...
...团队合作开发零样本突变效应预测新方法,高效指导蛋白质设计改造
随着各类蛋白质多样化改造需求不断增加,ProMEP零样本且MSA-free的特性尤为重要,有望显著降低蛋白质设计改造难度和实验成本,为生物学家快速研制高性能酶分子提供有利手段。
AI for Engineering:大模型实现多款高难度蛋白质产品产业化落地
Pro系列打造了“AI自动设计+少量实验验证”的蛋白质设计新范式,解决了传统“专家经验&大量试错”范式下,蛋白质设计时间长、成本高、阳性率低以及多指标优化难度大等核心问题,在提升企业产品性能、缩短研发周期、降低生产成本以及建立高壁垒专利布局方面发挥了显著作用。
人工智能解密遗传密码?这家公司用生成式AI设计蛋白质 |CyberDaily
AI可以提高办公效率,也可以设计蛋白质,预测蛋白遗传密码Cradle是一家利用生成式人工智能帮助更高效地设计蛋白质的初创公司(www.e993.com)2024年7月23日。该初创公司使用自然语言处理技术,该技术使科学家能够预测蛋白质遗传密码的哪些特定部分需要改变,以便蛋白质在改变后可以发挥更大的功能和稳定性。它还利用其湿实验室生成的专有数据以及数十亿...
科学家设计蛋白质聚集新方法,用二硫键还原剂来解折叠蛋白质,可...
因为实验器皿洗不干净,他以此为灵感造出一种蛋白质基水下胶水;因为吃火锅弄脏了T恤,他又以此为灵感造出一种无需洗衣粉的蛋白质涂层。十多年来,蛋白质类淀粉样涂层,一直是陕西师范大学教授的主攻方向。蛋白质,是生物体内至关重要的组成部分,它在各种生命活动中起着至关重要的作用。蛋白质聚集体(如膜),则...
这家融资7亿美元的AI制药公司发表Nature论文,推出生成式AI蛋白质...
该研究开发的生成式人工智能模型Chroma,能够在外部约束条件下从头设计蛋白质,这些约束条件涉及对称性、亚结构、形状,甚至自然语言提示。研究团队对310个由Chroma生成的蛋白质进行了实验表征,结果显示,这些生成的、自然界不存在的蛋白质可以表达、折叠,并具有良好的生物物理特性。
分子之心AI蛋白质生成大模型:仅用3天设计性能更优的蛋白疫苗
全球首个融合自然语言的AI蛋白质生成大模型NewOrigin(达尔文)许锦波展示了NewOrigin大模型在药物设计领域的应用效果。提升蛋白疫苗稳定性是提升蛋白质疫苗效果的重要途径之一。传统实验室方法通常使用饱和突变形成数千种、甚至数万种变体,从中筛选出符合需求的目标蛋白质,该过程耗费数月甚至数年,需要数百万成本。使用...
「天鹜科技」获数千万元Pre-A轮融资,成功交付多款AI设计蛋白质|36...
训练后的AI通用大模型与ChatGPT相似,能够解决多行业的专业问题;再加上少量实验,有望取代传统的蛋白质改造模式,提高蛋白质设计的效率,降低成本。”刘灏对36氪表示。正因为产业界关注核心是蛋白质的功能,而非处于中间位置的蛋白质结构,且当前高精度的蛋白质结构数据较为稀缺,因此天鹜科技团队选择开发能够实现从“...