北京大学团队在全原子蛋白质序列设计中取得新进展

该工作首先选择了两个典型的蛋白质折叠骨架对GeoSeqBuilder生成的序列进行实验验证,包括天然硫氧还原蛋白(1FB0)和通过幻想模型人工设计的螺旋束骨架(0705)。作者分别为其设计了9条和6条序列,这些序列均可以在大肠杆菌中以可溶形式表达。对硫氧还原蛋白重新设计的序列具有很高的热稳定性,热变性温度较野生型蛋白提高了40...

使用祖先序列重建设计高功能热稳定蛋白

现有数据库中大多数II类KARI序列来自真细菌(特别是变形菌门和拟杆菌门),而来自疣微菌门、纤维杆菌门和螺旋体门的序列较少,因此我们推测了这些类群的共同祖先(图5a)。从该分析中选择的祖先II类KARI通过差示扫描荧光法测得的熔解温度(Tm)为59??°C,而大肠杆菌和水稻中现存的II类KARI的熔解温度分别为42–44??...

马普所华人科学家设计全新人工固碳途径并模块化整合进大肠杆菌

马克斯·普朗克陆地微生物研究所教授TobiasErb补充道,“在大肠杆菌中实现这种循环的模块化为未来在细胞工厂中实现更复杂的新CO??固定途径铺平了道路,目前我们正在探索完全重编程细胞代谢,为细胞构建一个合成自养操作系统。”

两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命

两篇论文都细致入微地描述了其中的实验流程,它们最大的特点是使用了精心构思的对照实验,这使作者们能够排除其他可能的解释,让自己的结论无可辩驳。第一篇论文比较偏重技术,描述了大肠杆菌无细胞提取物中进行的蛋白质合成的特点,复述并扩充了这一年早些时候发表的结果。重要的是,马特伊是这篇阅读量注定较少的论文(...

...周钢AFM:基于液态金属镓纳米结构设计的微针贴片用于治疗多重耐...

红外热成像及热电偶实验数据表明设计制备的核-卫星纳米粒子具有优异的光热转换性能和良好的光热稳定性能。作者使用平板计数法对纳米粒子的抗菌性能进行评估。修饰后纳米粒子对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌两种典型细菌均具有显著的抗菌效果,在施加近红外激光辐照后,抗菌效果得到进一步大幅度提升,并通过扫描电镜观察到其细菌膜...

马普所科学家利用合成生物学重新构建光合作用,设计人工固碳途径

我们还计划将大肠杆菌改造成依赖人工??CO2固定途径生长的的自养型细胞工厂,利用??CO2生产多种有用化学品(www.e993.com)2024年11月17日。“此外,我们做的研究常常被酶工程改造的能力所限制,我希望未来我们能够自由高效地设计酶、改造酶。”

科学家解析大肠杆菌关键酶代谢纤维结构,助力治疗细菌病原体疾病

此外，课题组还获得了具有共价结合的DON、大肠杆菌胞苷三磷酸、还原型辅酶Ⅰ的大肠杆菌胞苷三磷酸合成酶的冷冻电镜结构。在应用前景上：未来，可以针对原核生物进行广谱性的抑制，由于不会对真核生物产生影响，因此可以设计新的抗生素。此外，目前他们已经生成高分辨结构图，因此可以针对特别物种进行激活或抑制。同时...

要选药品研发的离心“搭子”?TA带着实验结果来了~

实验1离心参数大肠杆菌,7min,9433g(7500rpm),4℃测试结果可以在设置的离心参数下有效分离大肠杆菌,上清液澄清,离心沉淀紧凑贴于侧壁,易于倾倒。细胞总蛋白分离提取实验2离心参数HEK293细胞3.7ml,密度1×10^6个/ml;14000g,5min,4℃,升9档降9档...

Manta资讯丨设计改造羧酸还原酶合成医药中间体(S)-2-氨基丁醇

检测结果显示中间产物积累较多[图5(a)]，推测可能是因为大肠杆菌内源醇脱氢酶(Alcoholdehydrogenase,ADH)还原力不足。据此，利用实验室现有的ADH酶库(共包含90种不同物种来源ADH)，以5mmol/l的中间产物N-Boc-1b为底物筛选合适的ADH，最终选取转化率最高(57%)的荧光假单抱菌(Pseudomonasfluorescens)来源醇脱氢...

【关注】万字长文!一文了解合成生物学

元件工程:人工智能技术可改善生物元件的鉴定和功能注释效率,加快天然生物元件优化速度,为人类从头设计基因原件、蛋白质元件提供可能。例:利用生成对抗网络设计功能蛋白序列、在大肠杆菌中设计启动子。基因线路:基因线路通常需要进行多次、长时间的调试才能正常运行,且无法确定其稳定性和对底盘细胞的其他影响。而计算机仿真策...