AI面临的五个蛋白质设计问题,Nature找了一群专家来讨论

蛋白质-蛋白质结合算法之所以成功,是因为它们的语言很简单:所有天然蛋白质都由相同的20种氨基酸组成。马萨诸塞州萨默维尔的GenerateBiomedicines公司使用AI设计疗法,其计算机科学家JohnIngraham表示,PDB中有数十万种结构和蛋白质-蛋白质相互作用,「这就像是机器学习的理想情况」。科学家们一直在研究...

科学家开发非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用

01浙江大学杨兵研究员实验室成功开发了可富集的非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用。02该团队克服了高效大量制备探针化合物eFSY的难题,筛选出了能够识别eFSY的氨酰-tRNA合酶。03除此之外,研究人员开发了非天然氨基酸交联鉴定软件AixUaa,提高了交联肽段的鉴定率和准确性。04该技术有望用于鉴...

因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质

最右边的蛋白(朊蛋白)跟疯牛病有关系,这里显示了朊蛋白两种不同构型,左边的构型是正常的折叠状态,右边的是不正常的折叠状态。如果朊蛋白的折叠是右边这个形状的话,就会引起疯牛病。所以,蛋白质结构是个非常重要的问题。蛋白质由很多氨基酸通过化学键串在一起。这里我用一些小球去表示这些氨基酸,每种颜色的小球表示...

诺贝尔化学奖颁给DeepMind,AI是如何终结蛋白质研究的?

??20世纪50年代,生物化学家ChristianAnfinsen进行的实验表明,氨基酸串内部含有一种内在的代码,指示它如何折叠成蛋白质——并且应该有一种方法可以从这一代码中预测蛋白质的结构。这个假设被称为安芬森教条(Anfinsen’sdogma)。图源:PBHImages/Alamy早在20世纪30年代,科学家们就开始探究这个问题。但真正取得突破要...

【科普营养】蛋白质:吃多少、怎样算?

蛋白质是一种重要的营养素,提到“减肥”,很多周围的人首先想到的建议就是多吃蛋白质,而同时,蛋白质也是肌肉组织的重要组成部分,所以提到“增肌”,大家最先想到的仍然是“多吃蛋白质”。所以很多追求健康的人会有一种“蛋白质多多益善”的看法。这就涉及到2个问题:...

诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI

左侧是一个环形排列,显示了20种基本氨基酸(AminoAcids)的名称:包括甘氨酸(Glycine);谷氨酸(Glutamicacid);谷氨酰胺(Glutamine);半胱氨酸(Cysteine);天冬氨酸(Asparticacid);等等...右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条...

2024诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质奥秘”

构建全新蛋白质的领域被称为从头设计(denovodesign)。研究小组绘制了一种具有全新结构的蛋白质,然后让Rosetta计算哪种氨基酸序列可以生成所需的蛋白质。为此,Rosetta搜索了所有已知蛋白质结构的数据库,并寻找与所需结构相似的蛋白质短片段。利用蛋白质能量分布的基础知识,Rosetta对这些片段进行了优化,并提出了氨...

普洱茶中主要含有哪些茶叶成分?含量最高的是哪种?

氨基酸是茶叶中颇具影响力的中国一类成分。茶叶中富含的发酵氨基酸包括茶氨酸、茶多肽等,这些成分对兴奋中枢神经系统有一定的由于影响。茶氨酸是一种特有的有什么茶叶成分,具有抑制中枢神经系统的蛋白质功能,可以帮助放松和提高睡眠质量。相对而言,茶多肽则具有刺激中枢神经系统的今天作用,可以提神和增强注意力。

了解一下身体蛋白质的基本构件:氨基酸

哪些食物含有丰富氨基酸?必需氨基酸存在于许多不同的食物中。氨基酸的最佳来源是动物蛋白,如牛肉、家禽和鸡蛋。动物蛋白是最容易被你的身体吸收和利用。含有全部九种必需氨基酸的食物被称为完全蛋白质。这些食物包括牛肉、家禽、鱼、鸡蛋、乳制品、大豆、藜麦和荞麦。

哈佛大学新研究表扬,这种蛋白质最延寿

大豆,包括黄豆和黑豆的支链氨基酸含量,比鸡胸肉、牛里脊、猪肝等动物蛋白还要高。并且,豆类是植物蛋白中吸收利用率最高的,也是植物蛋白中唯一的优质蛋白。因此,增肌补充蛋白质,大豆必不可少。优质植物蛋白清单,请收好!植物蛋白食物种类不少,哪种更优质呢?中国农业大学食品科学与营养工程学院副教授彭星云2023年7...