多肽、抗体、寡核苷酸等大分子量药物的hERG抑制风险如何?
多种电压门控离子通道(Kv1.2,Kv3.1,Eag1,Nav1.5,Cav2.1/2,TRPC1,TRPC5,TRPM3,TRPV1)在S5和S6之间均包括一条长的胞外区环状结构。有研究显示,这一区域正是抗体结合并抑制电流的关键表位。比如某些患者出现抗Ro抗体阳性很可能意味着患有自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮,这类患者可能出现复极异常(Q...
AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过...
尽管病毒与人类健康密切相关,但人类已知已确认的病毒种类仅有5,000余种,可谓是冰山一角。传统RNA病毒鉴定方法高度依赖序列同源性比对,即通过比较未知病毒与已知病毒的序列相似性来进行识别。但是,由于RNA病毒种类繁多且高度分化,传统方法难以捕捉缺乏同源性或同源性极低的「暗物质病毒」,这限制了新病毒发现的...
科学智能又一重要成果:中澳科学家用AI发现超过16万种新病毒
RNA病毒都有一个称为“RdRp”的核心蛋白，即病毒RNA复制酶。上述研究根据一个全新的深度学习模型“LucaProt”，基于Transformer框架（构建GPT等主流AI大模型的基础框架），通过向其输入蛋白质序列预测。训练好的模型可以用来识别病毒RdRp，并用它在大量基因组数据中查找这些未知病毒的类似蛋白序列。值得一提的是，该AI...
AI发现超16万种RNA病毒,中山大学、阿里云联合研究成果在国际顶刊...
病毒与人类的健康密切相关，但人类已知已确认的病毒种类仅有5000余种，这只是病毒世界的冰山一角。传统RNA病毒鉴定方法高度依赖于序列同源性比对，即通过比较未知病毒与已知病毒的序列相似性来进行识别。然而，RNA病毒种类繁多且高度分化，传统方法难以捕捉缺乏同源性或同源性极低的“暗物质病毒”，新病毒发现的效率较低。
《细胞》:AI再次改变生物学研究!发现7万种全新病毒,新工具揭秘...
01中山大学医学院、阿里云与悉尼大学的研究团队利用深度学习算法LucaProt,发现了超过16万种RNA病毒,包括7万种首次发现的新病毒。02该研究揭示了前所未有的病毒多样性,大幅拓展了对病毒圈的认知,为记录全球RNA病毒组提供了全新的工具。03为此,研究团队采用了transformer架构,该架构能有效地适应不同长度的序列,并捕获...
要报|我国科学家利用AI发现超16万种RNA病毒!
利用这套算法,团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群,大幅扩展了全球RNA病毒的多样性(www.e993.com)2024年11月14日。其中,23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这种...
中国校企联手发CELL,借AI发现超16万种全新RNA病毒—新闻—科学网
病毒与人类的健康密切相关,但人类已知已确认的病毒种类仅有5000余种,这只是病毒世界的冰山一角。传统RNA病毒鉴定方法高度依赖于序列同源性比对,即通过比较未知病毒与已知病毒的序列相似性来进行识别。然而,RNA病毒种类繁多且高度分化,传统方法难以捕捉缺乏同源性或同源性极低的“暗物质病毒”,新病毒发现的效率较低。
CRISPR干预的CHO细胞系开发方法
Cas13核酸酶包含两种不同的核糖核酸酶活性,一种用于前crRNA处理,另一种用于顺式或反式RNA目标切割。在VI型中,观察到Cas13对3'端原间隔序列旁的第一个核苷酸的某些核苷酸有严格的偏好,例如A、U或C(H),而不是Lsh-Cas13a的G。这种被称为“原间隔序列侧翼序列”(PFS)而不是PAM的偏好,也已在其他Cas13酶中...
追问daily | 剧烈运动可短期内提高执行功能;利用AI发现16万种新...
指南包括五个关键因素:幅度(magnitude)、准确性(accuracy)、普遍性(generalizability)、膨胀(inflation)和可信度(credibility)。研究指出,许多性别差异研究报告中,差异的描述存在不清楚、不准确的问题。例如,某项关于性别差异的大脑连接模式研究中,仅0.5%的差异具有统计显著性,但研究却可能给人一种性别差异广泛存在的印象...
Nat Methods | 克服PCR扩增误差:利用同源三聚体核苷酸提高测序...
该研究通过采用同源三聚体核苷酸块设计的独特分子标识符(UMI),显著提高了PCR扩增过程中序列分析的准确性。这一创新设计不仅减少了PCR扩增错误,还优化了错误校正流程,为高通量测序数据分析提供了更高的可靠性。此外,研究的成果在理论上和实践上均具有重要意义,为精确生物学研究和临床应用提供了强有力的技术支持,尤其是...